Phụ lục hướng dẫn

Phụ lục hướng dẫn KẾT QUẢ HOẠT ĐỘNG KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ CÔNG BỐ NĂM 2018 Số TT Nội dung Đơn vị chủ trì, Tác giả Tóm tắt nội dung Ghi chú I SÁCH 1 Quản lý sức khoẻ tôm nuôi nước lợ Đặng Thị Lụa, Trươ[.]

Số

TT Nội dung Đơn vị chủ trì,

1 Quản lý sức khoẻ tôm

nuôi nước lợ

Đặng Thị Lụa, Trương Thị Mỹ Hạnh, Phan Thị Vân

Nhà xuất bản Nông nghiệp (2018)

BÀI BÁO QUỐC TẾ

1

Species identification

using DNA barcoding

on processed Panga

catfish products in Viet

Nam revealed important

mislabeling

Tran Thi Thuy Ha, Nguyen Thi Huong, Nguyen Phuc Hung, Yann Guiguen

Nucleotide sequences of the Cytochrome oxidase subunit I gene and Cytochrome b were analyzed for 10 processed fish products collected from supermarkets in Hanoi, Viet Nam The similarity between our results and published data from the NCBI and BOLD was compared to identify species This molecular analysis showed that the common names of only 4 of these products matched with their corresponding scientific names The other six were mislabeled with an important mislabeling from

P hypophthalmus into P boucourti Although no commercial frauds were found in

these mislabelled products, the correct scientific names of fish species should be labelled for the processed products as they are in supermarkets

Turkish Journal of Fisheries and Aquatic Sciences, 18: 457-

462 (2018)

Tra catfish (Pangasianodon hypophthalmus) is a commercially important aquaculture species in the Mekong Delta, Vietnam; accounting for approximately 60% of

Vietnam freshwater fish production However, the food trade globalization and the growing demand for selected varieties of food have led to the intensification of commercial fraud, especially in the form of substitution species and mixing with cheaper taxa DNA bar-coding methods have shown a potential well proven molecular approach to assess the authenticity of food items In this study, we utilized high throughput NextSeq500 sequencing to capture and identified SNP markers on

400 wild and farming catfish individuals from 8 Vietnamese provinces (e.g., An Giang, Dong Thap, Can Tho, Tien Giang, Ben Tre, Hau Giang, Vinh Long, and Ho Chi Minh City) and 10 international locations of Cambodia, Thailand and

MOJ Current Research

&

Reviews, Vol 1 (1),

2018

Bangladesh Stringent filtering of SNP-calling parameters resulted in 11,009 SNP loci represented across all 4 countries We utilized the VCF tools to validate two panels of SNPs selected from the NGS data Selection criteria included SNPs shared between catfish’s Vietnam and international populations, and SNPs specific to each

population A total of 780 and 809 SNPs were filtered in Vietnamese and international catfishes, respectively, the final 12 special SNPs were detected SNP validation by using Sanger sequencing and PCR showed a result of 2 per 12 SNPs was confirmed successfully in 300 individuals from Vietnamese catfishes The first times our results provide genotype informative marker loci in Vietnamese Tra catfish

in order to approach molecular traceability in aquaculture species with minimal previous genetic information

The genetic relationship of some Asiatic hard clam (Meretrix meretrix) based on mtDNA COI sequence analysis was investigated for populations collected in Thai Binh, Nam Dinh, Nghe An provinces in Vietnam In addition, this research also targets at species identification based on COI sequences In total of 59 sequences analyzed, 19 sequences belonged to Meretrix meretrix species with Gen Bank accession number DQ399399.1 17 sequences of M meretrix were used for genetic relationship analysis among 3 populations In which, 6 polymorphic sites, 3

parsimony informative sites and 4 haplotypes observed for the COI gene Moderately genetic population diversity was observed, overall haplotype and nucleotide diversity were 0.476±0.233 and 0.00151±0.00069, respectively Generally, genetic

differentiation (FST) (FST < 0.15) was moderate The genetic distance was rather low, which ranged from 0.001 (Thai Binh–NgheAn, Thai Binh–Nam Dinh

populations) to 0.002 (Nam Dinh – Nghe An populations) The result of haplotype network constructing indicated that populations shared common haplotype and there was no specific isolation of the haplotypes of the populations Hence, it showed M

meretrix populations had intimate genetic relationship The result of phylogenic tree indicated that three M meretrix populations (Thai Binh, Nam Dinh, Nghe An) had a very small or no genetic variation among populations

Journal of Aquacultu

re & Marine Biology, Volume 7 Issue 1 -

2018

anthropogenic influences (e.g., agriculture, urbanization) Moreover, collecting sufficient high-quality data to increase the statistical power remains a challenge The severely altered conditions (e.g., generation of very deep lakes) also lead to

difficulties for standardized data collection We see future opportunities in the integration of models to improve the understanding of the different processes affected

by hydropower dam development and operation, as well as the use of remote sensing methods for data collection

Case Study from The

Guayas River Basin

(Ecuador)

Thi Hanh Tien Nguyen 1,2, Marie Anne Eurie Forio 1,*, Pieter Boets 1,3 , Koen Lock 1, Minar Naomi Damanik Ambarita

1, Natalija Suhareva 1,4, Gert

The Guayas River basin is one of the most important water resources in Ecuador, but the expansion of human activities has led to a degraded water quality The purpose of this study was (1) to explore the importance of physical-chemical variables in

structuring the macroinvertebrate communities and (2) to determine if the thresholds

in stream velocity related to macroinvertebrate community composition could be identified in the Guayas River basin Thus, macroinvertebrates and physical–chemical water quality variables were sampled at 120 locations during the dry season of 2013

in the Guayas River basin Canonical correspondence analysis (CCA) was performed

to identify relevant physical–chemical characteristics of the river influencing the

Water

2018, 10, 1195; doi:10.3390/w10091195; Page 2-17

Everaert 1 , Christine Van der heyden 5, Luis Elvin Dominguez-Granda 6, Thu Huong Thi Hoang 7; and Peter Goethals

distribution of the macroinvertebrate communities Threshold indicator taxa analysis (TITAN) was used to discriminate between the macroinvertebrate community related

to stagnant waters (Daule–Peripa reservoir) and to running waters CCA indicates that the most important environmental factors influencing the distribution of

macroinvertebrate communities were stream velocity, chlorophyll concentration, conductivity, temperature and elevation Tipping points for the macroinvertebrate community were defined by stream velocity at 0.03 m/s and 0.4 m/s, i.e., stagnant-water (including dam-related

reservoirs)taxastarttoquicklydecreaseinabundanceandfrequencyat0.03m/swhilerunning-water

taxastarttoquicklyincreaseinabundanceandfrequencyat0.03m/suntilastreamvelocityof0.4m/s The results provide essential information to define environmental flows to further support water management plans of the Guayas River basin Information obtained wil

To isolate and characterise free nitrogen-fixing bacteria, we collected randomly soil samples from different areas of Ha Noi Nitrogen-fixing bacteria were isolated using Burk’s medium without nitrogen mineral supplement The ammonia (NH4+

) synthesis

of these bacterial strains after biomass production was determined by means of Nessler reagent Based on the results of isolation, we observed and evaluated colony and cellular morphology, pigment production,

and metabolic activities of twenty-five isolates Among the isolated bacteria, two bacterial strains (6.2 and 8.2) with high NH4+

concentration in the cultural medium were selected as the best strains for fixing ability The optimal pH and temperature for

nitrogen-their growth and nitrogen fixation are 7.0 and 30°C, respectively Growth is best favored in the presence of sucrose We sequenced the 16S rRNA gene of selected strains and compared the homology of them in GenBank using BLAST search The result of the comparison shows that the 6.2 and 8.2 strains have 99% and 100% 16S

Vietnam Journal of Science, technolog

y and engineerin

g Vo; 60,

No 3 Sep, 2018 Page 48-

54

rRNA-sequence similarity with Pseudomonas sp and Bacillus sp., respectively

Inland Saline Water

Ha Thi Thu Bui, Trong Quoc Luu and Ravi Fotedar

Potassium-fortified inland saline water (K+ISW) has shown potential for growing marine species, including seaweed species The response of a brown seaweed

species, Sargassum podacanthum, to nitrogen and phosphorus enrichments were

evaluated by culturing the species for 84 days in K+ISW and comparing it with Ocean Water (OW) The culture media were enriched weekly with ammonium chloride and sodium dihydrogen phosphate, with ammonium and phosphate ratios of 10:1 at five different concentrations 80:8, 120:12, 160:16, 200:20 and 240:24 μM The culture medium with no enrichment was used as a control The water quality and biomass

of S podacanthum were measured fortnightly The S podacanthum biomass increase

significantly with different concentrations of the nutrient supplementations The

standing biomass and Specific Growth Rate (SGR) of S podacanthum were similar in

OW and K+ISW in the absence of any nutrient supplementation and at the supplement concentration of ammonium and phosphate 160:16 μM However, from day 42

onwards, at the ratios of 80:8, 120:12, 200:20 and 240:24, S podacanthum cultured in

OW grew significantly faster than in K+ISW In K+ISW, optimal growth of S

podacanthum was observed at the 160:16 and the increase in biomass was

significantly higher than the initial biomass until day 70, whereas at the other four

nutrient supplement concentrations, the S podacanthum biomass remained

unchanged during the entire culture period The nitrite, total Kjeldahl nitrogen and phosphate concentrations in water were found to be significantly (p<0.05) and

negatively correlated (p<0.05) with S podacanthumbiomass Therefore, the results

showed that the enrichment of 160 μM ammonium and 16 μM phosphate is required in the K+ISW for S podacanthum to achieve optimal growth

American Journal of Applied Sciences

Volume

15, Issue 3

Pages 161; DOI : 10.3844/ajassp.2018.149.161

This study tested the effects of temperature and pH on water quality and the growth

of Sargassum linearifolium and S podacanthum in potassium-fortified Inland Saline

Water (ISW) of Western Australia (WA), at two levels of pH (low pH range of 6.5 and ambient pH 7.0-8.2) and two levels of temperature (high temperature 26-27°C and ambient room temperature of 20-22°C) in triplicate for 42 days The pH of ISW

5.5-American Journal of Applied Science,

15 (3),

potassium-fortified

inland saline water

in WA varies from 3.9 to 9.1, whereas the temperature is from 6.1-28.1°C The results showed that the high temperature initiated the mortalities of the

both Sargassum species from the first 14 days of culture period The high temperature

also resulted in a reduction of dried weight and ash content of these two species

of Sargassum by the end of the trial S linearifolium temperature tolerant threshold was larger than S podacanthum Since the day 14, the S linearifolium biomass and specific growth rate were higher than S podacanthum at both temperature levels under ambient pH Higher crude protein in S linearifolium than S podacanthum was

also recorded at high temperature Ambient pH and ambient temperature resulted in higher biomass and higher specific growth rate than low pH and high temperature in

both species, which is recommended for Sargassum spp growth

186-197 DOI: 10.3844/ajassp.2018.186.197

9

Impact assessment of

local land use on

ecological water quality

of the

Guayas river basin

(Ecuador)

Minar Naomi Damanik-Ambaritaa, Pieter Boets, Hanh Tien Nguyen Thi, Marie Anne Eurie Forio, Gert Everaert, Koen Lock, Peace Liz Sasha

Musonge, Natalija Suharevae, Elina Bennetsena, Sacha Gobeyna, Tuan Long Hoa, Luis Dominguez-Grandaf, Peter L.M Goethalsa

Extensive anthropogenic activities including land conversion have been taking place

in the Guayas river basin (Ecuador) due to increasing population growth Land use changes are considered one of the key sources affecting the ecological water quality

of the Guayas river basin Therefore, we investigated the effect of land use on the ecological water quality both within direct vicinity and within a distance of 200 m from the sampling sites We investigated which of three land use assessment methods (i.e data retrieved from field protocols, from aerial

pictures (Google maps) and from GIS data) is most suitable to quantify the impact of local land use on the ecological water quality and which key environmental variables influence the ecological water quality To do so, we collected data on

macroinvertebrates and environmental variables from 120 sampling sites throughout the river basin during an integrated sampling campaign The Biological Monitoring Working Party adapted for

Colombia (BMWP-Col) was calculated and used to assess the ecological water quality status of the river basin, based on macroinvertebrates The relation between the BMWP-Col, local land use and other environmental variables was investigated using generalized linear models (GLMs) and sensitivity analyses Based on

multimodel

Ecological Informatics; Volume

48, November

2018, Pages 226-

237

comparison, the ecological water quality was best associated with the land use close

to the sampling sites (field protocol, R2 = 0.93, p < 0.05) Models involving land use assessed using aerial pictures, field protocols and GIS data were associated mainly with hydromorphological variables However, the models incorporating land use evaluated on a larger spatial scale (i.e Google maps and GIS maps) were also associated with physicalchemical variables Although, the land use assessment based

on aerial pictures using Google maps” had the best outcome, a combined approach using field observation and aerial pictures can provide comprehensive land use data to the water management and provides the most complete information to define local land use of the sampling sites

10

Quality of antimicrobial

products used in white

leg shrimp (Litopenaeus

vannamei) aquaculture

in Northern Vietnam

Kim Chi Tran, Minh Phu Tran, Thi Van Phan, Anders Dalsgaard

Antimicrobials are important to treat diseases in aquaculture and the objective of this study was to evaluate the quality of antimicrobial products commonly used in white leg shrimp (Litopenaeus vannamei) aquaculture in Northern Vietnam A total of 25 antimicrobial products were obtained from 20 chemical shops including 12 products declared to contain a single antimicrobial, nine products with a mixture of two different antimicrobials and four products containing a mixture of three different antimicrobials Ultra High Performance Liquid Chromatography coupled to Mass Spectrometry was used to analyse the concentration of the declared antimicrobials

Results revealed that only 1/12 products with a single antimicrobial contained an active substance within± 10% (accepted level of variation) of the concentration declared on the product label More than half of the products contained antimicrobial concentrations within< 1.0% to 90% of the declared concentration The majority of the products provided inadequate or incorrect information on specific diseases to be treated, instructions on how to prepare medicated feed, withdrawal time, as well as instructions about personal protection measures The documented poor quality of antimicrobial products and inadequate labelling has negative impacts

on effective disease treatment; contribute to development of antimicrobial resistance, and the use of such products is associated with food safety and occupational health hazards There is an urgent need to strengthen diagnostic services, legislation and

Aquacultu

re Volume

482, 1 January

2018, Pages 167-

175

control of antimicrobial products in shrimp aquaculture and educate farmers on prudent antimicrobial use practices

11

Harvesting procedures,

welfare and shelf life of

ungutted and gutted

Shortfin pompano (Trachinotus falcatus) were harvested from a floating cage culture

Handling stress (blood pH, white muscle pH, and rigor mortis) and welfare (“eye roll”) were determined for two harvesting methods: (i) batch netting and transfer to ice-slurry where the fish were killed and chilled (commercial method) and, (ii) transfer of fish to a tub immersed in the cage before it was lifted onto a barge where the fish were euthanised by an AQUI-STM overdose Half of the ice-slurry fish were gutted All fish were subsequently stored for 18 d in ice for

assessment of freshness (total bacterial counts, TBC and Quality Index Method, QIM)

as well as skin and eye color A modified QIM scheme for European sea bass was used with demerit points ranging from 0 to 18 Due to excessive swimming during crowding, both ice-slurry and AQUI-STM fish were harvested in an exhausted con-dition Upon sampling, none of the fish exhibited “eye roll”, indicating they were either unconscious or dead Since the ice-slurry fish were not stunned immediately, the welfare of the fish might have been compromised

During rapid chilling, the fish developed cloudy eyes The asset of using AQUI-STM was possibly better fish welfare during the stunning and euthanising phase since exposure to ice-slurry was associated with escape swimming behaviour and slow death Shortly after harvesting there were some significant differences between harvesting methods in terms of skin color They were, however, largely offset by storage for one day Only a few minor changes in skin color took place during further storage Changes in eye color were more prominent than for skin

After storage for more than a week, the TBCs of gutted fish were significantly higher compared with ungutted fish (P < 0.05) AQUI-STM fish (ungutted) exhibited the lowest TBCs for about the first two weeks indicating exposure to the anesthetic reduced bacterial growth After 18 d, none of fish from all treatments had yet reached the generally accepted spoilage level of 7 log cfu g−1 At this point, the fish had not reached the maximum attainable QI score of 18 High linear correlations (R ≥ 0.972,

Aquacultu

re 498, 236-245

P < 0.001) were achieved for development of QI during ice storage where the ungutted and AQUI-STM treatments were practically similar The modified QIM scheme was considered suitable for pompano The shelf life was tentatively considered to be approximately 18 d, although this should to be verified by other, supplementary methods To prolong shelf life, it is recommended that pompano is not gutted before they are subjected to chilled storage

T S., Sampels, S., Kolarova, J., Grabic, R., Turek, J., Randak, T., Zlabek, V

Sewage treatment plants (STPs) are one of the major source of pharmaceuticals and personal care products in the aquatic environment Generally, the effects of individual chemicals on fish are studied under laboratory conditions, which leads to results that are potentially not realistic regarding the effects of these chemicals under

environmental conditions Therefore, in this study, common carps were held in exposed pond that receive water from STP effluents for 360 days under natural conditions Elimination of xenobiotics starts in the fish intestine, in which the microbial community strongly influences its function Moreover, the fish intestine functions as crucial organ for absorbing lipids and fatty acids (FA), with consequent transport to the liver where their metabolism occurs The liver is the primary organ performing xenobiotic metabolism in fish, and therefore, the presence of pollutants may interact with the metabolism of FA The catalytic activity of CYP1A and CYP3A-like enzymes, their gene expression, FA composition and intestinal microbiome consortia were measured The catalytic activity of enzymes and their gene and protein expression, were induced in hepatic and intestinal tissues of fish from the exposed pond Also, fish from the exposed pond had different compositions

of FA than those from the control pond: concentration of 18:1 n-9 and 18:2 n-6 were significantly elevated and the longer chain n-3 FA 20:5 n-3, 22:5 n-3 and 22:6 n-3 were significantly lowered There were clear differences among microbiome consortia in fish intestines across control and exposed groups Microbiome taxa measured in exposed fish were also associated with those found in STP activated sludge This study reveals that treated STP water, which is assumed to be clean, affected measured biomarkers in common carp

Science of the Total Environment 635: 1160–

1169 (IF=4.9),

2018

13

Biomarker response,

lipid composition, and

intestinal microbiome

in wild brown trout

(Salmo trutta m fario

L.) exposed to a sewage

treatment plant

effluent-dominated stream

Giang, P.T., Sakalli, S., Fedorova, G., Khalili, T.S., Bakal, T., Najmanova, L., Grabicova, K., Kolarova, J., Sampels, S., Zamaratskaia, G., Grabic, R., Randak, T., Zlabek, V., Burkina, V

Concerns about the effect of sewage treatment plant (STP) effluent on the health of freshwater ecosystems have increased In this study, a unique approach was designed

to show the effect of an STP effluent-dominated stream on native wild brown trout (Salmo trutta L.) exposed under fully natural conditions Zivny stream is located in South Bohemia, Czech Republic The downstream site of Zivny stream is an STP-affected site, which receives 25% of its water from Prachatice STP effluent

Upstream, however, is a minimally polluted water site and it is considered to be the control site Native fish were collected from the upstream site, tagged, and distributed

to both upstream and downstream sites After 30, 90, and 180days, fish were recaptured from both sites to determine whether the downstream site of the Zivny stream is associated with the effects of environmental pollution Several biomarkers indicating the oxidative stress and antioxidant enzyme activities, cytochrome P450 activity, xenoestrogenic effects, bacterial composition, and lipid composition were investigated Additionally, polar chemical contaminants (pharmaceuticals and personal care products (PPCPs)) were quantified using polar organic chemical integrative samplers (POCIS) Fifty-three PPCPs were detected in the downstream site; 36 of those were constantly present during the 180-day investigation period

Elevated hepatic 7-benzyloxy-4-trifluoromethylcoumarin-O-debenzyloxylase (BFCOD) (after 90days) and blood plasma vitellogenin concentrations in males were detected in fish downstream of the STP effluent during all sampling events An increase in the fishes' total fat content was also observed, but with low levels of ω-3 fatty acid in muscle tissue Two bacterial taxa related to activated sludge were found

in the intestines of fish from downstream Our results show that Prachatice STP is a major source of PPCPs in the Zivny stream, which has biological consequences on fish physiology

Science of the Total Environment 625: 1494–

1509 (IF= 4.9) 2018

Monitoring the contamination level in aquatic environments and assessing the impact

on aquatic life occurs throughout the world In the present study, an approach based

on a combination of biomarkers and the distribution of various industrial and municipal pollutants was used to investigate the effect of aquatic environmental

Ecotoxicology and environmental safety

Grabic, R., Velisek, J., Turek, J.,

Kolarova, J., Zlabek, V., Randak, T

contamination on fish Monitoring was performed in ten rivers in the Czech Republic (Berounka, Dyje, Elbe, Lužnice, Odra, Ohře, Otava, Sázava, Svratka, and Vltava rivers, with one or two locations in each river) at the same sites that were regularly monitored within the Czech National Monitoring Program in 2007-2011 Health status, hepatic ethoxyresorufin-O-deethylase (EROD) activity, total cytochrome P450 content, and the plasma vitellogenin concentration were assessed in wild chub

(Squalius cephalus) males caught at the monitored sites The contamination level was the highest in the Svratka River downstream of Brno Among all measured persistent organic pollutants (POPs), polychlorinated biphenyls and

dichlorodiphenyltrichloroethane and its metabolites were the major contributors of POPs in fish muscle Elbe, Odra, and Svratka rivers were identified as the most polluted Fish from these locations showed reduced gonad size, increased vitellogenin concentration in male plasma, EROD, and total cytochrome P450 content These biomarkers can be used for future environmental monitoring assessments Overall, this study improves our understanding of the relationship between human activities and pollutant loads and further contributes to the decision to support local watershed managers to protect water quality in this region

(IF= 3.743)

15

Screening antibacterial

efects of VietNamese

plant extracts against

pathogens caused acute

The objectives are aimed to investigate the antibacterial properties of five Vietnamese medicinal plants against acute hepatopancreatic necrosis disease (AHPND)-caused bacterial pathogens, to verify their potentials to apply as a new treatment

therapy.Methods: Extracts from plants, such as Psidium guajava leaf, Piper betle L

leaf, Phyllanthus amarus leaf, Rhodomyrtus tomentosa seed, and Allium sativum bulb, were tested against three AHPND-caused bacteria Agar infusion and broth dilution methods were employed to evaluate extract in vitro antibacterial effects, while experiments with cultured whiteleg shrimps were applied to access their safety when applied in vivo High-performance liquid chromatography (HPLC) analysis was applied to identify components in the extracts.Results: P amanus and R tomentosa extracts exerted the strongest inhibition on tested bacteria Other extracts, including P

betel and P guajava, were less effective, while A sativum showed no effects against

Asian journal of pharmaceutical and clinical research , Vol 11, Issue 5,

2018,

77-83

bacteria In safety assessment experiments, we observed that only crude extracts of R

tomentosa and A satium were safe, while others significantly reduced their survival rates HPLC showed that extracts of high antibacterial properties had rich phenol constituents In addition, the phenolic profile of R tomentosa showed the presence of piceatannol.Conclusion: Considering both of antibacterial effects and safety

properties altogether, we concluded that among the five examined plant materials of this study, R tomentosa had the highest potential to apply in AHPND treatment, as only this plant showed the high effects on pathogenic bacteria while were still safe for host aquatic shrimps

III BÀI BÁO TRONG NƯỚC

1

Thành phần a xít amin

của Ngán thu tại một số

địa điểm ở Quảng Ninh

Đỗ Văn Thịnh, Đàm Thị Mỹ Chinh, Nguyễn Thị Thu Hiền, Trần Thị Thúy Hà

Nghiên cứu nhằm đánh giá thành phần và hàm lượng axít amin trong thịt Ngán

(Austriella corrugata) thuộc 5 quần đàn thu tại Quảng Ninh và được tiến hành với hai

đợt thu mẫu (Tháng 6 và tháng 11 năm 2016) Mười sáu loại axít amin được xác định bằng hệ thống sắc khí lỏng HPLC Agilent 1200 theo tiêu chuẩn AOAC 994.12 Kết quả nghiên cứu cho thấy, tất cả các mẫu thịt Ngán tại 5 quần đàn đều chứa 16 loại axít amin bao gồm cả axít amin thiết yếu và axít amin không thiết yếu Có sự khác nhau về hàm lượng axít amin tại các địa điểm thu mẫu và thay đổi theo thời gian thu mẫu (tháng 6 thấp hơn tháng 11) Hàm lượng axít amin và chỉ số đánh giá chất lượng prôtein trong thịt Ngán thu tại Đài Xuyên và Hoàng Tân có xu hướng cao hơn các điểm còn lại

Tạp chí nông nghiệp và phát triển nông thôn

Số 1-2018 63-67

Ái Hằng

Nghiên cứu này sử dụng trình tự gen cytochrome b để tìm hiểu đa dạng và cấu trúc di truyền của một số quần đàn cá Tra (Pangasianodon hypophthalmus) thu tại Đồng bằng sông Cửu Long Kết quả cho thấy tổng số 13 haplotype xuất hiện trong 60 trình

tự thuộc 03 quần đàn cá nuôi và 03 quần đàn cá tự nhiên Mức độ đa dạng haplotype

và đa dạng nucleotide của các quần đàn cá Tra nghiên cứu lần lượt dao động trong khoảng từ 0,356 ± 0,159 đến 0,867 ± 0,08 và từ 0,00091 ± 0,00041 đến 0,00924 ± 0,00267 Khoảng cách di truyền giữa các đàn cá Tra thấp và không có sự khác biệt di truyền đáng kể giữa nhóm quần đàn cá Tra thu từ tự nhiên và nhóm quần đàn cá Tra

Tạp chí Khoa học Đại học Vinh, Tập

47, 2018

Trong nghiên cứu này, 15 chỉ thị microsatellite cho cá chim vây vàng từ các nghiên cứu trước được chọn lọc để tối ưu quy trình nhằm phục vụ phân tích đa dạng di truyền Bảy chỉ thị đơn đã được tối ưu thành công trên cá chim vây vàng vây ngắn và

4 chỉ thị được tối ưu trên cá chim vây vàng vây dài Từ đó, ba phản ứng multiplex PCR được phát triển từ chín mồi đơn Trong đó, lựa chọn được 02 tổ hợp cho cá chim vây vàng ngắn và 01 tổ hợp cho cá chim vây vàng dài Quy trình phân tích đoạn với

ba bộ chỉ thị microsatellite tương ứng với chín locus được xây dựng Kết quả phân tích đoạn cho thấy 8 locus (EC-7; EC-9; EC-10; EC-17; EC-20; EC-28; TB018;

TBG030) thể hiện tính đa hình với số alen dao động từ 3 – 6, riêng locus TO67 không thể hiện tính đa hình Kết quả này có ý nghĩa khoa học trong việc nghiên cứu đa dạng

di truyền cá chim vây vàng (Trachinotus spp.)

Tạp chí Khoa học Nông nghiệp Việt Nam

2018, 16(3): 232-240

4

Đánh giá khả năng diệt

khuẩn in vitro của sản

phẩm nano

polymer-kháng sinh đối với vi

khuẩn gây bệnh hoại tử

gan tụy cấp trên tôm

nuôi nước lợ

Đặng Thị Lụa, Nguyễn Thị Hạnh, Đặng Đình Kim

Nghiên cứu được tiến hành nhằm đánh giá khả năng diệt khuẩn của các sản phẩm nano SP2 (Polymer_Kháng sinh) đối với vi khuẩn gây bệnh hoại tử gan tụy cấp (AHPND) trên tôm nuôi nước lợ trong điều kiện in vitro Chủng vi khuẩn được sử dụng để thử nghiệm là Vibrio parahaemolyticus KC12.020, nồng độ thử nghiệm 108 cfu/ml Kết quả thử nghiệm cho thấy đường kính vòng vô khuẩn của sản phẩm nano Polymer_Doxycylin_Florphenicol đạt 19,5 mm khi liều lượng kháng sinh sử dụng bằng một nửa (1/2) hàm lượng kháng sinh Doxycylin được khuyến cáo sử dụng

Đường kính vòng vô khuẩn của sản phẩm nano Polymer_Florphenicol đạt 16 - 19 mm trong khi kháng sinh Florphenicol đơn lẻ không có tác dụng tiêu diệt vi khuẩn gây bệnh AHPND (đường kính vòng vô khuẩn đạt 10,5 - 11,5 mm) Sản phẩm nano Polymer_Ciprofloxcin, mặc dù cho kết quả diệt vi khuẩn gây bệnh AHPND cao (đường kính vòng vô khuẩn đạt 18 mm) khi hàm liều lượng kháng sinh sử dụng chỉ bằng 1/10 hàm lượng kháng sinh Ciprofloxacin được khuyến cáo sử dụng, nhưng sản phẩm này sẽ không được tiếp tục thử nghiệm ngoài thực địa do kháng sinh

Cỉpofloxacin mới bị cấm sử dụng trong nuôi trồng thuỷ sản Các sản phẩm nano khác, Polymer_Oxytetracyclin và Polymer_Doxycyclin, kết quả thử nghiệm trong nghiên cứu này chưa thể hiện rõ tiềm năng diệt khuẩn, do vậy chúng cần được tiếp tục nghiên

Tạp chí Nông nghiệp và phát triển nông thôn

Số 1/2018: 79-86

cứu để khẳng định rõ hơn vai trò diệt khuẩn Những kết quả nghiên cứu này bước đầu cho thấy tiềm năng ứng dụng sản phẩm nano kết hợp với kháng sinh trong điều trị bệnh hoại tử gan tuỵ cấp trên tôm nuôi nước lợ

5

Đánh giá và lựa chọn

mô hình nuôi tôm ven

biển thích ứng với biến

đổi khí hậu tại huyện

Quỳnh Lưu, Nghệ An

Bùi Đắc Thuyết, Nguyễn Hữu Nghĩa

và Phan Thị Vân

Nghiên cứu nhằm đánh giá và lựa chọn được mô hình nuôi tôm ven biển thích ứng với biến đổi khí hậu (BĐKH) tại Quỳnh Lưu, Nghệ An, góp phần phát triển bền vững nghề nuôi tôm ven biển ở đây trong điều kiện BĐKH Các tiêu chí đánh giá tập trung vào cơ sở hạ tầng (6 tiêu chí), công nghệ và quản lý trại nuôi (7 tiêu chí), nhận thức

và ứng phó với BĐKH (2 tiêu chí) Mỗi tiêu chí được đánh giá, cho điểm theo thang điểm 5 (5 = rất tốt, 4 = tốt, 3 = trung bình, 2 = kém, 1 = yếu) Kết quả đánh giá tại một số trại nuôi tôm cho thấy các tiêu chí thường đạt mức trung bình trở lên, trừ những tiêu chí về hệ thống cấp, thoát nước, ao chứa và vị trí của trại nuôi TNT2 Trại nuôi tôm ven biển TNT1, TNT6 có điểm đánh giá cao và được đề xuất như mô hình nuôi tôm ven biển thích ứng với BĐKH nhằm giới thiệu cho cộng đồng nuôi tôm trong vùng

Tạp chí Khoa học Nông nghiệp Việt Nam, Số: 1, tr 64-72 ISSN:

biển biển thích ứng với

biến đổi khí hậu tại

vịnh Cát Bà, Hải

Phòng

Bùi Đắc Thuyết, Nguyễn Hữu Nghĩa

và Phan Thị Vân

Nghiên cứu nhằm đánh giá và lựa chọn được mô hình nuôi cá lồng biển thích ứng với biến đổi khí hậu (BĐKH) tại Cát Bà, Hải Phòng, góp phần phát triển bền vững nghề nuôi cá lồng biển quy mô nhỏ ở miền Bắc nước ta trong điều kiện BĐKH Các tiêu chí đánh giá tập trung vào cơ sở hạ tầng (3 tiêu chí), công nghệ và quản lý lồng bè nuôi (7 tiêu chí), nhận thức và ứng phó với BĐKH (2 tiêu chí) Mỗi tiêu chí được đánh giá, cho điểm theo thang điểm 5 (5 = rất tốt, 4 = tốt, 3 = trung bình, 2 = kém, 1 = yếu) Kết quả đánh giá tại một số bè nuôi cho thấy các tiêu chí đưa ra thường đạt mức trung bình trở lên, trừ những tiêu chí về sử dụng và quản lý thức ăn, kiểm soát chất lượng con giống, quản lý môi trường và phòng ngừa dịch bệnh Bè nuôi cá biển của Công ty 128 - Hải Quân có điểm đánh giá cao nhất và được đề xuất như mô hình nuôi

cá lồng biển thích ứng với BĐKH nhằm giới thiệu cho cộng đồng nuôi cá lồng biển ở đây

Tạp chí Khoa học Nông nghiệp Việt Nam, Số: 5, tr 590-597 ISSN:

Trong những năm qua, mặc dù đã có những bước phát triển khá mạnh mẽ cả về diện tích và sản lượng thủy sản nuôi ở nước ta, nuôi trồng thủy sản (NTTS) là một trong những hoạt động bị hành hưởng lớn do biến đổi khí hậu (BĐKH) Đặc biệt, Việt Nam

Tạp chí Thông tin Khoa học

ứng với biến đổi khí

hậu ở miền Bắc Việt

Nam

và Phan Thị Vân được xem là một trong những nước bị ảnh hưởng nghiêm trọng của BĐKH và nước

biển dâng Do vậy, để phát triển NTTS trong điều kiện BĐK, việc đánh giá, lựa chọn

và giới thiệu mô hình nuôi thủy sản thích ứng với BĐKH là hết sức có ý nghĩa nhằm phổ biến thông tin đến các địa phương

công nghệ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn

Mỹ Lệ, Phạm Thị Yến,

Trương Thị Thành Vinh, Chu Chí Thiết và Phan Thị Vân

Nghiên cứu được thực hiện từ tháng 6 năm 2015 đến tháng 6 năm 2017 ở 3 tỉnh Nghệ

An, Nam Định và Quảng Ninh, tập trung thu thập các thông tin phân tích yếu tố nguy

cơ liên quan đến bệnh đốm trắng ở tôm chân trắng Phương pháp áp dụng theo nghiên cứu dịch tễ học cắt ngang Kết quả nghiên cứu cho thấy có 8 mối nguy liên quan đến

sự xuất hiện dịch bệnh đốm trắng ở tôm tại các tỉnh Nghệ An, Nam Định và Quảng Ninh Trong đó 3 yếu tố thuộc không gian (lấy nước vào ao không qua hệ thống ao lắng, không sử dụng lưới lọc khi lấy nước và bổ sung nước vào ao nuôi trong quá trình nuôi), 2 yếu tố thuộc thời gian (ao nằm trong vùng nuôi có ao bệnh, không kiểm tra môi trường nước ao nuôi thường xuyên) và 3 yếu tố về đối tượng (thả giống với cỡ nhỏ hơn post 10, không giảm sốc khi thả tôm nuôi và xuất hiện sinh vật khác trong ao nuôi)

Tạp chí Khoa học Công Nghệ số 2/2018, 24:32

và Phan Thị Vân

Nghiên cứu nhằm đánh giá khả năng diệt khuẩn và nấm của nước ép lá hẹ (Allium tuberosum) Vi khuẩn gây bệnh cho cá rô phi bao gồm Aeromonas hydrophila (3 chủng là CED04-008, CED05-004, CED05-005), Streptococcus sp (CEDMA05-043)

và nấm gây bệnh (Saprogenia sp.) được thử với dịch chiết lá hẹ ở nồng độ và thời gian khác nhau Kết quả cho thấy, nước ép lá hẹ ở nồng độ 100 µl có khả năng diệt các chủng vi khuẩn A hydrophila và Streptococcus sp với đường kính vòng vô khuẩn (ĐKVVK) lần lượt là 27-31 và 30 mm Nấm Saprogenia sp bị diệt ở nồng độ

15.000 và 13.000 ppm với thời gian ngâm tương ứng là 6 và 24 giờ Kết quả này là cơ

Tạp chí khoa học

và công nghệ Việt Nam, số 7/2018: 48-52

sở khoa học quan trọng tạo tiền đề phát triển sản phẩm thuốc thảo dược có hiệu quả

phòng trị bệnh ở cá rô phi nuôi theo hướng an toàn sinh học và thân thiện với môi

và Phan Thị Vân

Nghiên cứu ký sinh trùng nhiễm ở cá chim vây vàng (Trachinotus spp) nuôi lồng tại

Cát Bà, Hải Phòng được thực hiện từ tháng 6 năm 2017 đến tháng 5 năm 2018 Kết

quả nghiên cứu đã xác định được 5 loài ký sinh trùng bao gồm Trichodina sp., Cryptocaryon irritans, Pseudorhabdosynochus sp., Benedenia sp và Caligus sp ký sinh ở cá chim vây vàng Trong đó, Trichodina sp có tỷ lệ và cường độ nhiễm cao

nhất ở cá chim vây vàng lần lượt tương ứng 50,7% và 1-88 trùng/vi trường, tiếp đến

Cryptocaryon irritans (13,8% và 1-30 trùng/vi trường), Pseudorhabdosynochus sp

(3,8% và 1-10 trùng/vi trường), Benedenia sp (6,3% và 1-7 trùng/cơ thể) và thấp nhất

là Caligus sp (1,3% và 1-5 trùng/cơ thể) Hơn nữa, Trichodina sp được ghi nhận nhiễm ở cá chim vây vàng từ tháng 1 đến tháng 12, trong khi đó Cryptocaryon irritans và Benedenia sp bắt gặp ký sinh ở cá chim vây vàng lần lượt trong tháng 3,4,7 và tháng 3,4, 8, Pseudorhabdosynochus sp và Caligus sp xuất hiện 1 lần vào

tháng 5 và 11

Tạp chí khoa học

và công nghệ Việt Nam, Số 9/2018: 48-52

11

Đánh giá khả năng giao

tiếp (quorum sensing)

giữa vi khuẩn

gây bệnh hoại tử gan

tụy cấp với Vibrio

alginolyticus

Trần Thị Thúy Hà, Nguyễn Thị Hạnh, Phạm Thế Việt, Phan Thị Vân và Trương Thị Mỹ Hạnh

Quorum sensing (QS), sự liên lạc giữa tế bào vi khuẩn với tế bào vi khuẩn, có liên quan đến gen độc lực của vi khuẩn gây bệnh Nghiên cứu được thực hiện nhằm đánh giá QS giữa Vibrio parahaemolyticus gây bệnh hoại tử gan tụy cấp (Acute

hepatopancreatic necrosis disease - AHPND) với Vibrio alginolyticus không gây bệnh AHPND đồng thời xác định vai trò của tinh dầu quế đối với QS giữa V

parahaemolyticus và V alginolyticus Phương pháp sử dụng bao gồm nuôi cấy truyền thống và kỹ thuật PCR Kết quả cho thấy V alginolyticus đã tiếp nhận gen độc gây bệnh AHPND từ V parahaemolyticus trong điều kiện nuôi có sốc nhiệt 3 lần ở 400

C (5 phút) và 700C (2 phút) thông qua cơ chế QS Ngoài ra, tinh dầu quế sử dụng với liều 0,1µL/600µL đã làm rối loạn hệ thống giao tiếp đặc hiệu QS của vi khuẩn làm V

alginolyticus không tiếp nhận được thông tin của gen độc gây bệnh AHPND ở tôm

nước lợ từ V parahaemolyticus

Tạp chí khoa học Nông Ngiệp Việt Nam Số 6/2018