phân loại proteomics

PHÂN LOẠI PROTEOMICSNguyễn Phương Mai, Lê Thị Liễu, Phương, Quy... PROTEOMICS BIỂU HIỆN 1 Nhận biết protein và phân tích định tính chất lượng  Phân tích thành phần các protein riêng bi

PHÂN LOẠI PROTEOMICS

Nguyễn Phương Mai, Lê Thị Liễu, Phương, Quy

PROTEOMICS BIỂU HIỆN (1)

 Nhận biết protein và phân tích định tính (chất lượng)

 Phân tích thành phần các protein riêng biệt có trong hỗn hợp protein phức tạp

 Nhận biết các yếu tố cấu thành và phân tích số lượng tổng hợp

 Phương pháp nghiên cứu:

 2DGE: điện di hai chiều

 HPLC: sắc ký lỏng cao áp

 MS: mass spectrometry

 MultiD-LC, multidimensional liquid chromatography

PROTEOMICS BIỂU HIỆN (2)

 Hàng nghìn loại protein có thể được phân tách, định lượng và nhận biết nhanh chóng

 Nhận biết các loại protein được sản xuất trong tế bào

 Nhận biết các loại protein biểu hiện khác nhau giữa các mẫu khác nhau và các đặc điểm biến đổi trước quá trình dịch mã

PROTEOMICS BIỂU HIỆN (3)

 Định nghĩa:

 Các thay đổi trong biểu hiện protein trong các quá trình biệt hoá, tăng sinh và truyền tín hiệu của các tế bào cả về mặt chất lượng và định lượng

 Tính chất:

 Nghiên cứu về sự biểu hiện của gene

 Trình tự quá trình điều khiển trong các giai đoạn mà một tế bào

hoặc một tổ chức cơ thể phải trải qua trong suốt quá trình sống

PROTEOMICS CHỨC NĂNG

 Định nghĩa:

amino acid

 Tính chất

PROTEOMIC CẤU TRÚC (1)

 Trình tự, cấu trúc và chức năng của protein

có liên hệ mật thiết với nhau

 Là cơ sở cho ngành Tin sinh học trong nghiên cứu lưu trữ, giới thiệu, so sánh và dự đoán

các cấu trúc protein

PROTEOMIC CẤU TRÚC (2)

 Định nghĩa

 Nghiên cứu tính di truyền và các tương tác lý học giữa các protein cũng như các tương tác giữa các protein và nucleic acids hoặc các phân tử nhỏ

 Phân tích các tương tác protein có thể cung cấp không chỉ chức năng của từng loại protein mà còn về chức năng của protein trong các hệ thống và các phức hợp

PROTEOMIC TƯƠNG TÁC (1)

 Cung cấp các thông tin có liên quan đến proteomics chức năng và phân tích vị trí protein trên phạm vi rộng

 Thiết kế bản đồ liên kết proteome dựa trên các tương tác đôi giữa các protein và các tương tác cao hơn được nhận biết bởi hệ thống phân tích các phức hợp protein

 Các phương pháp sử dụng:

 HTI: high-throughput imaging

 Y2H: yeast two hybrid system

PROTEOMIC TƯƠNG TÁC (2)

PROTEOMIC TƯƠNG TÁC (3)

Twyman R M 2004 Principles of proteomics BIOS Scientific Publishers p35