ỨNG DUNG CỦA ENZYME CẮT GIỚI HẠNRFLP 8... ỨNG DUNG CỦA ENZYME CẮT GIỚI HẠN• TẠO PHÂN TỬ DNA TÁI TỒ HỢP 9... THIẾT LẬP PHẢN ỨNG ENZYME+ Enzyme là thành phần cho sau cùng.. + Tổng thể tích
Trang 1GIỚI THIỆU MỘT SỐ ENZYME THÔNG DỤNG TRONG SINH HỌC
PHÂN TỬ
Phạm Trần Đăng Thứcptdthuc@hcmus.edu.vn
Trang 44
Trang 5NUCLEASE – ENZYME CẮT GIỚI HẠN
Trang 6ENZYME CẮT GIỚI HẠN (TT)
6
Trang 7Derivation of the EcoRI name
Abbreviation Meaning Description
Trang 8ỨNG DUNG CỦA ENZYME CẮT GIỚI HẠN
RFLP
8
Trang 9ỨNG DUNG CỦA ENZYME CẮT GIỚI HẠN
• TẠO PHÂN TỬ DNA TÁI TỒ HỢP
9
Trang 1010
Trang 11Taq polymerase – PCR thông thường
Pfu polymerase – PCR thu nhận gene
11
Trang 12THIẾT LẬP PHẢN ỨNG ENZYME
+ Enzyme là thành phần cho sau cùng
+ Tổng thể tích enzyme ≤ 1/10 tổng thể tích phản ứng
+ dd mẹ nX cần được pha lõang thành 1X
+ Phản ứng phải được ủ ở nhiệt độ và thời gian phù hợp
+ Rnase họat động không cần đệm
+ Độ tinh sạch của DNA quyết định hiệu quả phản ứng cắt giới hạn
12
Trang 13THIẾT LẬP PHẢN ỨNG ENZYME
13
Trang 14BÀI TẬP
Thiết lập phản ứng thủy giải 5 ng DNA plasmid bằng 2 enzyme
BamHI, HindIII Biết:
Trang 15PHÂN TÍCH KẾT QUẢ ĐIỆN DI PLASMID
15
Trang 16Xác định kích thước plasmid => cắt mở vòng plasmid
PHÂN TÍCH KẾT QUẢ ĐIỆN DI PLASMID
16
Trang 1717
Trang 18PHÂN TÍCH KẾT QUẢ PHẢN ỨNG
CẮT GIỚI HẠN
18
Trang 19PHÂN TÍCH KẾT QUẢ PHẢN ỨNG NỐI
19
Trang 20PHÂN TÍCH KẾT QUẢ PHẢN ỨNG THỦY
GIẢI NUCLEIC ACID
Rnase+
Rnase-20
Trang 21THỰC HÀNH
1 Chuẩn bị dụng cụ hóa chất
2 Bổ sung đủ và đúng thứ tự các thành phần vào EPPENDORF 0.5 ML
1 LY TÂM NGẮN để kéo các thành phần xuống đáy ống
2 Đặt phản ứng vào NHIỆT ĐỘ thích hợp
3 Bổ sung dung dịch nạp mẫu dừng phản ứng
4 Điện di phân tích kết quả
bufferplasmid
Trang 22Nhóm 7-8: Đặt phản ứng nối thang lamda HindIII với DNA T4 ligase
-DNA lamda HindIII 1 ul
-DD đệm (buffer) 10X 1 ul
-DNA T4 ligase 1 ul (THÀNH PHẦN CHO VÀO SAU CÙNG)
Ủ 1h ở 16oC (ĐẶT TRÊN KHAY NƯỚC ĐÁ ĐANG TAN)
Nhóm 9-10: Đặt phản ứng thủy giải RNA bằng RNAse cho hỗn hợp