Kích thước bộ gen Các bộ gen của một sinh vật là tập hợp của các gen quy định cụ thể như thế nào kiểu hình của nó sẽ phát triển theo một tập hợp các điều kiện môi trường.. Trong ý nghĩa
Trang 1Kích thước bộ gen
Các bộ gen của một sinh vật là tập hợp của các gen quy định cụ thể như thế nào kiểu hình của nó sẽ phát triển (theo một tập hợp các điều kiện môi
trường) Trong ý nghĩa này, sau đó, lưỡng bội sinh vật (như chúng ta) có chứa
hai bộ gen, một thừa hưởng từ mẹ của chúng tôi, một người khác từ người cha của chúng tôi
Bảng dưới đây đưa ra một lựa chọn các kích thước bộ gen của người đại diện trong danh sách đang phát triển nhanh chóng của các sinh vật có bộ gen đã được lập trình tự
Bảng các gen kích cỡ (đơn bội)
φX174 5,386 11 virus của E coli
Epstein-Barr (EBV) 172,282 80 nguyên nhân bạch cầu đơn nhân
Nanoarchaeum
Thành viên này ký sinh của Archaea có bộ gen nhỏ nhất của một sinh vật thật sự chưa tìm thấy
nucleomorph của
Guillardia theta 551,264 511
tất cả những gì còn lại của bộ gen
bởi eukaryote khác
Mycoplasma
genitalium 580,073 485
Mycoplasma
pneumoniae 816,394 680
hai trong số những sinh vật nhỏ nhất đúng
Chlamydia
trachomatis 1,042,519 936
vi khuẩn này gây ra các bệnh truyền qua đường tình dục phổ
biến nhất ( STD ) tại Hoa Kỳ
Rickettsia prowazekii 1,111,523 834 vi khuẩn gây bệnh sốt phát ban
dịch bệnh
Treponema pallidum 1,138,011 1,039 vi khuẩn gây bệnh giang mai
Trang 2Mimivirus 1,181,404 1,262
Một virus (của một amip) với một
bộ gen lớn hơn so với sáu sinh vật
di động trên
genome nhỏ nhất được tìm thấy
trong một sống tự do sinh vật
Borrelia burgdorferi 1,44 x 10 6 1,738 vi khuẩn gây bệnh Lyme [ Lưu ý ]
Campylobacter jejuni 1,641,481 1,708 thường xuyên gây ra ngộ độc thực
phẩm
Helicobacter pylori 1,667,867 1,589
Chánh nguyên nhân gây ra viêm loét dạ dày (không phải căng thẳng và chế độ ăn uống)
Thermoplasma
acidophilum 1,564,905 1,509
Methanococcus
jannaschii 1,664,970 1,783
Aeropyrum pernix 1,669,695 1,885
Methanobacterium
thermoautotrophicum 1,751,377 2,008
Những vi sinh vật đơn bào như vi khuẩn điển hình nhưng gen của họ như vậy là khác với cả vi khuẩn và sinh vật nhân chuẩn mà họ được phân loại trong một vương quốc
Haemophilus
influenzae 1,830,138 1,738 vi khuẩn gây nhiễm trùng tai giữa Streptococcus
pneumoniae 2,160,837 2,236 các phế cầu khuẩn
Nhóm A; nguyên nhân dịch bệnh thường xuyên của bệnh viêm màng não ở những nước kém phát triển
Neisseria meningitidis 2,272,351 2,221 Nhóm B, là nguyên nhân thường
gặp nhất của viêm màng não ở Mỹ
Encephalitozoon
cuniculi 2,507,519 1,997
(Cộng thêm 69 gene RNA), một
ký sinh eukaryote
Propionibacterium
Listeria
monocytogenes 2,944,528 2,926
2853 của các protein này mã hóa; các RNA phần còn lại
Trang 3radiodurans vi khuẩn lưu ý khả năng chống
chịu thiệt hại bức xạ
xanh-màu xanh lá cây tảo")
Vibrio cholerae 4,033,460 3,890 trong 2 nhiễm sắc thể, gây ra bệnh
tả
Mycobacterium
tuberculosis 4,411,532 3,959 nguyên nhân gây bệnh lao
Mycobacterium leprae 3,268,203 1,604 nguyên nhân gây bệnh phong
Bacillus subtilis 4,214,814 4,779 vi khuẩn khác
E coli K-12 4,639,221 4,377 4290 của các gen này mã hóa
protein, các RNA phần còn lại
căng thẳng đó là gây bệnh cho người; có 1.346 gen không tìm thấy trong E coli K-12
Agrobacterium
biến đổi gen ; cổ phiếu nhiều gen với meliloti Sinorhizobium
Salmonella enterica
var Typhi 4,809,037 4,395
+ 2 plasmid với 372 gene hoạt động, nguyên nhân gây bệnh thương hàn
Salmonella enterica
var Typhimurium 4,857,432 4,450
+ 1 plasmid với 102 gene hoạt động
Yersinia pestis 4,826,100 4,052 trên 1 nhiễm sắc thể + 3 plasmid;
gây bệnh dịch hạch Schizosaccharomyces
Phân hạch nấm
men Một eukaryote với gen ít
hơn so với bốn vi khuẩn dưới đây Ralstonia
đất cho các nhà máy vi khuẩn gây bệnh nhiều; 1681 của các gen của
nó vào một plasmid lớn
Pseudomonas
aeruginosa 6,3 x 10 6 5,570
Ngày càng phổ biến gây ra các nhiễm trùng cơ hội ở người
Streptomyces
Một xạ khuẩn có thân nhân cung cấp cho chúng tôi nhiều thuốc kháng sinh
Trang 4Sinorhizobium
Các vật cộng sinh sinh cố định
gồm một nhiễm sắc thể và 2 plasmid lớn
Saccharomyces
cerevisiae 12,495,682 5,770
Nấm men nảy chồi Một eukaryote
Cyanidioschyzon
Plasmodium
falciparum 22,853,764 5,268
Plus 53 RNA gen Nguyên nhân dạng nguy hiểm nhất của bệnh sốt rét
Thalassiosira
Một tảo cát 144 Plus lạp lục và
40 loại protein mã hóa gene ti thể
Neurospora crassa 38,639,769 10,082 498 Plus RNA gen
Sinh vật đơn bào này tự do sống cuộc sống như amoeboid một cả hai và tạo thành một flagellated
4133 của các gen của nó cũng được tìm thấy ở sinh vật nhân chuẩn khác cho thấy rằng họ đã có mặt trong
tổ tiên chung của tất cả các sinh vật nhân chuẩn Sự đa dạng về chức năng mã hóa bởi các gene cũng cho rằng tổ tiên chung của tất
cả các sinh vật nhân chuẩn tự nó
đã phức tạp như nhiều ngày nay các thành viên đơn bào
Caenorhabditis
elegans 100,258,171 21,733
trình tự
Arabidopsis thaliana 115,409,949 ~
28.000
kín ) Xem lưu ý
Drosophila
melanogaster 122,653,977
~ 17.000 các "ruồi"
Tetraodon nigroviridis
Mặc dù Tetraodon dường như có nhiều gen mã hóa protein hơn so với chúng tôi, nó đã ít hơn
Trang 5nhiều "rác" DNA vì vậy tổng số
bộ gen của nó là khoảng một phần mười kích thước của chúng ta
Con hải đởm 8,14 x 10 8 ~
23.300
Cá ngựa vằn 1,2 x 10 9 15,761
23.000
Lưu ý: Tổng gen cho Borrelia burgdorferi là dựa trên 853 gene trên nhiễm
sắc thể đơn của nó (trong 910.724 cặp cơ sở) cộng với 430 gen vào ngày 11
Arabidopsis thaliana là một nhà máy (trong gia đình mù tạc) có bộ gen nhỏ nhất được biết đến trong vương quốc thực vật và vì lý do này đã trở thành một yêu thích của các phân tử sinh học thực vật
Mặc dù Psilotum nudum (đôi khi được gọi là "đánh kem dương xỉ") là một
nhà máy đến nay đơn giản hơn so với cây Arabidopsis (nó không có lá thật, hoa, hoặc trái cây), nó có 3000 lần DNA nhiều Không ai biết tại sao, nhưng
truyền Đây cũng là trường hợp đối với một số động vật lưỡng cư, trong đó có
30 lần như DNA nhiều như chúng tôi nhưng chắc chắn không phải 30 lần như phức tạp
Tổng số lượng DNA trong bộ gen đơn bội được gọi là của nó C giá trị Việc
thiếu một mối quan hệ phù hợp giữa giá trị C và phức tạp của một sinh vật (ví
Có bao nhiêu gen hiện nó đi để làm cho một sinh vật?
Trang 6Các nhà khoa học tại Viện Nghiên cứu gen (nay là J Craig Venter Institute) đã
xác định các genitalium Mycoplasma đã theo trình tự làm việc này bằng cách
xem những cái cần thiết cho cuộc sống và đó là có thể bỏ Trong số 485-gen mã hóa protein, họ đã kết luận rằng chỉ có 381 trong số đó là thiết yếu cho cuộc sống