Can thiệp RNA là một cơ chế được bảo tồn trong sinh vật đa bào nhằm giúp tế bào ức chế biểu hiện một gene khi trong tương bào có sự xuất hiện một chuổi xoắn kép RNA có trình tự giống với
Trang 1RNA interference
và Ung thư
Đây là bài viết của anh Ngô
Vũ thay mặt các thành viên Sinh
học Việt Nam gửi đến gia đình
anh Trần Hoàng Dũng thay cho nén nhang tưởng nhớ đến thân phụ của anh Bác mới từ trần do căn bệnh Ung thư tuyến giáp, hưởng thọ 56 tuổi
Bản báo cáo về ung thư trên toàn
Trang 2cầu củaTổ chức Y Tế Thế Giới
(WHO) vào năm 2003 đã nhận định ung thư là một trong những nguyên nhân hàng đầu dẩn đến tử vong, với hơn mười triệu chẩn đoán mới mỗi năm [1] Cũng theo bài tường thuật này, rất hiếm có gia đình nào không
bị ảnh hưởng của ung thư; môt căn bệnh hiểm nghèo không những là gánh nặng cho người bệnh mà cũng
là nổi đau của gia đình và bạn bè
thân quyến Với một tỉ lệ báo động, một phần tư dân số sẽ mắc phải ung thư trong một đời người, căn bệnh này đang là thữ thách lớn cho nền y
tế cộng đồng Các nỗ lực nhằm
nâng cao hiệu quả việc phòng,
chống và phát hiện sớm ung thư -
Trang 3như ngưng hút thuốc, thay đổi chế
độ ăn uống, điều trị các bệnh viêm nhiễm, và chủ động khám sức khỏe hàng năm để sàng lọc sớm các khối
u - đang được thúc đẩy áp dụng
trên khắp quốc gia Song song với những biện pháp y tế cộng đồng để phòng chống ung thư, các phòng
thí nghiệm sinh học trên toàn thế giới đang ráo riết tìm kiếm và
không ngừng khám phá ra cơ chế phát sinh bệnh của tế bào ung thư ở mức độ tế bào và phân tử Trong
các tiến bộ gần đây, việc phát hiện
ra cơ chế can thiệp RNA (RNA
interference) và những thành công bước đầu về ứng dụng cơ chế này trong nghiên cứu ung thư đã đem
Trang 4đến một tiên đoán rằng đây sẽ là
một trong những hứa hẹn trong
việc tìm kiếm phương pháp trị liệu hữu hiệu cho căn bệnh nan giải
này Bài tóm tắt dưới đây sẽ sơ
lược qua cơ chế can thiệp RNA và những ứng dụng của nó trong cuộc chiến với ung thư
Can thiệp RNA là một cơ chế được bảo tồn trong sinh vật đa bào nhằm giúp tế bào ức chế biểu hiện một
gene khi trong tương bào có sự
xuất hiện một chuổi xoắn kép RNA
có trình tự giống với gene này Đây
có lẽ là hệ thống tự vệ của tế bào nhằm chống lại sự xâm nhập của siêu vi khuẩn và các phần tử di
Trang 5truyền ngoại lai khác, những yếu tố
sử dụng chuổi kép RNA trong chu
kỳ sống của chúng Sự khám phá ra
cơ chế can thiệp RNA bởi Fire và đồng nghiệp [2] đã đánh dấu một bước ngoặt quan trọng trong việc nâng cao tầm hiểu biết về vai trò
điều khiển biểu hiện gene của phân
tử RNA, ngoài hai vai trò đã được biết từ lâu của phân tử này (vai trò trung gian, phiến mã của vật chất di truyền - mRNA - và vai trò cấu trúc trong bộ máy biểu hiện protein -
ribosome RNA vàtRNA)
Cơ chế can thiệp RNA Khi tiêm
các phân tử chuổi xoắn kép RNA vào tế bào của một sinh vật đa bào,
Trang 6người ta đã phát hiện ra một chuổi phản ứng mà kết quả là các phân tử phiên mã mRNA của tế bào có
trình tự giống với trình tự của phân
tử RNA ngoại lai sẽ bị tiêu hũy Sự tiêu hũy phiên mã mRNA này ngăn chận sự biểu hiện của gene ra
protein, phân tử thực sự thực hiện các chức năng của tế bào Cơ chế can thiệp vào sự biểu hiện của vật chất di truyền (gene) ở giai đoạn
RNA nên được gọi là cơ chế can
thiệp RNA.Các phần tử quan trọng tham dự vào cơ chế can thiệp RNA này là hai enzymes, Dicer và
Argonaute, và những mẫu ngắn
RNA can thiệp (siRNA) Khi có sự xâm nhập của chuổi xoắn kép RNA
Trang 7vào tương bào, Dicer lập tức cắt
những chuổi kép RNA này ra
những đoạn ngắn hơn, khoảng
21-28 nucleotides, gọi là những mẫu ngắn RNA can thiệp Sau khi bị cắt ngắn bởi Dicer, chuổi kép RNA can thiệp được tách ra làm hai chuổi
đơn, và chỉ một chuổi đơn RNA
với đầu 5' có lực bắt cặp base
(base-pairing) nhỏ nhất được chọn
để tiếp tục liên kết với Argonaute Quá trình lựa chọn chuổi đơn RNA này xảy ra trong phức hệ RISC
(RNA-induced silencing complex), trong đó có chứa Argounaute và
Helicase Phức hệ RISC sau đó
thâu nhận các phân tử phiên mã
mRNA của tế bào có trình tự tương
Trang 8đồng với trình tự của đoạn chuổi
đơn RNA can thiệp lúc này đang có mặt trong phức hệ RISC Sau khi nhận dạng mRNA qua việc bắt cặp các bases tương đồng với trình tự của chuổi đơn RNA can thiệp,
mRNA bị cắt đứt ở khoảng giữa
của chuổi kép siRNA-mRNA Sau khi bị cắt đứt, mRNA nhanh chóng
bị tiêu hũy bởi các RNA nuclease (Hình 1)
Micro-RNA Ngay sau khi phát
hiện ra cơ chế can thiệp RNA,
người ta nhanh chóng nhận ra rằng,
cơ chế này đã được sữ dụng từ lâu trong tế bào bởi một hệ thống điều hòa biểu hiện gene gọi là
Trang 9micro-RNA (mimicro-RNA) Hơn mười năm trước đây, Lee và đồng nghiệp [3] nghiên cứu trên mô hình giun (C elegans) đã phát hiện gene lin-4 không những không cho ra phiên
mã mRNA như các gene thông
thường khác mà chỉ sinh ra những phân tử nhỏ RNA Một điều ngạc nhiên là những phân tử nhỏ RNA này lại tương tác với phiên mã
mRNA của một gene khác, gene lin-14, và ức chế biểu hiện của
gene lin-14 này Nhiều khám phá liên tiếp sau đó cho thấy rằng hệ thống điều hòa biểu hiện gene ở giai đoạn RNA này cũng được tìm thấy trong các loài động vật khác như ruồi giấm và người, chứng tỏ
Trang 10rằng cơ chế này được bảo tồn trong quá trình tiến hóa Ngày nay, người
ta ước lượng có khoảng 500 genes cho miRNAs và khoảng vài ngàn genes là tâm điểm của hệ thống
hoạt động miRNAs [4]
Mặc dù các nhà nghiên cứu vẫn
chưa thực sự hiểu rỏ làm thế nào
miRNA ức chế sự biểu hiện của
mRNA, cơ chế miRNA có nhiều
điểm tương đồng với cơ chế can
thiệp RNA.Trong tế bào động vật, khi những phân tử micro-RNA đầu tiên (gọi là pri-miRNAs) được tạo
ra trong nhân qua quá trình phiến
mã từ gene, pri-miRNAs được cắt gọt bởi một enzyme có mặt trong
Trang 11nhân gọi là Drosha để tạo thành
những sợi pre-miRNAs Các
premiRNA sau đó được di chuyển
ra ngoài tương bào và tương tác với enzyme Dicer rồi kế tiếp là phức hệ RISC như trình bày ở trên Một
điều đáng chú ý là, ở thực vật
miRNA ức chế biểu hiện mRNA
chủ yếu qua sự tiêu hũy mRNA,
trong khi đó ở động vật miRNA
can thiệp chủ yếu bằng cách ức chế quá trình dịch mã của mRNA Độ tương đồng trong trình tự của
miRNA với mRNA trong phức hệ RISC sẽ quyết định mRNA sẽ bị
cắt và tiêu hũy hay chỉ làm im lặng quá trình dịch mã của mRNA Nếu trình tự của miRNA giống hệt với
Trang 12trình tự của mRNA, mRNA sẽ bị tiêu hũy Nếu trình tự của miRNA tính từ đầu 5' chỉ cần tối thiểu
tương đồng với mRNA từ
nucleotide vị trí số 2 đến số 8 thì cơ chế miRNA sẽ kích hoạt, tức là chỉ chặn đứng sự dịch mã mà không
làm tiêu hũy mRNA Vai trò của
miRNA trong quá trình phát triển, tiến hóa và bệnh tật ở động vật đã được thảo luận một cách rỏ ràng
trong một bài viết bởi Plasterk [5]
Trang 13Hình 1 Cơ chế can thiệp RNA (http://www.rnaiweb.com)
Ứng dụng cơ chế can thiệp RNA trong nghiên cứu ung thư Tế bào
Trang 14ung thư phát sinh từ sự tích lũy và chọn lọc nhiều đột biến liên tiếp có lợi cho sự phân chia và tồn tại của chúng Những biến đổi di truyền và đôi khi trên vật chất di truyền
(epigenetic) giúp tế bào ung thư
vượt qua được sự khống chế của
các nguyên tắc điều hòa tế bào và
cơ thể, như chương trình tự sát tế bào (apoptosis) hoặc các tín hiệu kìm hảm phân chia
(antiproliferative signals) Quá
trình biến dạng từ một tế bào bình thường sang một trạng thái không tuân lệnh và thường là nguy hiểm cho sự ổn định của cơ thể chủ thoạt đầu được nghĩ là một điều kiện
chọn lọc chỉ có lợi cho tế bào ung
Trang 15thư Nhưng khi nhìn kỹ vào cách thức sinh tồn của tế bào ung thư
người ta dần dần hiểu rằng sự tích lũy nhiều đột biến di truyền cũng làm cho tế bào ung thư dể dàng
nhạy cảm với những thay đổi xung quanh Thí dụ một dạng ung thư đã thành công trong việc tăng cường sản phẩm của gene A hoặc làm
giảm hoạt động của gene B Dạng ung thư này trỡ thành "nghiện" với
sự có mặt liên tục của sản phẩm
gene A hoặc sự vắng mặt của gene
B Khi tế bào ung thư này đột ngột
bị mất đi nguồn sinh tồn là sản
phẩm gene A hoặc thình lình chạm trán với sản phẩm gene B, nó sẽ
không còn trong lợi thế sinh tồn
Trang 16mãi mãi nữa và có thể bị diệt vong Hiểubiết những chổ yếu này của tế bào ung thư sẽ giúp tìm ra được
phương tiện tấn công và tiêu diệt tế bào ung thư một cách đặc hiệu
Sự khám phá ra cơ chế can thiệp
RNA không lâu được nhận thức
rằng đây chính là công cụ cần thiết
để dò tìm các cơ chế phân tử bị
thay đổi trong tế bào ung thư Do tính đặc hiệu của quá trình can
thiệp RNA kết hợp với tính dể dàng nhân rộng tiến trình thực nghiệm từ hàng ngàn gene lên tới toàn bộ
genome trong một thí nghiệm, hệ thống các "điểm yếu" của nhiều
dạng ung thư sẽ nhanh chóng được
Trang 17giải mã và hàng loạt thuốc đặc hiệu cho từng loại ung thư sẽ được điều chế dựa trên hệ thống điểm yếu
này
Các nhà nghiên cứu đã dùng nhiều phương pháp để đưa RNA can
thiệp vào tế bào với mục đích khám phá các đường tín hiệu song tồn chỉ
có ở tế bào ung thư Nhiều phương pháp bắt đầu từ việc xây dựng một thư viện chứa các đoạn RNA can thiệp cho toàn bộ gene RNA can thiệp có thể được tổng hợp từ hóa chất, từ sản phẩm PCR, từ DNA
plasmids, hay từ retrovirus Sau khi
có được những thư viện này, người
ta đưa chúng vào tế bào và bắt đầu
Trang 18sàng lọc để tìm ra đoạn RNA có
độc tính đối với ung thư rồi từ đó giúp suy ra cơ chế phân chia không điều khiển của tế bào ung thư
Phương pháp thư viện RNA can
thiệp cũng có thể được dùng để xây dựng một cây phân loại chức năng cho nhiều loại ung thư Những cây phân loại chức năng này sẽ giúp
thúc đẩy quá trình điều chế thuốc đặc hiệu chống ung thư
Mặc dù cuộc chiến chống ung thư
có thể còn kéo dài, hiểu biết về ung thư được nhanh chóng tăng lên do
có nhiều tiến bộ về phương pháp
cũng như công cụ nghiên cứu, mà quan trọng và gần đây nhất là can
Trang 19thiệp RNA Kiến thức mới về cơ
chế ung thư càng tăng dẫn đến
nhiều hy vọng tìm ra thuốc trị có
hiệu quả nhất Khi những hiểu biết mới này kết hợp với các kiến thức tích lũy từ trước đến nay trong việc phòng và chống ung thư như được
đề cập đến trong bản báo cáo về
ung thư trên toàn cầu của tổ chức Y
tế thế giới, chúng ta có quyền hy
vọng rằng ung thư không còn là căn bệnh đáng sợ nữa ở thế kỹ 21