BÀI TẬP LỚN DỊCH VỤ ENTREZ-TUTOR CỦA NCBI

BÀI TẬP LỚN DỊCH VỤ ENTREZ-TUTOR CỦA NCBI

BÀI TẬP LỚN DỊCH VỤ ENTREZ/TUTOR

CỦA NCBI

Nhóm 2

Entrez là dịch vụ quản lý và liên kết thông tin của cơ sở

dữ liệu NCBI

Dịch vụ này đảm nhiệm vai trò kết nối liên thông giữa các mảng thành một tổng thể

tìm kiếm nhanh và dễ dàng

Giao diện trang chủ của dịch vụ Entrez:

Giao diện của dịch vụ: Entrez/tutor

Các ứng dụng của cở sở dữ liệu

Entrez/tutorial

Nhận dạng một đặc trưng,đặc điểm trình tự mRNA trong hàng tỷ chuỗi nằm trong ngân hàng dữ liệu nucleotide của Entrez.

Lấy được những thông tin liên quan và ghi chép về

một protein

Nhận dạng những vùng bảo thủ của protein

Nhận dạng những đột biến trong gen hoặc protein

Tìm cấu trúc 3 chiều của protein hoặc sự vắng mặt của nó; nhận biết cấu trúc của các chuỗi tương đồng

Xem xét biểu hiện gen và download những vùng trình

tự cần xác định

Giao diện của Entrez Help

Nguyên tắc khi tìm kiếm trong Help sẽ sử dụng các tài liệu thành phần của Entrez được biết như là PubMed, sử dụng đường link tới PubMed Help

Việc tìm kiếm trong Entrez Help được thực hiện bằng cách gõ từ khóa; có thể tìm trong tập sách đang tìm, trong tất cả các quyển sách, trong cơ sở PubMed, hay trong tất

cả các trang Help của NCBI (tick vào cơ sở dữ liệu bạn muốn tìm)

Giao diện của Entrez Databaes

Có thể gõ trực tiếp từ khóa vào cửa sổ tìm kiếm hoặc sử dụng những đường link

Ví dụ sử dụng đường link:

Khi di chuyển chuột tới mục cần tìm kiếm, sẽ xuất hiện đường link tới các mục liên quan Kích chuột vào phần bạn quan tâm

- Gõ từ khóa bạn quan tâm

- Nếu bạn không nhớ chính xác từ đó,và bạn gõ sai thì chương trình sẽ tìm từ có cấu trúc gần đúng nhất và yêu cầu bạn xác nhận lại

Gõ từ khóa vào đây

Kích đây để hiển thị kết quả tìm kiếm

Kết quả tìm kiếm:

Giao diện của Batch Entrez

Sử dụng Batch Entrez để tải một file của Gls hoặc bổ xung dữ liệu về Nucleotide hoặc Protein; hoặc tải lên một danh sách bản ghi tương tự từ cơ sở dữ liệu khác của Entrez

Giao diện của Entrez Utilitise

Entrez Utilitise là công cụ cung cấp phương tiện đến các cơ sở dữ liệu bên ngoài Entrez trên giao diện câu hỏi của các trang Web hợp thức khác; và có thể giúp cho việc lấy ra kết quả tìm kiếm sử dụng trong tương lai trong một môi trường khác

Giao diện của LinkOut

LinkOut là một dịch vụ của Entrez, cho phép truy cập từ PubMed và bất cứ cơ sở dữ liệu Entrez tới một phạm vi

mở rộng thông tin và dịch vụ vượt qua ngoài giới hạn Entrez

Chỉ áp dụng cho một hồ sơ dữ liệu đặc trưng, cụ thể

Thông qua các đương link làm thuận tiện tiếp cận các nguồn dữ liệu mở rộng, dễ hiểu, bổ xung đã được tìm thấy bằng Entrez