ĐẠI CƯƠNG TIN SINH HỌC

 Bio : Sinh học phân tử Molecular Biology Informatics : Khoa học tính toán  Bioinformatics: Giải quyết các bài toán sinh học phân tử bằng việc sử dụng các phương pháp của khoa học tín

 Tin sinh học là gì?

 Tầm quan trọng của Tin sinh học.

 Các vấn đề liên quan đến Tin sinh học.

 Bio : Sinh học phân tử (Molecular Biology)

 Informatics : Khoa học tính toán

 Bioinformatics: Giải quyết các bài toán sinh học phân tử bằng việc sử dụng các phương pháp của khoa học tính toán

Synonyms:

◦ Computational biology,

◦ Computational molecular biology,

◦ Biocomputing

 Tại chương trình bắt học?

 Để tích lũy đủ tính chỉ?

 Để được sử dụng máy tính? ….???

“The two technologies that will shape the next century are biotechnology and information technology” (Bill Gates)

“The two technologies that will have the greatest impact on each other in the new millennium are biotechnology and information technology” (Martina McGloughlin)

Chia nhóm thảo luận, trình bày:

 Codons – Mã di truyền

 Open Reading Frame (ORF)

 Định dạng FASTA

 Trình tự DNA, Protein, RNA

 Trình tự bổ sung, trình tự ngược, bổ sung ngược

 SeqVerter

 DNAclub

 Tạo 1 file Word và save vào ổ D:/ với tên file như sau:

“Tên-MSSV”

VD: “Khang-3012013”

 Trả lời các câu hỏi của phần thực hành vào file vừa tạo.

- Mô taả tóm tắắt các bướắc thưực hiệựn.

Câu 1

 Tìm hoặc tạo 5 trình tự DNA hoặc protein

 Viết các trình tự thành định dạng FASTA dùng chương trình Notepad

 Dùng phần mềm Seqverter để chuyển 5 file trình tự thành 1 file với định dạng Clustal.

Câu 2

Tìm ORF của một trình tự DNA bằng chương trình DNAclub và công cụ trên internet.

Câu 3

Dùng chương trình DNAclub:

a Tìm vị trí trình tự GTTAAC trong chuổi DNA.

b Chuyển đổi trình tự DNA gốc thành trình tự bổ xung, và trình tự ngược lại.

c Chuyển đổi trình tự DNA thành trình tự amino acid.

Câu 4

Chuyển trình tự amino acid Frame 1 ở câu 3.c sang trình tự DNA (Gợi ý: h

ttp://emboss.bioinformatics.nl/cgi-bin/emboss/backtranseq )