Trong một thực thể thống nhất là Công ty, Chủ tịch HĐQT là người giữ quyền hành cao nhất, quyết định mọi vấn đề liên quan đến quá trình hình thành và phát triển của Công ty. Mỗi bộ phận, phòng ban trong Công ty đều nắm giữ những vai trò khác nhau. Chẳng hạn như, phòng Kinh doanh kết hợp với phòng Dịch vụ khách hàng chịu trách nhiệm bán hàng, tìm kiếm khách hàng và bảo đảm doanh số, đồng thời chăm sóc và tư vấn cho khách hàng những dịch vụ của Công ty; phòng Kế toán đảm nhận quản lý, huy động và sử dụng nguồn vốn một cách hiệu quả cho các hoạt động kinh doanh; phòng Hiện trường bảo đảm chất lượng và tiến độ thủ tục cho các hoạt động xuất nhập khẩu của khách hàng và hoạt động vận tải trung gian;… Mặc dù mỗi phòng ban đều có những nhiệm vụ, chức năng riêng nhưng đều có sự gắn kết chặt chẽ với nhau, bổ sung và hỗ trợ nhau trở thành một khâu mắt xích liên kết tạo nên Công ty Cổ phần VNT Logistics.
Bên cạnh đó, ngoài mối quan hệ nội bộ giữa các phòng ban trong Công ty, sau quá trình hơn 25 năm hoạt động trên thị trường Logistics Việt Nam nói riêng và toàn thế giới nói chung, Công ty VNT Logistics từ vị trí khởi đầu sau bao nỗ lực đã trở thành một trong những Công ty có quy mô lớn hàng đầu thế giới. Công ty VNT Logistics cũng đã thiết lập mối quan hệ lâu dài với các đối tác lớn nhỏ hàng đầu thế
giới như: DHL, UPS, RCL, FedEx Express, Vietnam Airlines,… Trong tương lai, Công ty sẽ còn hướng đến các thị trường lớn hơn như Mỹ, châu Âu.