vấn đề ôn tập tin sinh

Phân tích các dữ liệu thống kê bằng phần mềm excel.. Từ GenBank, tải và phân tích thông tin trình tự gen insulin của người, gen htPA của người, trình tự gen mã hóa HGH human growth ho

Hoàng Phú Hiệp 2016

Hướng dẫn ôn tập

1 Phân tích các dữ liệu thống kê bằng phần mềm excel

2 Từ NCBI tìm một bài báo xuất bản năm (2013, 2014, 2015, ) về

a. ứng dụng kỹ thuật chuyển gen ở thực vật

b. ứng dụng kỹ thuật chuyển gen ở động vật

c. ứng dụng nuôi cấy mô tế bào thực vật

d. ứng dụng kỹ thuật chịu hạn ở một loại cây trồng

3 Từ GenBank, tải và phân tích thông tin trình tự gen insulin của người, gen htPA của người, trình tự gen mã hóa HGH (human growth hormone) của người, gen 16S của vi khuẩn E Coli O157:H7, gen mã hóa chaperonin của cây lúa, gen matK của lúa (7 trình tự), gen DREB2 ở cây đậu tương (7 trình tự), gen defensin phân lập từ cây ngô (7 trình tự),

4 Từ GenBank, tìm và phân tích thông tin trình tự amino acid insulin của lợn, trình tự amino acid của protein Cystatin của cây lạc, trình tự amino acid của protein dehydrin của đậu tương,

5 Cho biết những thông tin cơ bản của gen mang mã số FN435626, KC596009, NM001250385, LK936507, KJ469411, LN650983, AF288129, LK936509, LK936508,

6 Cho biết những thông tin cơ bản của protein mang mã số NP_000506, AAA52484, CEF82730, ABD14811, CAA01607, Z11546, CCF23313, CCF23312, CBZ41765,

7 Sử dụng phần mềm BioEdit để xác định điểm cắt của các loại enzyme giới hạn của các trình tự gen (tìm hiểu thêm thông tin về phần mềm sử dụng enzyme cắt giới hạn)

8 Sử dụng Bioedit để chuyển đổi trình tự nucleotide sang trình tự bổ sung, trình tự đảo ngược bổ sung, trình tự ribonucleotide của mRNA và sang trình tự amino acid và ngược lại của các trình tự

9 Từ trình tự nucleotide (amino acid) (có 3-5 trình tự khác nhau) xác định xem thuộc gen nào và phân lập từ loài sinh vật nào? Ví dụ:

ATGGCGCCGTCTCGACGCATGGCGGCTCCCGTCCTCGTCCTCATGCTC CTCCTCGTCGCCACAGAGCTGGGGACGACCAAGGTGGCGGAGGCGA GGCACTGCCTGTCGCAGAGCCACCGGTTCAAGGGCCTGTGCATGAGC AGCAACAACTGCGCCAACGTGTGCCAGACCGAGAACTTCCCCGGCGG CGAGTGCAAGGCGGAGGGCGCCACGCGCAAGTGCTTCTGCAAGAAG ATCTGCTAG

MEDAGLGDCCSSNSTITRKSDKRKQQHQQQEKPYRGIRMRKWGKW

VAEIREPNKRSRIWLGSYATPVAAARAYDTAVFHLRGPSARLNFPEL

LSQDDDVSTQQQGNMSADSIRKKATQVGARVDALQTALQQSSSSHS

ANSSHVSSDKPDLNEYPKPED

10 Sử dụng DNAstar, Bioedit, NTSYS xác định hệ số tương đồng, hệ số phân ly, thiết lập sơ đồ hình cây, (phân tích kết quả thu được)

11 Thiết kế cặp mồi khuếch đại gen (đủ số nucleotide của gen) bằng tay và phần mềm (NCBI, Primer3, …) Đặc điểm thiết kế mồi