Tuynhiên ,về chất lượng gạo nói chung vẫn chưa được cải thiện rõ rệt .Để đánh giá về chấtlượng dinh dưỡng của lúa gạo có rất nhiều chỉ tiêu khác nhau, một trong những chỉ tiêuquan trọng
Trang 1TRƯỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC TỰ NHIÊN
-NGUYỄN THỊ THU HƯƠNG
NGHIÊN CỨU DI TRUYỀN
HÀM LƯỢNG PROTEIN CAO Ở LÚA
LUẬN VĂN THẠC SĨ KHOA HỌC
Hà Nội – 2011
Trang 2TRƯỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC TỰ NHIÊN
-NGUYỄN THỊ THU HƯƠNG
NGHIÊN CỨU DI TRUYỀN
HÀM LƯỢNG PROTEIN CAO Ở LÚA
Chuyên ngành: Di truyền học
Mã số:
LUẬN VĂN THẠC SĨ KHOA HỌC
NGƯỜI HƯỚNG DẪN KHOA HỌC: TS LÃ TUẤN NGHĨA
Hà Nội - 2011
Trang 3CHƯƠNG 1 TỔNG QUAN TÀI LỆU
1.1 Chất lượng lúa gạo và thị trường lúa gạo
1.1.1 Phẩm chất xay chà
1.1.2 Phẩm chất cơm
1.1.3 Lúa gạo là thực phẩm của toàn cầu
1.1.4 Các loại lúa gạo trên thị trường
1.2 Chất lượng dinh dưỡng của lúa gạo
1.2.1 Hàm lượng Protein trong lúa gạo
1.2.2 Ảnh hưởng của yếu tố giống đến hàm lượng Protein
1.2.3 Ảnh hưởng của phân bón đến hàm lượng Protein
1.2.4 Ảnh hưởng của các điều kiện ngoại cảnh đến đời sống cây lúa
1.3 Nghiên cứu di truyền số lượng liên quan đến hàm lượng Protein trong hạt lúa1.3.1 Gen qui định hàm lượng Protein ở lúa
1.3.2 Hiệu quả gen qui định tính trạng hàm lượng Protein ở lúa
1.3.3 Tính trạng GPC ( Grain Protein Conten) ở lúa
1.4 Chỉ thị phân tử và ứng dụng trong nghiên cứu về di truyền hàm lượngProtein ở lúa
Trang 41.4.2.3 Bản đồ di truyền hàm lượng protein
1.4.2.4 Bản đồ di truyền tính trạng mùi thơm
1.5.Một số kết quả nghiên cứu về di truyền hàm lượng protein
CHƯƠNG 2: VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU
2.1 Vật liệu nghiên cứu
2.2 Phương pháp nghiên cứu
2.2.1 Xác định hàm lượng Protein và thành phần các acid amine trong hạt gạo2.2.2 Đánh giá sự liện quan ở mức độ phân tử giữa bố, mẹ và con lai
2.2.3 Phương pháp nghiên cứu di truyền số lượng liên quan đến hàm lượngProtein ở lúa
CHƯƠNG 3 KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU VÀ THẢO LUẬN
3.1 Acid amine trong Protein của bố mẹ và con lai
3.2 Sự liên quan di truyền ở mức độ phân tử giữa bố, mẹ và con lai
3.3 Nghiên cứu di truyền số lượng liên quan đến hàm lượng Protein cao ở lúa3.3.1 Phân tích hiệu quả gen tham gia qui định hàm lượng Protein ở lúa
3.3.2 Phân tích các tham số di truyền tính trạng GPC
3.3.3 Các kiểu tác động của gen lên hàm lượng Protein trong hạt lúa
3 4 Tương quan giữa một số biểu hiện hình thái với hàm lượng Protein ở hạt lúa3.5 Tương quan giữa một số tính trạng chất lượng khác với hàm lượng Protein ở
hạt lúa3.6 Xác định chỉ số chọn lọc trong chọn tạo giống lúa có hàm lương Protein caoKẾT LUẬN VÀ ĐỀ NGHỊ
TÀI LIỆU THAM KHẢO
A Tài liệu Tiếng Việt
B Tài liệu Tiếng Anh
Trang 5DANH MỤC HÌNH ẢNH, BẢNG BIỂU Hình
2 1 Hình ảnh nhận dạng ADN bằng mồi SSR.
2.2 Cấu trúc hình cây thể hiện tương đồng di truyền giữa các giống lúa
3.1 Hình ảnh ADN của bố mẹ và các con lai sử dụng chỉ thị SSR(locus RM 5625)
3.2 Hình ảnh ADN của cây bố mẹ và các con lai sử dụng chỉ thị SSR (locus
2.2 Môṭsốđăcc̣ tinh ́ nông hocc̣ của các giống lúa sưử dungc̣ trong nghiên cứu
2 3 Hệ số tương đồng di truyền giữa các giống lúa bố mẹ
2 4 Các tổ hợp lai giữa các giống lúa sử dụng trong nghiên cứu
3.1 Thành phần và hàm lượng acid amine trong protein của giống bố, mẹ
và hạt F2 (% so với protein)
3.2 Ma trận tương đồng của các giống lúa đem phân tích khi sử dụng SSR
3.3 Hàm lượng protein và sự biến động qua các thế hệ của các tố hợp lai
3.4 Mức độ trội của gen qui định hàm lượng Protein cao ở các giống lúa
3.5 Phương sai thành phần của quần thể bố, mẹ và F2
3.6 Phương sai chung của quần thể bố, mẹ và F2
3.7 Phân tích phương sai một nhân tố
3.8 Phương sai hai nhân tố ( chiều cao cây, thời gian sinh trưởng)
ảnh hưởng tới hàm lượng Protein
3.9 Bảng phân tích phương sai ba nhân tố (chiều cao, thời gian sinh
trưởng, trọng lương 1000 hạt) ảnh hưởng tới hàm lượng Protein
3.10 Hàm lượng Protein và sự biến động di truyền trên các thế hệ
3.11 Thiết lập hệ số di truyền trên các tổ hợp lai
3.12 Một vài tính trạng nông học của các cây lúa F2 và bố, mẹ
3537394051
5256585960626364
666770
Trang 63.13 Hệ số tương quan giữa Protein và một vài đặc điểm hình thái
3.14 Hàm lượng Protein tổng số của một vài dòng/giống lúa đang nghiên cứu3.15 Hệ số tương quan giữa hàm lượng Protein và Amylose tổng số của bố, mẹ3.16 Hệ số tương quan giữa hàm lượng Protein và Amylose tổng số của con lai F1
3.17 Hệ số tương quan giữa hàm lượng Protein và Amylose tổng số của
con lai F2
3.18 Hệ số tương quan giữa hàm lượng Protein và Amylose tổng số của
con lai BC1 F1
3.19 Tiêu chuẩn chọn lọc, tính trạng của các giống tham gia thí nghiệm
3.20 Tiêu chuẩn chọn lọc, tính trạng của các giống tham gia thí nghiệm
3.21.Chỉ số chọn lọc các giống phù hợp với mục tiêu chọn lọc
3.22 Chỉ số chọn lọc các giống phù hợp với mục tiêu chọn lọc
Trang 8ĐẶT VẤ
N ĐỀ
Tính cấp thiết và ý nghĩa của đề tài:
Lúa gạo là loại cây lương thực quan trọng trên thế giới nói chung và Việt Nam nóiriêng Lúa gạo được trồng rộng khắp ở 112 nước trên thế giới; là nguồn cung cấplương thực chủ yếu của hơn 54% dân số thế giới (Nguyễn Minh Công và cs., 2004) Ởmột số nước như Ấn Độ, Trung Quốc, Indonesia, Nhật Bản, Việt Nam, lúa gạo làcây lương thực chính
Về mặt diện tích gieo trồng, lúa gạo là cây lương thực có diện tích lớn thứ hai đứngsau lúa mì; Về sản lượng hàng năm, lúa gạo đứng thứ ba sau lúa mì và ngô (NguyễnMinh Công và cs., 2004) Về giá trị kinh tế, lúa gạo là nguồn thu nhập chính của nôngdân nhiều nơi trên thế giới và là một trong những mặt hàng xuất khẩu quan trọng củamột số quốc gia trong đó có Việt Nam (hàng năm Việt Nam xuất khẩu khoảng 4,5 triệutấn gạo sang các thị trường khác nhau trên thế giới) Vì vậy việc đầu tư nghiên cứunhằm nâng cao năng suất,chất lượng lúa gạo tại Việt Nam luôn được Chính phủ quantâm,đặc biệt là chất lượng gạo xuất khẩu luôn là vấn đề thách thức đối với các nhàchọn giống trong nhiều năm qua
Ở Việt Nam trong những năm gần đây,việc chọn tạo giống lúa đã được đẩy mạnh, nhiềugiống lúa mới năng suất, chất lượng đã được tạo ra và chuyển giao vào sản xuất Tuynhiên ,về chất lượng gạo nói chung vẫn chưa được cải thiện rõ rệt .Để đánh giá về chấtlượng dinh dưỡng của lúa gạo có rất nhiều chỉ tiêu khác nhau, một trong những chỉ tiêuquan trọng là hàm lượng Protein trong hạt gạo Protein lànguồn cung cấp dinh dưỡngvànăng lươngc̣ chủ yếu hàng ngày ; Là một trong những loại hợp chất hữu cơ rất
quan trọng vàkhông thể thiếu đối với mỗi cơ thể sống ; nó cung cấp từ 10 đến 15%năng lượng sống giúp cơ thể sinh trưởng và phát triển tốt Theo tính toán, đối với một
cơ thể trưởng thành là nam giới lượng protein thiết yếu mỗi ngày cần khoảng 55,5g vàphụ nữ là 45g So với những loại cây trồng khác nuôi sống con người, cây lúa là mộttrong những loại cây trồng có hàm lượng protein thấp hơn cả (6-12%) Ở Việt Nam ,hiện nay cac giống lua đang đươcc̣ trồng va sư dungc̣ phổbiến là Khang dân
CR203.v.v lại đều là các giống lúa co ham lươngc̣ protein ở mức khá thấp
chỉ đạt khoảng 7% (các giống được cho là có hàm lượng protein cao có hàm lượng
Trang 9trung bình đạt từ 9 đến 10%) (Vũ Tuyên Hoàng và cs., 2005).Vì vậy việc “Nghiên cứu
di truyền hàm lượng protein cao ở lúa” là việc làm cần thiết góp phần cung cấp
thông tin,cơ sở dữ liệu phục vụ cho việc tuyển chọn vật liệu lai tạo nhằm chọn giốnglúa chất lượng cao phục vụ sản xuất
Mục tiêu nghiên cứu:
-Phân tích và xác định được sự di truyền hàm lượng protein trong hạt lúa
- Phân tích hiệu quả gen tham gia qui định hàm lượng protein ở lúa.
-Phân tích các tham số di truyền tính trạng GPC ở một số giống lúa đang trồng tại Việt Nam
-Xác định chỉ số chọn lọc trong chọn giống lúa có hàm lượng protein
caonhằm định hướng chọn giống lúa chất lượng gạo tốt phục vụ sản xuất
Nội dung nghiên cứu của đề tài:
Nội dung 1: Phân tích thành phần và hàm lượng acid amin trong protein ở bố mẹ và con lai
Nội dung 2 : Đánh giásư c̣liên quan di truyền ởmức đô c̣phân tưử giưữa bốme c̣vàcon lai Nội dung 3 : Nghiên cứu di truyền sốlươngc̣ liên quan đến hàm lươngc̣ protein cao ởlúa Nội dung 4 : Nghiên cứu tương quan giữa một số biểu hiện hinh thái với hàm lượng
protein ở hạt lúa
Nội dung 5 : Nghiên cứu tương quan giưữa môṭsốtinh́ trangc̣ chất lươngc̣ khác với hàm
lươngc̣ protein ở hạt lúa
Nội dung 6 : Xác định chỉ số chọn lọc trong chọn giống lúa có hàm lượng protein cao Phạm vi nghiên cứu
Nghiên cứu 7 giống lúa:Khang dân 18, Q5, P1, P4, P6, P290, AC5 và các quần thể conlai F1, F2, BC
Thời gian nghiên cứu: 1 năm
Trang 10Chương 1 TỔNG QUAN TÀI LIỆU 1.1 CHẤT LƯỢNG LÚA GẠO VÀ THỊ TRƯỜNG LÚA GẠO
Lúa gạo (Oryza sativa L.) là lương thực quan trọng trong bữa ăn hàng ngày của
nhiều dân tộc trên thế giới Ở Châu Á, lúa gạo là nguồn cung cấp calor chủ yếu, đónggóp 56,2% năng lượng và 42,9% lượng protein hàng ngày của cơ thể sống Đối vớingười nghèo, lúa gạo còn đặc biệt quan trọng khi 70% năng lượng và lượng proteincủa cơ thể hàng ngày lấy từ những bữa ăn (Flinn và cs., 1985)
Chất lượng lúa gạo là một khái niệm quan trọng và còn gây nhiều tranh cãi vềnội dung và các tiêu chuẩn đánh giá cụ thể Do khái niệm về chất lượng liên quan đếnrất nhiều yếu tố: độ ẩm, độ trong của hạt, tỷ lệ gạo gẫy, hình dạng hạt, chiều dài hạt,chiều rộng hạt, Mỗi quốc gia khác nhau lại có những tiêu chuẩn đánh giá và hệ thốngkiểm tra chất lượng riêng biệt và hệ thống đánh giá Các tiêu chuẩn đánh giá nàythường không thống nhất giữa các quốc gia (Vũ Tuyên Hoàng và cs., 2005)
Tuy nhiên, tùy theo truyền thống ẩm thực và thu nhập của các quốc gia, bộ phậndân cư khác nhau mà yêu cầu về chất lượng lúa gạo cũng rất khác nhau (Vũ TuyênHoàng và cs., 2005)
Theo các nghiên cứu của Kaosa và Juliano (1990) cho thấy: tại thị trường HồngKông các loại gạo hạt dài, tỉ lệ gạo nguyên cao, cơm mềm luôn được bán với giá cao
Tại Rome (Italia) các loại gạo Japonica lại được ưa chuộng Trái lại các khách hàng ở
khu vực Tây Á lại ưa chuộng gạo đục và cứng cơm Người Nhật Bản lại ưa chuộnghạt gạo tròn, mềm ướt, thật trắng và không có mùi thơm; người Thái Lan lại thích hạtgạo dài và cơm khô
Những nơi mà gạo đóng vai trò là nguồn lương thực thứ yếu như Châu Âu, thìnhu cầu lại chủ yếu là những loại gạo có chất lượng cao: gạo 5-10% tấm được tiêu thụ
ở Tây Âu, gạo 10-13% tấm được tiêu thụ nhiều ở các nước Đông Âu
Các loại gạo hạt dài, chất lượng trung bình chủ yếu được xuất khẩu từ các nướcThái Lan, Miến Điện, Trung Quốc và Việt Nam; loại gạo này thường có tỷ lệ tấm từ
Trang 1120-25% Các và thị trường chủ yếu loại gạo này thường là Indonesia, Malaysia, Đông
Âu, Trung Đông và Tây Phi,
Các loại gạo thơm, do có hương vị đặc biệt nên thường có giá trị rất cao Đây
là loại gạo rất được ưa chuộng trên các thị trường như: Nam Á, Trung Đông và TháiLan Một số loại gạo thơm nổi tiếng trên thị trường thế giới như Basmati (Ấn Độ);KhaoDawh Mali, Jasmine 85 (của Thái Lan) luôn có giá trị cao gấp hai lần so với cácloại gạo khác
Hàng năm, thị trường gạo toàn cầu tiêu thụ khoảng 23 triệu tấn gạo, trong đócác quốc gia Châu Á nhập khẩu nhiều nhất (chiếm 49% tổng nhập khẩu của toàn thếgiới) đặc biệt là Philipines và Indonesia (FAO, 2005)
Hiện nay, nước ta đã và đang xuất khẩu gạo sang trên 85 quốc gia khác nhau trênthế giới, trong đó khu vực Châu Á và Châu Mỹ là hai thị trường chủ yếu Là một “cườngquốc” về xuất khẩu gạo Tuy nhiên, chất lượng gạo của Việt Nam lại rất kém về: độ bạcbụng, dài trung bình, hương vị kém, Nguyên nhân chính của tình trạng này là do ViệtNam chưa tìm và đưa vào sản xuất được những giống lúa có chất lượng cao đáp ứngđược các tiêu chuẩn khắt khe của thị trường Trong khi đó, xu hướng về yêu cầu gạophẩm chất cao trên thị trường Châu Á và Châu Mỹ ngày càng tăng lên
Hiện nay, ở nước ta cùng với nhiều giống lúa đặc sản truyền thống các giống cóphẩm chất cao cũng đã và đang được nhập nội và lai tạo mới đang dần đáp ứng đượcnhu cầu thị trường xuất khẩu và nâng cao giá trị hàng hóa của cây lúa, tăng thu nhậpcho nông dân trồng lúa như P6, P4, P209, (Vũ Tuyên Hoàng và cs., 199; 2000; LãTuấn Nghĩa và cs., 2010; )
Chất lượng gạo là một trong bốn mục tiêu mà công tác cải tạo giống đặt ra(Năng suất, chất lượng, chống chịu và thích ứng với điều kiện bất thuận) Chất lượngcủa lúa gạo được đánh giá thông qua các chỉ tiêu: màu sắc vỏ hạt, kích thước hạt, hìnhdạng hạt, tỷ lệ gạo xát, tỷ lệ gạo nguyên hạt, độ đồng đều của hạt, tỷ lệ hạt bạc bụng,chất thử nếm và đặc điểm trong quá trình chế biến (Vũ Tuyên Hoàng và cs., 2005)
Trang 121.1.1 Phẩm chất xay chà
Phẩm chất xay chà bao gồm tỉ lệ gạo nguyên, gạo lứt và gạo trắng Theo một sốnghiên cứu, mùa vụ có ảnh hưởng rất lớn đến tỉ lệ xay chà (vụ Đông Xuân tỉ lệ xaychà tốt và cao hơn vụ Hè Thu), ngoài ra tỉ lệ xay chà còn chịu sự tác động rất lớn từcông nghệ sau thu hoạch
Tỉ lệ vỏ trấu có thể thay đổi từ 18-26% và trung bình từ đạt từ 20-22%; cám vàphôi hạt chiếm 8-10%, do đó tỉ lệ gạo trắng thường vào khoảng 70% (Khush và cs., 1979)
Tỉ lệ gạo trắng và gạo lứt ít biến động và nó cũng phụ thuộc vào môi trường(Bùi chí Bửu và cs., 1997) Tỉ lệ gạo nguyên biến động rất lớn và chịu ảnh hưởng rấtmạnh mẽ của môi trường, đặc biệt là nhiệt độ và ẩm độ trong suốt thời gian chín, kéodài đến lúc sau thu hoạch, đặc biệt là điều kiện phơi sấy, bảo quản Sự rạn nứt thường
do nắng, sự thay đổi nhanh của độ ẩm không khí, những điều kiện không thuận lợi củamôi trường trong suốt quá trình chín của hạt, thu hoạch chậm trong mùa khô cũng làmhạt có độ ẩm thấp Theo Bùi Chí Bửu (Bùi Chí Bửu và cs., 1996; 1997) tỉ lệ hạtnguyên đạt cao nhất khi lúa được thu hoạch vào lúc chín 28 đến 30 ngày và thu sớmsau khi lúa trổ 20 ngày; còn thu muộn sau 35 ngày thì tỉ lệ gạo nguyên thấp Sau khithu hoạch xong mà không tuốt ngay, để đống cũng là một trong những nguyên nhândẫn tới làm giảm tỉ lệ hạt gạo nguyên (tỉ lệ hạt ẩm vàng sẽ tăng lên do hô hấp của các
vi sinh vật) Dạng hình hạt gạo cũng là một trong những nguyên nhân ảnh hưởng rấtlớn đến chất lượng xay chà Với những hạt có dạng hình mảnh, dài và độ bạc bụngcàng cao thì tỉ lệ hạt nguyên càng thấp; những hạt đã khô nếu bị hút ẩm đột ngột cũng
có thể tạo ra những vết rạn trong hạt và gây ra các mảnh vỡ nhỏ khi xay
1.1.2 Phẩm chất cơm
Trong các tính trạng về phẩm chất cơm, amylose được xem là tính trạng có ý nghĩaquyết định đến sự mềm cơm và ngược lại Hàm lượng amylose cao có tính trội khônghoàn toàn so với hàm lượng amylose thấp, nó do một gen điều khiển kèm theo một số genphụ có tính chất cải tiến (Seetharaman, 1959; Kahlon, 1965; Kumar và cs., 1986; )
Các yếu tố về hàm lượng amylose cao, độ bền gel cứng và độ trở hồ cao là cácyếu tố chính ảnh hưởng đến chất lượng lúa gạo Trong đó hàm lượng amylose là mộttrong những yếu tố quan trọng nhất
Trang 13Môi trường gây ra sự biến động rất lớn đến hàm lượng amylose trong hạt gạo củacùng một giống lúa, đặc biệt là nhiệt độ trong giai đoạn vào chắc của hạt (Juliano, 1990).
Hàm lượng amylose trong lúa được kiểm soát trực tiếp bởi hoạt động gen cộng (additive
effect: A) và ảnh hưởng tương tác cộng tính (additive interaction effect: AE) Ảnh hưởng
của AE có tính chất rất quan trọng đến hàm lượng amylose của giống lúa.
Các thể đột biến về amylose cũng đã được nghiên cứu trên các giống lúa thuộc
loài phụ Japonica với hai dạng hình 2064 và EM16 tương tác theo kiểu “allelic” Các
thể đột biến này có thể chuyển sang giống lúa Indica nhờ lai với IR36 hai lần Do đógen điều khiển sự co giãn hàm lượng amylose (Amylose extender) được xác định trênnhiễm sắc thể số 2 (Chr 2) (Kaushik and Khush., 1991)
1.1.3 Lúa gạo là thực phẩm của toàn cầu
Theo thống kê của Cơ quan Thực phẩm Liên Hiệp Quốc, trên thế giới có khoảng 147.5triệu ha đất dùng cho việc trồng lúa, và 90% diện tích này là thuộc các nước Á Châu
Các nước Á Châu cũng sản xuất khoảng 92% tổng sản lượng lúa gạo trên thế giới.Sản xuất gạo toàn cầu đã tăng lên từ khoảng 200 triệu tấn vào năm 1960 tới hơn 600triệu tấn vào năm 2007 Ba quốc gia sản xuất lúa gạo hàng đầu là Trung Quốc (31%sản lượng thế giới), Ấn Ðộ (20%) và Indonesia (9%) Ba nước xuất khẩu gạo lớn nhấtthế giới là Thái Lan (26% sản lượng gạo xuất khẩu), Việt Nam (15%) và Hoa Kỳ(11%), trong khi ba nhà nhập khẩu gạo lớn nhất là Indonesia (14%), Bangladesh (4%)
và Brasil (3%) Theo FAO (Food and Agriculture Organisation), hàng năm có khoảng
trên 20 triệu tấn gạo được dùng làm hàng hóa trao đổi trên toàn thế giới
1.1.4 Các loại lúa gạo trên thị trường
Các giống lúa thông thường cũng được phân loại theo cấu trúc, màu sắc vàhình dạng hạt gạo của chúng Ví dụ theo kích thước hạt lúa: Loại hạt lúa dài (có chiềudài gấp 3 lần chiều rộng, chiều dài hạt hơn 6 mm) khi nấu hạt cơm không dính, cũng
có gạo dài mà dính ở Lào, Thái Loại hạt lúa có kích thước trung bình khoảng 5-6mm
và loại gạo ngắn có 4-5mm chiều dài va 2.5mm chiều rộng
Trang 14Về màu sắc có những loại khác nhau như hạt gạo màu nâu, hạt gạo màu trắng,hạt gạo màu đỏ và hạt gạo màu đen.
Một giống lúa thơm của Thái Lan cho loại gạo hạt dài và tương đối ít dính, dogạo hạt dài chứa ít amylopectin hơn so với các giống hạt ngắn Các loại gạo nếp là gạohạt ngắn Gạo Nhật Bản là loại gạo hạt ngắn và dính
Các giống lúa Ấn Ðộ bao gồm gạo hạt dài và gạo thơm Basmati, gạo hạt dài vàtrung bình là gạo Patna và loại gạo hạt ngắn Masoori
Các giống gạo thơm có hương vị thơm đặc biệt; các giống đáng chú ý nhất baogồm các loại Basmati, gạo Patna kể trên cũng như các giống lai từ Mỹ được bán dướitên gọi thương phẩm Texmati Nó là giống lai giữa Basmati và giống gạo hạt dài Hoa
Kỳ Cả Basmati và Texmati có hương vị tương tự như bỏng ngô Tại Indonesia cónhiều các giống gạo đỏ và đen
Hai nước xuất khẩu gạo lớn nhất thế giới là Thái và Việt Nam có các sản phẩmgạo như: Gạo xuất khẩu ở Thái gồm: các loại gạo thơm và gạo trắng hạt dài Việt Namxuất khẩu các loại gạo: gạo 5% tấm đánh bóng 1 lần, gạo 5% tấm đánh bóng 2 lần, gạo10%, 15%, 25% và 100% tấm Ngoài ra có gạo nếp (dẻo, dính) và gạo tẻ, gạo sắt, gạo
đồ, gạo thơm
Ðặc tính mùi thơm ở các loại gạo được tạo thành bởi hàng trăm loại chất thơm
dễ bay hơi như hydrocarbons, alcohols, aldehydes, ketones, acides, phenols, pyridine,2-acetyl-1-prroline
1.2 CHẤT LƯỢNG DINH DƯỠNG CỦA LÚA GẠO
1.2.1 Hàm lượng protein trong lúa gạo
Lúa gạo là một trong những loại ngũ cốc quan trọng nhất thế giới và là nguồnthực phẩm quan trọng trong bữa ăn hàng ngày của nhiều dân tộc trên thế giới, nó cungcấp tới 70% năng lượng (đối với cư dân nghèo của một số nước châu Á) cho sự vậnđộng của con người thông quan bữa ăn hàng ngày (Filn & Unnevehr, 1985)
Hàm lượng protein trong lúa gạo là chỉ tiêu quan trọng để đánh giá chất lượng dinhdưỡng của lúa gạo So với những cây trồng được coi là cây lương thực nuôi sống con người,
Trang 15cây lúa có hàm lượng protein chứa trong hạt ít hơn cả biến động từ 6-12% (Vũ TuyênHoàng và cs., 2005; Nguyễn Thị Lang và cs., 2005; Lã Tuấn Nghĩa và cs., 2010; ).
Protein trong gạo gồm các tiểu phần chính như: albumine, glubuline, probaline
và gluteline, trong đó gluteline chiếm tới 93,7% Các acid amine tự do trong proteinđược phân phối như sau: trong cám và bột 30%, trong phôi 53%, trong gạo xát 17%(Moryzzivà cs, 1964);
Trong thời gian qua, các nhà chọn tạo giống đã và đang tập trung vào việc duytrì chất lượng đạm, việc cải tiến về chất lượng đạm vẫn chưa được quan tâm đúngmức (Vũ Tuyên Hoàng và cs., 2005) Chất lượng ding dưỡng của các giống lúa cóhàm lượng đạm cao sẽ cao hơn so với các giống lúa có hàm lượng đạm thấp vì nóchứa một lượng acid amine thay thế lớn hơn tất cả (Blaekwellvà cs., 1966)
Hàm lượng protein không chỉ ảnh hưởng đến giá trị dinh dưỡng của lúa màcòn liên quan đến khả năng tiêu thụ protein và sức khỏe của con người Theo thống kêđầy đủ thì bữa ăn hàng ngày của người dân Trung Quốc lượng protein tiêu thụ là67gram, thấp hơn nhiều so với mức trung bình 100 gram ở các nước đang phát triển(http://wwww.agriviet.com/nd/1483-lai-tao-thanh-cong-giong-lua-co-ham luong.httm)
Vì thế, lai tạo ra các giống lúa có hàm lượng protein cao là rất quan trọng choviệc cải thiện sức khỏe người dân Sự việc này luôn được quan tâm theo sau khoa học
và kỹ thuật ở trong nước cũng như quốc tế
1.2.2 Ảnh hưởng của yếu tố giống đến hàm lượng protein
Giống là một trong những yếu tố quyết định đến phẩm chất hạt gạo Nhiều kếtquả nghiên cứu (từ IRRI) đã cho thấy, khoảng 25% những thay đổi hàm lượng protein
là do yếu tố di truyền qui định Ngoài ra, các kết quả nghiên cứu còn cho biết: loài phụ
indica có hàm lượng protein cao hơn loài phụ japonica (IRRI, 1970); lúa nếp có hàmlượng protein cao hơn lúa tẻ (Taira, 1971); Những giống lúa ngắn ngày có hàm lượngcao hơn giống dài ngày, những gống lúa trồng ở vùng đồng bằng có hàm lượng proteincao hơn trồng ở vùng đồi núi (Swaminathan, 1971); trong cùng một giống lúa, nhữnghạt nhỏ có hàm lượng protein cao hơn những hạt to hơn (Nagato, 1972)
Trang 16Hàm lượng protein bị ảnh hưởng khá nhiều của giống và môi trường nhưngthành phần axit amin của lúa rất cân đối, ví dụ lysin luôn chiếm trung bình 3,5-4,0 %.
Di truyền tính trạng hàm lượng protein trong hạt rất phức tạp và bị ảnh hưởng mạnh
mẽ của môi trường, giống có hàm lượng protein cao thường liên kết với đặc tính thờigian sinh trưởng ngắn và khối lượng hạt nhẹ (Lamber và cs., 1973) Có một sự khácbiệt rất cơ bản giữa giống lúa có hàm lượng protein tổng số cao và trung bình là khảnăng chuyển vị đạm từ lá vào hạt nhiều hơn, đồng thời theo ghi nhận cuả IRRI thì lúathu hoạch từ các lô ruộng thí nghiệm thường có hàm lượng protein cao hơn lúa thu từcác ruộng của nông dân (Jennings và cs.,1979)
1.2.3 Ảnh hưởng của phân bón đến hàm lượng protein
Nhu cầu dinh dưỡng của cây lúa hay nói cách khác là các chất dinh dưỡng cầnthiết, không thể thiếu được đối với sự sinh trưởng và phát triển của cây lúa bao gồm:đạm (N), lân (P), kali (K), vôi, sắt, kẽm, đồng, magiê, mangan, mô-líp-đen, bo, silic,lưu huỳnh và các-bon, ô-xy, hyđrô Tất cả các chất trên đây (trừ các-bon, ô-xy, hyđrô)phân bón đều có thể cung cấp được Có nhiều chất dinh dưỡng khoáng mà cây lúacần, nhưng 3 yếu tố dinh dưỡng mà cây lúa cần với lượng lớn là: đạm, lân và kali lànhững chất cần thiết cho những quá trình sống diễn ra trong cây lúa Các nguyên tốkhoáng còn lại, cây lúa cần với lượng rất ít và hầu như đã có sẵn ở trong đất, nếu thiếuthì tuỳ theo điều kiện cụ thể mà bón bổ sung
Phân bón có vai trò tối quan trọng trong quá trình sinh trưởng, phát triển củacây lúa, nó cần thiết cho suốt quá trình phát triển, từ giai đoạn mạ cho đến lúc thuhoạch Cùng với các yếu tố năng lượng khác, phân bón cung cấp cho cây là nguồnnguyên liệu để tái tạo ra các chất dinh dưỡng như: tinh bột, chất đường, chất béo,prôtêin… Ngoài ra chúng còn giữ vai trò duy trì sự sống của toàn bộ cây lúa, không cónguồn dinh dưỡng thì cây lúa sẽ chết, không thể tồn tại
Đạm là một trong những cơ sở cấu tạo nên protein, thúc đẩy quá trình quanghợp tích lũy các chất hữu cơ Nhiều thí nghiệm tại các vùng trồng lúa ở Liên Xô cũ vớicác liều lượng phân bón khác nhau đặc biệt là đạm cho thấy: đạm có thể làm tăng hàmlượng đạm (protein) trong hạt thêm 2-3%; các trị số này thay đổi tùy thuộc điều kiệngieo trồng cụ thể Liều lượng và thời gian bón đạm giữ vai trò quan trọng trong việc
Trang 17nâng cao hàm lượng protein trong hạt Tuy nhiên, nếu bón tăng đạm quá nhiều sẽ làmmức độ tăng hàm lượng giảm đi (Vũ Tuyên Hoàng và cs., 2005).
Các nhà nghiên cứu khoa học tại IRRI thống nhất: hàm lượng tinh bột có mốitương quan nghịch biến với hàm lượng đạm Nếu hàm lượng đạm trong hạt tăng lênthì hàm lượng tinh bột sẽ có sự thay đổi Trong điều kiện thuận lợi của sự trao đổigluxit, liều lượng phân bón thích hợp có thể làm tăng hàm lượng đạm và tinh bột
Theo kết quả nghiên cứu của Eruwghin và Suranova ở 70 giống lúa loài phụ
Sino-Japonica có hàm lượng đạm dao động từ 7,6% đến 12,6% Dưới ảnh hưởng của
liều lượng phân bón cao: 180N – 120P2O5 – 90K2O (kg) thì hàm lượng đạm trong hạttăng lên trung bình từ 10 đến 11,3% ở 15 giống lúa (Eruwghinvà cs., 1968)
Theo Ahmod khi nghiên cứu về ảnh hưởng của chế độ tưới và bón phân lênhàm lượng đạm (protein) ở Bangladesh cho kết quả: hàm lượng protein trong hạt vàrơm rạ tăng lên khi bón tăng đạm vào trong đất hoặc tăng độ sâu của lớp nước tưới(Ahmod, 1969)
Trong nghiên cứu của Chanvan khi nghiên cứu về hai giống lúa Jaza và Padmalại cho kết quả: hàm lượng protein trong hạt đều tăng khi tăng lượng phân bón dùtrồng trong điều kiện có nước hay cạn (Chanvan và cs., 1971)
1.2.4 Ảnh hưởng của các điều kiện ngoại cảnh khác đến đời sống cây lúa
Ảnh hưởng của chế độ nước: Theo các kết quả nghiên cứu ở trong và ngoàinước đều thống nhất rằng: lúa được trồng trong điều kiện không có nước (lúa cạn) cóhàm lượng protein cao hơn lúa được gieo trồng trong điều kiện có nước Các giốnglúa gieo trên cạn có hàm lượng protein trong hạt gạo lật chênh lệch tới 39% so với lúatrồng trong điều kiện có nước tưới (Yoshida, 1981; Taira, 1970; Juliano, 1966; )
Kido, lại kết luận những giống lúa chín sớm có hàm lượng protein cao hơnnhững giống lúa chín muộn khi trồng ở ruộng nước
Ảnh hưởng của nhiệt độ, ánh sáng: khi nghiên cứu ảnh hưởng của nhiệt độ khôngkhí và nhiệt độ nước trong ruộng đến hàm lượng protein trong hạt, Honjyo nhận thấy khinhiệt độ không khí hoặc nhiệt độ nước trong ruộng cao sau khi lúa trỗ sẽ làm tăng hàmlượng protein trong gạo Các chế độ nhiệt độ và ánh sánh còn ảnh hưởng
Trang 18nhiều đến tỷ lệ hạt chắc, do ảnh hưởng đến năng suất hạt và năng suất protein trêncùng một đơn vị diện tích (Honjyo, 1971).
Khi nghiên cứu về sự ảnh hưởng của nhiệt độ cao và ánh sáng đến hàm lượngprotein, Sato đã nhận thấy: nhiệt độ cao, cường độ ánh sáng yếu và ẩm độ không khícao vào thời gian hạt chín có tác dụng thúc đẩy sự tích lũy nhiều protein vào hạt củahai giống lúa IR8 và Norin 17 (Sato, 1974)
Trong tất cả các trường hợp đều cho thấy, tương quan nghịch chặt chẽ giữahàm lượng protein và khối lượng nghìn hạt (P1000) Ngoài ra, hàm lượng proteintrong hạt còn thay đổi dần qua các năm và mức độ thay đổi này của từng giống là khácnhau Điều này chứng tỏ, thời tiết có ảnh hưởng lớn tới sự tích lũy hàm lượng proteintrong hạt (Honjyo, 1971)
1.3 NGHIÊN CỨU DI TRUYỀN SỐ LƯỢNG LIÊN QUAN ĐẾN HÀM
LƯỢNG PROTEIN TRONG HẠT LÚA
Phân tích di truyền số lượng là nhằm xác định những locus trong genom chứagen tham gia qui định đặc tính và hiệu quả đóng góp của mỗi locus đó lên đặc tính làbao nhiêu Những phân tích như vậy gọi là phân tích di truyền số lượng Mỗi locus cóthể chứa một hoặc nhiều gen khác nhau Trong hầu hết các trường hợp, phân tích ditruyền đều cho thấy đặc tính số lượng được qui định bởi nhiều gen khác nhau Tuynhiên, trong một số trường hợp đã cho thấy di truyền đặc tính số lượng chỉ do một genqui định
1.3.1 Gen qui định hàm lượng protein ở lúa
Trong thực tế, các tính trạng qui định hàm lượng protein ở lúa phụ thuộc rấtnhiều vào sự tác động của các nhân tố bên ngoài và sự tương tác của các gen bêntrong
Sự biến dị liên tục có được là do những yếu tố có tính chất di truyền cũng nhưyếu tố có tính không di truyền.Sự biến dị có tính di truyền phần lớn do tính chất củagen trong nhân.Sự tương tác không alen trong biến dị liên tục thường có quan hệ đếnmột nhóm, theo mô tả tổng quát đó là hiện tượng epistasis
Trang 19Sự tham gia của bào chất đối với di truyền một tính trạng đã được ghi nhận Áp
dụng phương pháp lai đảo (reciprocal) để phân tích ảnh hưởng của dòng mẹ nói đúng
hơn là ảnh hưởng của tế bào chất - ảnh hưởng của môi trường đối với nhân
Giả sử các tính trạng được điều khiển bởi đa gen- tính trạng có tính biến thiênliên tục (continuously variable), nó không thường xuyên như trong trường hợp tínhtrạng có tính biến thiên không liên tục (discontinuously variable) Do đó cả hai bố mẹcùng tham gia một cách cân đối vào kiểu gen của con lai về phương diện di truyền donhân (nuclear heredity), và một cách không cân đối về phương diện di truyền do tếbào chất
Các đặc tính phẩm chất hạt do yếu tố di truyền và môi trường quyết định, tuỳtheo tính trạng sự thể hiện có thể do yếu tố di truyền, yếu tố kỹ thuật trước và sau thu
hoạch, hay do tương tác kiểu gen x môi trường ( Genotypes x Environment
interaction) quyết định Điều khó khăn cho phân tích là phần lớn những tính trạng
phẩm chất hạt có tương tác kiểu gen x môi trường không tuyến tính ,khó giải thíchtrong những phân tích đơn giản (Bùi Chí Bửu và cs., 1996)
Đặc điểm di truyền về hàm lượng protein do đa gen kiểm soát và chịu sự tácđộng của môi trường Giống có hàm lượng protein cao thường liên kết với đặc tínhthời gian sinh trưởng ngắn và khối lượng hạt nhẹ Hàm lượng protein tổng số bị ảnhhưởng của sự tăng giảm protein thành phần Tính trạng hàm lượng protein có hệ số ditruyền khá thấp,bị ảnh hưởng mạnh mẽ tương tác giữa kiểu gen và môi trường(Chang và cs., 1979)
1.3.2 Hiệu quả gen tham gia qui định hàm lượng protein
Hiệu quả của gen: được xác định hiệu quả giữa giá trị kiểu gen đó và trungbình quần thể, gồm có:
- Hiệu quả cộng tính: là kết quả tác động đồng thời (một cách độc lập) của cácalen trong cùng một locus (ký hiệu là d hay D) Với mô hình cộng tính thì phương saikiểu gen chỉ có cộng tính tức là không có tương tác và các biểu thức kiểu hình của giátrị kiểu hình phản ánh sát nhất (xấp xỉ) các biểu thức của gen, Nhờ hiệu quả cộng tính
Trang 20việc chọn giống theo kiểu hình cho phép chọn những kiểu gen tương ứng mà độ chínhxác chỉ còn phụ thuộc vào độ đồng đều (thuần nhất) của môi trường;
- Hiệu quả trội: là kết quả của tương tác giữa các alen trong cùng một locus(được ký hiệu là h hay H) Trong đó có các kiểu trội: trội hoàn toàn (các alen trong cáclocus không có cùng hiệu quả như nhau; nếu kết hợp kiểu gen AABB với aabb thì F2
có tỷ lệ phân ly 9:3:3:1 trong đó có 9 kiểu gen có cùng giá trị với AABB, 3 kiểu gencùng giá trị và thiên về AABB, 3 kiểu gen cùng giá trị và ít thiên về AABB, 1 kiểu gen
có cùng giá trị với aabb);
- Hiệu quả siêu trội: trong trường hợp này giá trị của Aa lớn hơn AA;
- Hiệu quả trội chệch: hiệu quả này được sinh ra do bởi tương tác không alencủa các gen phân bố ở những locus khác nhau Tương tác này có thể xuất hiện ở giữacác locus mà tại đó:
+ Chỉ có hiệu quả cộng tính (cộng tính x cộng tính), ký hiệu i;
+ Tại locus này có hiệu quả trội, locus kia có hiệu quả cộng (cộng x trội), ký hiệu là j;
+ Cả 2 locus đề xuất hiện hiệu quả trội (trôi x trội), ký hiệu là l;
Tương tác giữa các locus có 5 kiểu trội chệch là: trội chệch bù, trội chệch bội, trội chệch lặn, trội chệch trội, trội chệch lặn áp đảo,
- Hiệu quả tác động đồng thời: là tác động của nhiều kiểu hiệu quả gen,
Để xem xét giá trị kiểu gen, ta xét một locus với 2 allen Pr1 (qui định hàmlượng protein thấp) và Pr2 (qui đinh hàm lượng protein cao) và các giá trị +a, -a và dtheo sơ đồ:
Kiểu gen
Trong đó: - Pr2 làm tăng hàm lượng Pr2Pr2 có giá trị là +a (tăng hàm lượng
Protein trong hạt), giá trị của d tùy thuộc vào mức độ trội của Pr1 và Pr2;
Trang 21- d là tính trội (dominance) - Biểu hiện tính trội, lặn giữa hàm lượng
protein cao và hàm lượng protein thấp;
- a là tính cộng (additive) biểu hiện % hàm lượng protein trong hạt;
+) d<a: Trội từng phần (prtial dominance);
+) d = a: Trội hoàn toàn (complete dominance);
+) d>a: Siêu trội (over dominance);
+) d = 0: Không có tính trội (no dominance).
Mức độ trội có thể được biểu thị bằng tỷ số d/a
Protein là hợp chất hữu cơ rất quan trọng, không thể thiếu đối với mỗi cơ thể sống;
nó cung cấp từ10 đến 15% năng lượng sống giúp cơ thể sinh trưởng và phát triển
Theo Osborne, 1924 thì protein dự trữ trong nội nhũ hạt lúa bao gồm 4 loại:Albumin, Globulin, Glutelin, và Prolamin, Protein được dự trữ trong hạt ở hai dạng(protein body – PB) PBI - gọi là prolamin và PBII - gọi là glutelin Về mặt dinhdưỡng, prolamin được xem là loại protein khó tiêu hóa cho con người và động vật;trong khi đó glutelin là thành phần dự trữ quan trọng nhất trong nội nhũ hạt lúa lên tới75% lượng protein tổng số (Hoai T T., Kumamaru T., 2008) Do prolamin và glutelin
có mối tương quan nghịch nên các nhà chọn giống lúa muốn tăng hàm lượng glutelinbằng cách giảm hàm lượng prolamin trong hạt gạo (Ogawa và cs, 1987)
Vì vậy, nghiên cứu quy luật di truyền hay gen tham gia qui định hiệu quả củacác tiểu đơn vị glutelin và prolamin là vấn đề cần thiết trong công tác chọn giống lúa
có hàm lượng protein cao
Hàm lượng protein cao trong gạo là chỉ tiêu quan trọng để đánh giá chất lượngdinh dưỡng của lúa gạo So với những cây trồng được coi là cây lượng thực nuôi sốngcon người thì cây lúa có hàm lượng protein chứa trong hạt ít hơn cả, vào khoảng 6-8% Protein trong hạt gồm các tiểu phần chính như: albumine, globuline, probaline vàgluteline Trong đó glutelin đóng vai trò chính trong sự tạo thành và dự trữ proteintrong hạt gạo, nó chiếm tới 80% lượng protein tổng số Chúng được tạo thành từ cùng
Trang 22số amino acid và bao hàm cả 24 loại amino acid chứa liên kết peptide, 282 loại aminoacid có tính chất axit và 193 loại amino acid có tính chất bazơ (Takaiwa vá cs., 1987)
Sự di truyền tính trạng hàm lượng protein khá phức tạp, do đa gen điều khiển,
có hệ số di truyền khá thấp,bị ảnh hưởng mạnh mẽ tương tác giữa kiểu gen và môitrường (Chang và cs., 1979) Hàm lượng protein tổng số bị ảnh hưởng của sự tănggiảm lượng protein thành phần Có nhiều gen qui định hàm lượng acid amine thànhphần, di truyền của từng acid amine đó lại chịu ảnh hưởng của cả hai nhóm cộng tính
(additive) và tính trội (dominance).
1.3.3 Tính trạng GPC (Grain Protein Content) ở lúa
Tính trạng GPC (Grain Protein Content): là tính trạng qui định sức chứa, thành
phần các chất hình thành lên protein trong hạt GPC là một trong những tính trạng chấtlượng quan trọng nhất để đánh giá phẩm chất ngũ cốc (Blanco, A.,và cs., 2002)
Hàm lượng protein (protein content) có mối quan hệ rất lớn đến chất lượng nấu nướng (cooking quality), với tý lệ phức hợp với các yếu tố khác trong nội nhũ của hạt, với hệ thống di truyền (genetic system), tương tác với môi trường cũng như các yếu tố
canh tác khác (Blanco và cs., 2002)
Protein trong lúa gạo gồm các tiều phần chính như: albumine, globulin,probalin và glutelin, trong đó glutelin chiếm tới trên 80% lượng protein trong hạt,protein được hình thành từ các α-aminoacid (Aspartic, Glutamic acid, Serine,Histidine, Glycine, Thereonine, Alanine, )
Hiện nay, hầu hết các gen qui định hàm lượng các acid amine trong hạt lúa đãđược làm rõ:
- Gcw 1 (Chr, No 3) và Gcw2, Gcwa (Chr, No10): các gen qui định hàm lượng (tổng hợp) glycine;
- Glu1, Glu2 (Chr, No1), Glu3, Glu4, Glu5 (Chr, No2): Các gen qui định hàm lượng (tổng hợp glutamine;
- Ala1, ala2 (Chr, No6): Các gen qui định hàm lượng (tổng hợp) alamine;
Trang 23- Met1, (Chr, No3), met6 (Chr No10): Các gen qui định hàm lượng (tổng hợp)methionine;
- Glup1, Glup2 (Chr, No9), Glup3 (Chr, No4) và Glup4 (Chr, No12): Các gen qui định hàm lượng (tổng hợp) glutelin ( www,shigen,nig,ac,jp/rice/rgn/vol20/b17,html)
Trong cơ thể của tế bào sinh vật, protein chiếm tỉ lệ nhỏ so với các hợp chấthữu cơ khác như: glucid, lipid, nhưng cùng với nucleic acid, protein đã giữ vai tròquyết định trong tất cả các quá trình sinh trưởng và phát triển Protein là hợp chất hữu
cơ rất quan trọng vàkhông thể thiếu đối với mỗi cơ thể sống ; nó cung cấp (từ 10 đến15%) năng lượng sống và giúp cơ thể sinh trưởng và phát triển, có thể nói rằng nếukhông có protein sự sống không thể diễn ra được (Ngô Xuân Mạnh, Vũ Kim Bảng,Nguyễn Đặng Hùng, Vũ Thy Thu, 2005)
Protein có những đặc tính mà không thể có được ở bất kỳ một hợp chất hữu cơnào khác, nhờ vậy mà đảm bảo được chức năng mạng sự sống và mang thông tin ditruyền Đó là đa dạng trong cấu trúc, tính đặc hiệu cao về loài, có nhiêu biến đổi lí hóakhác nhau, có khả năng tương tác nội phân tử, có khả năng thích ứng với những thayđổi có quy luật của cấu hình phân tử khi có những tác động từ bên ngoài,
Protein có khối lượng phân tử lớn, từ hàng nghì đến hàng trăm triệu Tùy theocác loài khác nhau (động, thực vật khác nhau) tùy theo điều kiện môi trường khácnhau mà thành phần và hàm lượng protein có trong cơ thể sẽ rất khác nhau, proteinđược hình thành từ các α-aminoacid
Hàm lượng protein là một chỉ tiêu quan trọng để đánh giá chất lượng dinhdưỡng của lúa gạo So với những cây trồng khác được coi là cây lương thực nuôisống con người, cây lúa là cây có hàm lượng protein thấp hơn cả (từ 6-12%) Proteintrong lúa gạo gồm các tiều phần chính như: albumine, globulin, probalin và glutelin,trong đó glutelin chiếm tới trên 80% lượng protein trong hạt (Hyroyuki Kagawa, vàcs 1988)
Thành phần các loại acid amine trong protein của hạt có vai trò quan trọng,quyết định hàm lượng protein tổng số và chất lượng của các loại protein Theo Vũ
Trang 24Tuyên Hoàng, 2005, thành phần acid amine trong bố mẹ và con cái là tương tự nhau,nhưng có sự khác nhau về số lượng (%) của chúng chiếm trong chất khô và trongprotein Điều này dẫn tới hàm lượng protein của chúng là khác nhau.
1.4 CHỈ THỊ PHÂN TỬ VÀ ỨNG DỤNG TRONG NGHIÊN CỨU VỀ DI TRUYỀN HÀM LƯỢNG PROTEIN Ở LÚA
1.4.1 Chỉ thị phân tử
Phản ứng chuỗi polymerase được viết tắt là PCR (Polymerase Chain Reaction)
là tiến bộ kỹ thuật đã được ứng dụng rộng rãi trong những năm đầu của thập niên
1990 Đây là phương pháp nhân nhanh một đoạn ADN mới với sự tham gia của cácthành phần chính gồm: ADN khuôn, dNTP, mồi, enzyme polymerase tổng hợp ADN
(Taq), MgCl2 và đệm PCR (PCR buffer) Kỹ thuật PCR hiện đã được hoàn thiện tới
mức tự động hóa trên cơ sở tìm ra enzyme tổng hợp ADN có khả năng chịu nhiệt cao
từ vi khuẩn Thermus aquaticus (Enzyme taq) và việc chế tạo thành công máy chu kỳ
nhiệt
Kỹ thuật PCR đóng vai trò quan trọng trong việc nhân bản các đoạn ADN đích
Do vậy, nó trở thành một khâu quan trọng nhiều kỹ thuật nghiên cứu phân tử mà đặcbiệt là trong kỹ thuật về chỉ thị phân tử Số lượng chỉ thị phân tử phụ thuộc vào phảnứng PCR ngày càng nhiều
1.4.1.1 Chỉ thị RAPD
RAPD (Radom Amplified Polymorphic DNA) nghĩa là đa hình các đoạn ADN được
nhân bản ngẫu nhiên RAPD là một kỹ thuật được xây dựng dựa trên kỹ thuật PCR,với những mồi được thiết kế ngẫu nhiên có chiều dài khoảng 10 nucleotide (Williams
et al., 1990) Khi phản ứng diễn ra, các mồi RAPD gắn ngẫu nhiên vào khuôn ADN ởbất kỳ vị trí nào mà có trình tự bổ sung với nó Phản ứng sau đó xảy ra với sự tham gia
của enzim Taq, dNTP và các thành phần khác.
Về cơ bản chỉ thị RAPD là một chỉ thị trội nên không phân biệt được giữanhững cá thể đồng hợp tử và dị hợp tử trong quần thể F2 Tuy nhiên đây lại là một kỹthuật đơn giản, dễ thực hiện, không mất nhiều thời gian, ít tốn kém Do vậy, kỹ thuật
Trang 25này được ứng dụng trong việc lập bản đồ di truyền, phân tích và xác định mối quan hệthân thuộc giữa các thứ cây trồng hay giữa các cá thể, nhằm phục vụ công tác lai tạohoặc phân loại Chúng cũng được sử dụng như những chỉ thị phân tử để xác địnhnhững gen kiểm soát hoặc có liên quan đến một tính trạng nào đó ở cây trồng Ví dụnhư tính trạng chất lượng sợi ở cây bông, tính trạng kháng virus ở cà chua.
Hạn chế lớn nhất của kỹ thuật này đó là rất nhạy cảm với các yếu tố tham giaphản ứng, đặc biệt là nhiệt độ gắn mồi Để hạn chế nhược điểm này cần phải tuân thủnghiêm ngặt các điều kiện thí nghiệm và tiến hành các thí nghiệm một cách đồng bộ(Lã Tuấn Nghĩa và cs., 2004,)
1.4.1.2 Chỉ thị AFLP
AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism) nghĩa là đa hình chiều dài
các đoạn ADN được nhân bản chọn lọc Kỹ thuật AFLP là sự kết hợp giữa sử dụngenzym giới hạn với khuếch đại PCR và phát hiện đa hình AFLP được phát minh bởiZabeau và Vos (1993)
Về nguyên tắc của kỹ thuật: đầu tiên ADN tổng số được cắt đồng thời bởi hai loạienzym giới hạn thường là MseI (enzym nhận biết 6 nucleotit) và EcoRI (enzym nhận biết
4 nucleotit) Khi xử lý với enzim giới hạn, ADN bị cắt thành vô số mảnh có kích thướckhác nhau, mỗi mảnh đều biết trước trình tự nucleotit ở hai đầu cắt Tiếp đó dựa vào trình
tự ở đầu cắt, thiết kế các đoạn gắn (adapter) và gắn chúng vào mỗi đầu Cuối cùng dựavào trình tự adapter để thiết kế mồi PCR Mồi được thiết kế gồm hai phần: một phần cótrình tự bổ sung với adapter và phần kia là những nucleotit được gắn thêm vào tuỳ ý(thông thường từ 1 đến 3 nucleotit) Với mồi thiết kế như vậy thì chỉ có những đoạn ADN
có trình tự ở hai đầu bổ sung với trình tự mồi mới được nhân lên
Kỹ thuật AFLP đã kết hợp được đặc điểm của RFLP và RAPD nên có nhiều ưu điểmnhư: đơn giản, ổn định, khả năng ứng dụng rộng do có thể chủ động trong việc thiết kế mồi.AFLP cũng được đánh giá là nhanh và hiệu quả trong việc xác định tính đa dạng ở cây trồng,tách dòng và lập bản đồ phân tử Tuy nhiên, AFLP là chỉ thị trội và vị trí nhiễm sắc thể củachúng chưa xác định, do đó không nên dùng để lập bản đồ gen các quần thể F2 Trong
Trang 26trường hợp phải dùng thì cần kết hợp với các chỉ thị khác đã biết trước vị trí nhiễmsắc thể như RFLP hoặc SSR (Lê Duy Thành, 2000; Nguyen Duy Bay, và cs., 2001).
1.4.1.3 Chỉ thị phân tử SSR
Khi nghiên cứu hệ gen của một số sinh vật người ta đã phát hiện ra những đoạnADN có chiều dài khác nhau, phân bố một cách ngẫu nhiên, chứa những trình tự lặp.Mỗi đơn vị lặp thường có số lượng không vượt quá 5 nucleotit (Nguyễn Bá Ngọc,
2004) Ví dụ về trình tự lặp như (TG)n, (AAT)n (n là số lần lặp lại và có sự biến thiêngiữa các alen) Số lần lặp lại của mỗi đơn vị có thể từ 10 đến 100 lần Những trình tự
lặp như vậy được gọi là các trình tự lặp đơn giản SSRs (Simple Sequence Repeats)
hay microsatellites (các vi vệ tinh)
Hệ gen của động vật và thực vật đều chứa các vi vệ tinh Ở thực vật, trình tựAT/TA được nhắc lại nhiều nhất, sau đó là GA/CT, trong khi đó thì trình tự CA/GT lạiphổ biến ở động vật Ở lúa người ta đã phát hiện ra các kiểu trình tự lặp như: GA, GT,CAT, CTT
Các đoạn ADN nhắc lại có trình tự hai đầu rất đặc trưng Bởi vậy trình tự đặctrưng ở hai đầu của đoạn nhắc lại được sử dụng để thiết kế mồi cho phản ứng PCR
Do có sự khác nhau về chiều dài giữa các đoạn nhắc lại mà kỹ thuật này rất phù hợptrong nghiên cứu đa hình, lập bản đồ và phân lập gen Cũng giống như kỹ thuậtRAPD, kỹ thuật SSR đơn giản, thuận tiện, không tốn kém Mặt khác, SSR là chỉ thịđồng trội nên nó được sử dụng để phát hiện cá thể dị hợp tử và lập bản đồ gen sử dụngquần thể F2
1.4.2 Ứng dụng chị thị phân tử trong nghiên cứu về tính trạng chất lượng
Ứng dụng công nghệ sinh học trong lĩnh vực nông nghiệp được coi là giải pháp
đột phá xây dựng và phát triển nền nông nghiệp bền vững Nhờ những tiến bộ của
công nghệ sinh học, đặc biệt là công nghệ ADN (DNA technology) đã giúp cho các quá
trình nghiên cứu về các tính trạng nông học nói chung và tính trạng chất lượng nóiriêng hiệu quả hơn Nếu chỉ đơn thuần sử dụng các phương pháp truyền thống như laitạo và chọn lọc thông qua sự biể u hiện kiểu hình, không những tốn kém tiền của, thờigian mà kết quả chọn lựa còn phụ thuộc rất
Trang 27nhiều vào điều kiện môi trường và kinh nghiệm của nhà chọn giống Trong khi đó cáckết quả ghi nhận sẽ có độ chính xác không cao chưa hẳn đã đáp ứng yêu cầu thực tế.
Nhiều nghiên cứu đã cho thấy gieo trồng các giống lúa có hàm lượng proteincao là hướng đem lại hiệu quả kinh tế Công tác chọn tạo giống lúa có hàm lượngprotein cao có thể được tiến hành theo phương pháp chọn lọc có sự trợ giúp của chỉthị phân tử
Năm 2002, Blanco đã sử dụng 203 chỉ thị RFLP để nghiên cứu, đánh giá 65
dòng nội phối (Recombinant Inbred Lines-RILs) trên lúa mì, kết quả đã xác định được
7 QTLs liên quan đến tính trạng GPC (Grain Protein Content).
McCouch đã thiết lập bản đồ di truyền cây lúa nhờ marker phân tử (RFLP) gồm
135 loci Bản đồ phủ trên 12 nhiễm sắc thể với tổng cộng 1389 cM trên genome cây
lúa từ cặp lai IR34583 (Indica) và Bulu Dalam (Japonica) Các chỉ thị phân tử được
sử dụng để nghiên cứu mối liên kết của chúng với những gen qui định đặc tính ở câynhư: chịu hạn, kháng sâu, bệnh, phẩm chất gạo, Khi chỉ thị phân tử đã được xácđịnh liên kết chặt với gen qui định đặc tính, nó sẽ được sử dụng trong chọn tạo giống(McCouch et al., 1988; 1991; Tanksley và cs., 1990)
Chiều dài hạt là một trong những chỉ tiêu quan trọng để đánh giá chất lượngcũng như độ cảm quanh của một giống lúa, đồng thời nó cũng là một đặc tính rất quantrọng trong chọn tạo giống lúa chất lượng (Luo và cs., 2004)
Wan (2005) đã sử dụng 116 chỉ thị RFLP để tiến hành lập bản đồ chiều dài hạttrên các giống/dòng lúa nghiên cứu (sử dụng quần thể RILs, CSSLs, BC4F2 vàBC4F3), kết quả tác giả đã tiến hành lập được 6 bản đồ QTL (qGL-2; qGL-3a; qGL-3b; qGL-5 , qGL-7 và qGL-9) Trong đó, QTL qGL-3 nằm trên nhiễm sắc thể số 3 cóchỉ số LOD đóng góp vào cao nhất (27.79) quyết định đến di truyền tính trạng chiềudài hạt gạo (Wan và cs., 2006)
1.4.2.1 Bản đồ di truyền tính trở hồ
Một vài nghiên cứu cho thấy độ trở hồ có liên quan đến hàm lượng amylose và
do các gen alk và qASS-6 qui định, trong đó alk là gen kiểm soát giá trị làm nhòe hạt
Trang 28gạo bằng chất kiềm (alkali) Gen alk và qASS-6 có sự liên kết với gen wx (McKenzie
và cs., 1983) và thực tế về kiểu hình thì độ trở hồ quyết định rất lớn đến hàm lượngamylose (Jenningsvà cs., 1979)
He (1998; 1999), đã thiết lập bản đồ di truyền quần thể đơn bội kép (double
haploid) dùng cây lai F1 ZY Q8 (O indica) và JX17 (O japonica) để nghiên cứu hệ di
truyền độ trở hồ và tìm thấy cả gen chính và gen phụ của độ trở hồ đều nằm trên nhiễmsắc thể số 6 liên kết chặt với marker CT201-RZ450 (Hevà cs., 1998;1999)
1.4.2.2 Bản đồ di truyền hàm lượng amylose
Hàm lượng amylose trong phôi nhũ của gạo là chìa khóa quyết định chất lượnggạo Gen điều khiển hàm lượng amylose của lúa mạch nằm trên đoạn ngắn của nhiễmsắc thể số 1 (Kleinhovà cs., 1993) Trên cây lúa (Oryza sativa L.), vị trí gen điều khiển
amylopectin nằm trên nhiễm sắc thể số 6 (Chr 6) Các thể đôt biến về amylose được
nghiên cứu trên giống lúa Japonica với hai dạng hình 204 và EM16 Gen điều khiển sự
tăng giảm hàm lượng amylose được xác định trên nhiễm sắc thể số 2 (Kaushikvà cs.,
1991) Sử dụng marker vi vệ tinh (microsatellite-SSR), người ta đã phân loại được cácnhóm amylose (genWx) nằm trong hệ genome của cây lúa (Ayres và cs., 1997) Mộttrong những thành tựu có ý nghĩa trong nghiên cứu di truyền phân tử về phẩm chấtcơm đã được ghi nhận qua công trình nghiên cứu của Harrington năm 1997 của bản đồliên kết gen với hệ enzym III của tinh bột trong hạt gạo của trên nhiễm sắc thể số 2(Chr 2) sử dụng hai chỉ thị biên là CDO718 và RG157
1.4.2.3 Bản đồ di truyền của hàm lượng protein
Đặc tính di truyền hàm lượng protein là do đa gen kiểm soát và phân bố trêncác nhiễm sắc thể số 1, 2, 4, 6, 9, 12 (liên quan đến các thà nh phần của glutelin), 7, 11(liên quan đến protein dự trữ trong nội nhũ), 5, 7 và 12 (liên quan đến các thành phầncủa prolamin) ( http://www.ricegenome.org)
Theo Nguyễn Thị Lang (2004), hàm lượng protein có sự biến động mạnh mẽ là
do có sự tương tác giữa kiểu gen quy định hàm lượng protein với môi trường (GxE)
Từ kết quả của nhiều năm nghiên cứu tác giả đã đi đến kết luận,
Trang 29hệ số tương quan giữa kiểu gen và với môi trường biến động từ 1,30 đến 0,372(Nguyễn Thị Lang và cs., 2004).
Shenoy khi nghiên cứu về hệ số di truyền của hàm lượng protein đã đưa ra kếtluận, hệ số di truyền hàm lượng protein đạt 71% ( Shenoyvà cs., 1991)
Khi nghiên cứu về sự biến động hệ số di truyền của các cặp lai khác nhau,Nguyễn Thị Lang đã nhận thấy ở một số cặp lai cho kết quả hệ số di truyền hàm lượngprotein rất thấp chỉ đạt 11,1% (Nguyễn Thị Lang và cs., 2004) Từ những biến độngtrên cần phải phân nhóm di truyền trên các nhóm khác nhau của các giống lúa địaphương, xem như là vật liệu lai tốt phục vụ cho chương trình chọn giống lúa tốt hơn.Tuy nhiên khi đánh giá kiểu hình tính trạng protein cũng sẽ ảnh hưởng với môi trườngrất lớn Do đó, kết hợp giữa đánh giá kiểu hình với chỉ thị phân tử để đánh giá và phânnhóm mức độ tương đồng của các giống sẽ cho kết quả cao nhất
1.4.2.4 Bản đồ di truyền tính trạng mùi thơm
Năm 1992, Ahn đã tiến hành sử dụng chỉ thị SSR -PCR để tiến hành nghiên cứu
về gen điều khiển mùi thơm trên hai giống lúa Della và Basmati 370 Kết quả tác giả
đã xác định được chỉ thị RG28 liên kết với gen fgr nằm trên nhiễm sắc thể số 8 điều
khiển tính trạng mùi thơm của hai giống lúa Della và Basmati 370 (Ahnvà cs., 1992)
Thông qua sử dụng chỉ thị RFLP để nghiên cứu tính đa hình của các quần thể
dòng đẳng gen (NILs-population), là các dòng tạo được do hồi giao giữa con lai với
một trong hai bố mẹ của nó, nên nó chỉ khác nhau ở vài đoạn mã di truyền của bố mẹ
do gen (Singhvà cs., 2000) Phân tích bản đồ liên kết thông qua sử dụng chỉ thị RFLP
cho thấy có sự liên kết rất chặt giữa đơn gen lặn fgr với chỉ thị RG28 trên nhiễm sắc
thể số 8 (Chr 8) với khoảng cách di truyền là 4,5 cM
Ngày nay, các chỉ thị phân tử được coi là công cụ quan trọng để xác định từ sự
đa dạng hóa đến phân lập gen trong chọn giống cây trồng Theo Lorieux (1995) có 4loại chỉ thị phân tử cho gen điều khiển mùi thơm, kết quả xác định có nhiều chỉ thị trênnhiễm sắc thể số 8 liên kết rất chặt với gen điều khiển sự
Trang 30hiện diện của AP (2-acetyl-1-pyrroline)-hợp chất chính tạo mùi thơm ở lúa thông qua
một gen chính và hai loci tính trạng số lượng điều khiển tính trạng mùi thơm cây lúa Gen chính điều khiển mùi thơm được định vị và liên kết với hai chỉ thị biên RG1 vàRG28 ở khoảng cách <5 cM Hai loci điều khiển tính trạng số lượng có tác động đénmức độ thơm của các giống lúa Kết quả còn chứng minh rằng nồng độ AP trong câyxảy ra ít nhất ở 2 vùng nhiễm sắc thể khi đánh giá đoạn tái tổ hợp trên nhiễm sắc thể
số 8 ( Lorieux và cs., 1995)
Jin (1996) dùng 300 chỉ thị RAPD để tiến hành đánh giá đa hình tính trạng mùithơm của con lai từ giống bố/mẹ Khao Dawk Mali 105 (thơm) và CT9993 (khôngthơm) Số chỉ thị RAPD cho đa hình giữa 2 giống Khao Dawk Mali 105 và CT9993đạt 64,1% Bên cạnh đó, tác giả cũng đã xác định được chỉ thị Jas 1.5 chỉ cho xuấthiện băng ở vị trí 1,5 kb trên các cá thể lúa thơm Dự a vào sự hiện diện tính trội củaalen không thơm để loại trừ các cá thể không có mùi thơm tác giả đã kết luận chỉ thị
Jas 1.5 liên kết chặt với gen (fgr) quy định tính trạng hương thơm nằm trên nhiễm sắc
thể số 8 với khoảng cách di truyền là 3,9 cM Nó không những rất hữu dụng cho việcxác định gen thơm mà còn phát hiện ra khối liên kết tại vị trí chuyển dần các gen thơmthông qua backcross (Jinvà cs., 1996)
Yoshihashi (2000) đã thành công khi dùng chỉ thị SSR với mồi RM17 để xáđịnh giống gạo thơm Khao Dawk Mali 105 với các giống khác cũng mang cùng tên thịtrường thông qua ADN được li trích từ hạt gạo xay chà
Bergman (2002) phân tích trên quần thể con lai từ ba tổ hợp lai giống lúa giốngthơm và không thơm của mỹ cho kết quả xác định được 9 chỉ thị SSR liên kết locus
RG28 Trong đó chỉ thị RM223 liên kết với locus RG28 tại vị trí của gen fgr với
khoảng cách liên kết là < 5cM (Bergmanvà cs., 2002)
Khi tiến hành nghiên cứu ứng dụng SSR đánh dấu, Nguyễn Thị Lang (2002) đã tiến hành lập bản đồ tính trạng mùi thơm trên nhiễm sắc thể số 8 và kết luận RM223 liên kết chặt với gen
mùi thơm frg với khoảng cách di truyền là 1,6 cM Tác giả còn chuyển đổi RFLP thành STS để
đánh giá mùi thơm thông qua chỉ thị phân tử RG28 trên quần thể F2 Khao Dawk Mali
Trang 31105/ OM1490 cho đa hình giữa hai nhóm thơm và không thơm; bản đồ liên kết gen
mùi thơm được thiết lập cho khoảng cách di truyền RG28 với gen fgr là 1,8cM.
Neelu Jain và cs., (2003) sử dụng 15 chỉ thị SSR đã được sắp xếp trên nhiễmsắc thể số 8 (Garlandvà cs., 2000) để phân tích sự đa dạng về chất lượng gạo của 12giống lúa Basmati trên thị trường Tác giả đã kết luận có 3 alen được xác định tại vị tríSCUrice-SSR1 với các chỉ thị RM342, RM42, RM195, RM223, RM284 nằm trongvùng RG1-RG28 đều cho đa hình cao giữa các giống Basmati thơm và không thơm
Sự kết hợp giữa các phương pháp truyền thống và công nghệ ADN đã hình thànhhướng chọn tạo giống mới là chọn tạo giống nhờ chỉ thị phân tử (Marker Assitsed Selection-MAS) thông qua việc ứng dụng các kết quả về lập bản đồ gen và QTLs qui định các tính vềnăng suất, chất lượng, kháng và chống với các điều kiện bất lợi và sâu bệnh hại
1.5 MỘT SỐ KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU DI TRUYỀN HÀM LƯỢNG PROTEIN Ở LÚA
Viện Cây lương thực và cây thực phẩm (Bộ Nông nghiệp và Phát triển nôngthôn) nghiên cứu thành công giống lúa mới P6 và P290 trên cơ sở phát triển giống P4.Viện sĩ Vũ Tuyên Hoàng với lời nhắn nhủ: “Sau P4 sẽ là P6, vừa ngon mắt, vừa ngonmiệng dành cho bà con ta…”
Thạc sĩ Nguyễn Trọng Khanh cho biết, lúa P6 có nhiều ưu điểm nổi bật so vớicác giống lúa khác Đầu tiên là hàm lượng đạm của P6 đạt 10,5% dẫn đến năng suất
Trang 32Prôtêin cao Nếu tính năng suất lúa là 6 tấn/ha thì các giống khác chỉ đạt 400-420 kgprôtêin/ha trong khi giống P6 đạt 550-600 kg prôtêin/ha Theo thông lệ trên thế giới nếugạo có lượng đạm cao thì năng suất thấp, nhưng P6 có năng suất cao (5,5 tấn/ha) đồngthời với chất lượng cao Thóc thường trên thị trường có giá 5.500-6.000 đồng/kg nhưngthóc của lúa P6 có giá 7.000 đồng/kg Nổi bật nhất là khả năng chịu rét, hiện P6 là giốnglúa chịu rét tốt nhất trên miền Bắc Giống lúa mới có chất lượng gạo cao: gạo trong,không bạc bụng, hạt thon dài, cơm mềm với hàm lượng amylose trung bình.
Theo các nhà khoa học, thức ăn động vật có lượng đạm rất cao, nhưng đạmđộng vật thường gây ra bệnh tim mạch và nhiều bệnh tật nguy hiểm khác, trong khiđạm thực vật rất an toàn cho người Chính vì thế, gạo từ lúa P4, P6, P290 sẽ là nguồncung cấp đạm cho nông dân giá rẻ, an toàn, dễ kiếm, là thực phẩm hữu ích trong thời
kì phát triển mới của đất nước (Theo Báo Người Cao Tuổi)
Phát hiện các gen điều chỉnh Glutelin ở lúa: GS WAN Jianmin và các đồngnghiệp tại trường Đại học Nông nghiệp Nanjing (Trung Quốc) vừa công bố nhữngkhám phá mới của họ về quá trình xử lý glutelin trong gạo trên Tạp chí Plant Journal
số ra mới đây với tựa đề "Enzym OsVPE1 xử lý không bào là cần thiết cho xử lýglutelin" Theo cách phân loại protein dự trữ thì protein dự trữ trong nội nhũ hạt lúabao gồm 4 loại protein: Albumin, Globulin, Glutelin, và Prolamin Protein dự trữ ở haithể protein (protein body, được viết tắt là PB) bao gồm PBI và PBII PBI hay prolamintan trong cồn, kích thước nhỏ (1-2 nm), hình cầu và cấu trúc đồng tâm trong khi PBIIhay glutelin không hòa tan được trong dung dịch muối hoặc cồn nhưng hòa tan đượctrong dung dịch 0.1M acid hoặc kiềm, kích thước lớn hơn (2-3 nm) Nghiên cứu quyluật di truyền của các tiểu đơn vị glutelin là vấn đề cần thiết trong công tác chọn giốnglúa có chất lượng dinh dưỡng cao
Nghiên cứu, đã phân tích sinh sản vô tính và các chức năng của một OsVPE1,chuỗi Nucleotide biến thể của glutelin ở loại lúa mới Nghiên cứu cũng tiết lộ một biếnthể có thể làm thay đổi Cys269 thành Gly Những phân tích di truyền cũng cho thấyrằng phenotip W379 được kiểm soát bởi một gen hạt nhân lặn đơn Những thí nghiệmcho thấy rằng hoạt động phân chia ASN (trong chuỗi HIS, LYS, ASN, LEU) đặc trưngcủa vật đột biến không lớn hơn 10% so với điều tương tự ở giống lúa Nipponbare.Giống lúa Nipponbare có khả tạo ra các protein bình thường, trong khi
Trang 33OsVPE1 lại không như vậy, có vẻ như có sự phân chia không hợp lý ở OsVPE1 vàđiều này do hoạt động enzym của OsVPE1 ở vật đột biến gần như bị loại bỏ.
Nghiên cứu prôtêin và chức năng prôtêin(Proteomics).Các prôtêin mang rấtnhiều trọng trách trong tế bào Một bộ prôtêin hoàn chỉnh gọi là proteome, phụ tráchnghiên cứu cấu trúc prôtêin, chức năng hoặc bất cứ hoạt động nào của prôtêin trong tếbào gọi là proteomics.Gen sao bản kích hoạt rất năng nổ, thay đổi liên tục với mỗi kíchthích của môi trường Mục tiêu của nghiên cứu prôtêin và chức năng prôtêin là để tìmhiểu cơ chế cho phép cấu trúc và chức năng của prôtêin thực hiện nhiệm vụ của mình,
nó tương tác với cái gì, và làm thế nào góp phần vào chu kỳ sống.Một ứng dụng củakhoa học nghiên cứu prôtêin và chức năng prôtêin được biết tới là bản chụp nghiêngbiểu hiện prôtêin, nơi prôtêin được nhận diện trong cơ thể sinh vật dưới kích thích củamôi trường Khoa học nghiên cứu prôtêin và chức năng prôtêin còn để phát triển mộtbiểu đồ mạng prôtêin nơi mỗi tương tác của prôtêin được xác định cho một hệ sốngnhất định.Khoa học nghiên cứu prôtêin và chức năng prôtêin cũng được ứng dụng để
vẽ sơ đồ biến đổi prôtêin nhận biết sự khác biệt giữa cơ thể sinh vật hoang dã và cơ thểsinh vật biến đổi gen Ngành khoa học này cũng được ứng dụng nghiên cứu tương tácgiữa prôtêin và prôtêin trong mỗi phản ứng bảo vệ của thực vật.Vi dụ, nghiên cứuprôtêin và chức năng prôtêin tại đại học Iowa kết luận:
•Một thí nghiệm về thay đổi prôtêin trong bản sao gen kích hoạt của ngô dưới nhiệt
độ thấp là tác động chính giúp ngô con nảy mầm
• Phân tích những khác biệt xảy ra trong thể hiện hệ gen đậu nành trồng ở nhiệt độ cao
•Nhận biết thể hiện prôtêin phản ứng trước các loại bệnh như giun tròn nang ở cây đậu nành
Khoa học nghiên cứu hóa chỉ tế bào(Metabolomics):Nghiên cứu hóa chỉ tế bào làngành khoa học “omics” mới nhất Hóa chỉ tế bào là một bộ hoàn chỉnh các tổ hợptrọng lượng phân tử thấp trong một mẫu Các tổ hợp phân tử là các chất nền hoặc sảnphẩm phụ của các phản ứng enzim, trực tiếp tác dụng lên kiểu hình của tế bào Vì thế,mục đích của nghiên cứu hóa chỉ tế bào là xác định các mẫu sao chụp của các tổ hợpnày tại một thời điểm xác định dưới tác động của các điều kiện môi trường nhất định.Nghiên cứu gen và chức năng gen, nghiên cứu prôtêin và chức năng prôtêin giúp mởrộng thông tin về kiểu di truyền nhưng vẫn bị hạn chế thông tin về kiểu hình Các tổ
Trang 34hợp trọng lượng phân tử thấp các là các liên kết gần nhất đến kiểu hình.Nghiên cứuhóa chỉ tế bào được ứng dụng để xác định sự khác nhau trong hàm lượng hàng nghìnphân tử giữa một cơ thể thực vật khỏe và một cơ thể có bệnh Công nghệ này đồngthời cũng được sử dụng để xác định khác biệt dinh dưỡng giữa cây trồng bình thường
và cây trồng biến đổi gen, và khác biệt trong khi nhận biết chất chuyển hóa bảo vệthực vật
Tại Hội nghị quốc gia về chọn tạo giống lúa tại Viện Lúa Đồng Bằng sông Cửulong - tháng 7/2004, một số kết quả nghiên cứu về ứng dụng kỹ thuật điện di ProteinSDS-Page trong việc chọn tạo giống lúa chất lượng cao đã được trình bày:Kỹ thuậtđiện di là một công cụ phân tích cho phép đánh giá gián tiếp dò tìm bộ gen thông qua
kỹ thuật phân tích tính biến dị cấu trúc của các enzym và protein Kết quả so sánh vớiphương pháp phân tích điện di bằng kỹ thuật điện di isoenzyme cho thấy kỹ thuật điện
di protein phát hiện được mức độ đa dạng của protein gấp nhiều lần hơn Hơn nữa, kỹthuật điện di protein xác định nhanh, tương đối rẻ tiền, không cần phải trồng cây chờđến thời điểm thu hoạch và không bị ảnh hưởng do môi trường Các nhà chọn giống
sử dụng kỹ thuật điện di trên hạt giống với mục đích như sau:Phân tích các proteintinh khiết Đánh giá được nồng độ protein.Phát hiện được quá trình phân giảiprotein.Xác định được các protein miễn nhiễm trầm tủa.Kiểm tra sự hiệu chỉnhprotein Phân lập và xác định nồng độ các kháng nguyên do protein để sản xuất khángthể Phân lập protein đánh dấu bằng bức xạ
Ứng dụng phương pháp điện di protein, các nhà khoa học Viện Lúa ĐBSCL từ tháng10/2000 đã tuyển chọn dòng thuần của giống lúa Nếp bè Tiền giang đang được trồngtrong sản xuất Từ 5 hạt ưu tú được chọn ra, tiến hành nhân lên trong nhà lưới và đến khithu hoạch tiếp tục được kiểm tra lại độ thuần, hàm lượng protein và hàm lượng amylose
Từ đó đã chọn ra được dòng Nếp Bè 1-2 có chiều dài hạt dài hơn giống đối chứng, năngsuất cao hơn 15% và hàm lượng protein trên 10% Kết quả này cho thấy, kỹ thuật điện diprotein sẽ giúp cho nhà chọn giống chọn ra được giống lúa Nếp thuần thep yêu cầu chấtlượng hàng hoá, giảm quy mô trồng ngoài đồng để tuyển chọn và thời gian tuyển chọn.Hướng ứng dụng này có thể tiếp tục áp dụng cho các giống lúa nếp khác đang trồng ởvùng Đồng bằng sông Cửu long như Nếp Móng chim, Nếp Mù
Trang 35u, Nếp Sáp… Việc chọn lọc dòng thuần đối với giống lúa thơm VD 20 ( Việt Đài 20 )
du nhập vào Việt Nam năm 1996 cũng đã được tiến hành Từ 4 dòng thuần chọn lọc
ra, đã tuyển chọn ra dòng C3 có đặc tính là năng suất cao, đạt 7,1 tấn/ha vụ ĐôngXuân, có cơm ngon, mềm và thơm hơn đối chứng
Trong một nghiên cứu được công bố trên Kỷ yếu của Viện Hàn lâm Khoa họcQuốc gia, Hoa Kỳ, các nhà nghiên cứu mô tả các hạt gạo có thể sản xuất số lượng lớn
một protein máu gọi là albumin huyết thanh, hoặc HSA1 Ở Trung Quốc, ý tưởng sử
dụng lúa, một cây trồng phong phú, để bổ sung hoặc thậm chí thay thế các nguồn cungcấp albumin hiện tại nhằm đáp ứng nhu cầu về HSA và làm giảm nguy cơ lây lan virustrong huyết tương tiềm ẩn đã được Daichang Yang, nhà công nghệ sinh học thực vậttại Đại học Vũ Hán, Trung Quốc và các đồng nghiệp thực hiện bằng cách chèn gene
mã hóa HSA vào các cây lúa Gene này được kích hoạt trong quá trình tạo hạt vàprotein tạo ra được lưu trữ trong hạt gạo cùng với các chất dinh dưỡng khác Kết quảcho thấy HSA chiếm hơn 10% protein hòa tan tổng số của hạt gạo, một trong nhữngsản lượng cao nhất của protein tái tổ hợp từ cây trồng tính đến thời điểm hiện nay.Cáckết quả phân tích cho thấy protein có nguồn gốc từ gạo có các đặc điểm hóa học và vật
lý và biểu hiện chức năng tương đương với protein huyết tương máu người trong cácthử nghiệm y tế và phản ứng miễn dịch
Trang 36Chương 2: VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 2.1 VẬT LIỆU NGHIÊN CỨU
- Các giống lúa có hàm lượng protein thấp: Khang dân 18, Q5
- Các giống lúa có hàm lượng protein cao: P290, P6, P4, P1, AC5, và các quần thể con
lai F1, F2, BC1(150-200 hạt/dòng)
- Các vật tư hóa chất phục vụ công tác nghiên cứu
Bảng 2.1: Danh sách mồi SSR
Một số đặc điểm của giống bố mẹ
Theo các nghiên cứu trước đây , đăcc̣ biêṭlàbáo cáo kết quảthưcc̣ hiêṇ đềtài “Nghiên
cứu choṇ taọ giống lúa cóhàm lươngc̣ protein cao trong gaọ cho vùng thâm canh và
vùng khô hạn” giai đoạn 2002-2005 đa ữcho thấy:
- Giống Khang dân 18: là giống lúa thuần nhập nội từ Trung Quốc Giống lúa này có
nhiều đặc tính nông học tốt như: khả năng thích ứng rộng, hiện đang được trồng phổ
biến ở miền Bắc và miền Trung Giống lúa này có thời gian sinh trưởng là 130 - 135
ngày vào vụ Xuân, 105 - 110 ngày vào vụ mùa, chiều cao cây 95 - 100cm, năng suất từ
Trang 3755 - 60tạ/ha Khang dân 18 là giống lúa có hàm lươṇ protein thấp , khoảng 7% ( bảng2.2)
- Giống Q5: là giống lúa thuần nhập nội từ Trung Quốc, đươcc̣ trồng phổbiến ởmiền
Bắc nước ta Thời gian sinh trưởng ởtràXuân muôṇ là 135 - 140 ngày, ở trà mùa sớm
là 110 - 115 ngày; chiều cao cây tưừ 90 - 95cm; chất lươngc̣ gaọ trung binhừ ; năng suấttrung binh 45 - 50ta/ha Giống lua nay co ham lươngc̣ protein thấp khoang 6,8% (bảng
2.2)
- Giống lúa P1: Có thời gian sinh trưởng từ 170 - 175 ngày ở vụ Xuân; 120 - 125 ngày
ở vụ Mùa Giống cóchiều cao cây 100 - 105cm; năng suất trung binhừ 55 - 67 tạ/ha.Giống cóchất lươngc̣ gaọ tốt ; hàm lượng protein khá cao chiếm khoảng 10,5% ( bảng2.2)
- Giống lúa P4: Có thời gian sinh trưởng từ 165 - 180 ngày ở trà Xuân chính vụ ; 135
- 140 ngày ở vụ mùa Giống cóchiêu cao cây 95 - 100cm; năng suất trung binhừ 40 - 45tạ/ha Giống cóchất lươngc̣ gaọ tốt ; cơm dẻo, đâṃ; đăcc̣ biêṭhàm lươngc̣ protein khácaochiếm khoảng 11% (bảng 2.2)
- Giống P6: Có thời gian sinh trưởng từ 115 - 120 ngày ở vụ Mùa ; 160 - 175 ngày ở
vụ Đông xuân ở đồng bằng sông Hồng còn ở từ Nghệ An đến Huế từ 130 - 140 ngày.Giống cóchiều cao cây 80 - 90cm; năng suất trung binhừ 55 - 65t a/hạ Giống cóchất lươngc̣ gaọ tốt; cơm mềm; hàm lượng protein cao chiếm khoảng 10,5% (bảng 2.2)
- Giống AC5: Có thời gian sinh trưởng 160 - 170 ngày vào vụ Xuân và 120 ngày vào
vụ Mùa Chiều cao cây 90 - 95cm Năng suất đaṭ65 tạ/ha vào vu c̣Xuân và60 tạ vào vụMùa Giống này cóchất lươngc̣ gaọ tốt vàhàm lươngc̣ protein khoảng 9,5% (bảng 2.2)
- Giống P 290: Thời gian sinh trưởng 180 - 185 ngày vào vụ Xuân , 135 ngày vào vụ
Mùa Chiều cao cây 90 - 95cm Năng suất 65 - 70 tạ/ha vào vu c̣Xuân, 55 - 60 tạ/ha vào
vụ Mùa Giống cóchất lươngc̣ gạo tốt, cơm ngon , mềm, đâṃ vàhàm lươngc̣ protein là10% (bảng 2.2)
Trang 38Bảng 2.2 Môṭ sốđăcc̣ ti ́ nh nông hocc̣ của các giống lúa sửdungc̣ trong nghiên cứu
Đa hình ADN giữa các giống bố mẹ
Đa hình ADN của các giống đã được xác định bằng cách phân tích nhận dạng ADN sửdụng các mồi SSR Phản ứng PCR của các giống lúa: KD18, Q5, P1, P4, P6 và P290
đã tiến hành với các mồi SSR; hình ảnh nhận dang ADN (hình 1) được ghi nhận dướidạng 0 và 1, sau đó sử dụng phần mềm NTSYS để xây dựng ma trân tương đồng(bảng 2.3) và sơ đồ hình cây (hình 2.2)
Trang 40Hình 2 1. Hình ảnh nhận dạng ADN bằng mồi SSR, 1: Thang marker chuẩn,
2 - 8: các giống lúa thí nghiệm
Qua kết quả phân tích đa dạng di truyền giữa các giống cho thấy các giống hoàn toàn
khác nhau về di truyền; sự tương đồng giữa các giống từ khoảng 0,49 - 8,7.Phần lớn các giống lúa có hệ số tập trung trong phạm vi từ 0,6 - 0,7; mức độtương đồng di truyền này rất thích hợp cho việc chọn cặp lai, tạo ra ưu thếlai cao đồng thời cũng dễ dàng trong các phân tích di truyền tiếp theo về bảnchất di truyền cũng như là hiệu quả gen tới các tính trạng nông học