giải trình tự gen dna sequencing

... dùng cho giải trình tự DNA, nhiên sử dụng polymerase khác cần điều chỉnh lại điều kiện PCR để có sản phẩm đặc hiệu 3.1.3 Tiến hành chẩn đoán đột biến gen BCR/ABL giải trình tự chuỗi DNA sản phẩm ... ảnh) Gen ABL có 11 exon, exon có biến thể với trình tự chuỗi khác gọi exon 1a exon 1b Trong trình tạo thành tổ hợp gen với BCR, từ exon exon đến exon 11 ABL gắn với gen BCR (Hình 1.2) Trình tự ... ATP-binding [33,30] Để phát nhiều kiểu đột biến khác kỹ thuật giải trình tự DNA ưu tiên lựa chọn Trong nghiên cứu này, sử dụng kỹ thuật giải trình tự DNA để phân tích đột biến vùng ATP-binding BCR/ABL Đến...

Ngày tải lên: 04/07/2015, 14:47

... Phân tích gen mức độ ADN protein A) Ở mức độ ADN Trình tự toàn gen HP1125 vừa giải mã so sánh với gen tương ứng chủng nước chương trình Blast Nhìn chung, gen Việt nam có tương đồng cao với gen tương ... Hultman (6a) Phân tích trình tự đoạn ADN: Chương trình Blast trang Web sử dụng để phân tích trình tự protein cuar gen KẾT QUẢ VÀ BÀN LUẬN Khuếch đại gen HP1125 phương pháp PCR Toàn gen HP1125 khuyếch ... đại gen HP1125 phương pháp PCR M Thang chuẩn ADN 100 cặp bazơ Sản phẩm PCR có kích thướckhoảng 540 cặp bazo kiểm tra phương pháp điện di Kết giải trình tự Sản phẩm PCR, sau làm giải trình tự trực...

Ngày tải lên: 30/01/2013, 14:43

... ngu n gen 2.3.6 Gi i trình t x lý chu i gen 2.3.6.1 Gi i trình t DNA 2.3.6.2 Tinh s ch s n ph m c a ph n ng gi i trình t 2.3.6.3 Thu nh n, x lý phân tích d li u chu i gen ... chương trình tin – sinh h c ng d ng nghiên c u x lý, phân tích so sánh chu i gen thu nh n - Chương trình so sánh phân tích chu i gen GeneDoc m t chương trình Nicholas Nicholas (1997) [48] l p trình ... ñó ngu n g c c a s ña d ng s ñ i m i ti n hóa [7] Trình t DNA b bi n có th có th nh hư ng ñ t m t gen, hay m t vùng DNA ho c toàn b h gen; vùng DNA mã hóa cho protein ho c vùng không mã hóa Ví...

Ngày tải lên: 14/12/2013, 16:10

... Các phương pháp giải trình tự gen Có phương pháp chính: Phương pháp hoá học Maxam Gilbert: phương pháp sử dụng để xác định trình tự gen không đựơc sử dụng phổ biến Phương ... dTTP ddTTP C T A G Đoạn ADN cần giải trình tự Mồi Sequencing .CCTATGGAATGC- ống phản ứng A * * ** * phản ứng C ống * ** ống phản ứng G * * ống phản ứng T ** Phóng xạ tự ghi sợi AND đơn tổng hợp ống ... phương pháp cải tiến Tạo điều kiện thuận lợi cho việc tự động hoá Giảm giá thành phản ứng Tăng tốc độ phản ứng => Nhiều trung tâm giải trình tự gen sử dụng phương pháp họ đọc hàng triệu bp ngày...

Ngày tải lên: 18/02/2014, 10:20

... Bước 2: Nhân DNA PCR Bước 3: Nạp sản phẩm PCR vào máy giải trình tự gen chạy máy giải trình tự gen Bước 4: Phân tích kết từ liệu máy tính cung cấp 2.3 Phương pháp giải trình tự gen tự động Đầu ... Thịnh NỘI DUNG Khái niệm giải trình tự gen ý nghĩa GTTG Phương pháp giải trình tự gen: 2.1 Phương pháp Maxam – Gilbert 2.2 Phương pháp Sanger 2.3 Phương pháp giải trình tự gen tự động So sánh phương ... phát màu, màu ứng với nucleotide hiển thị đỉnh 2.3 Phương pháp giải trình tự gen tự động Đọc kết 2.3 Phương pháp giải trình tự gen tự động ABI Automated Sequencers (contd.) ABI 310 Capillary ABI...

Ngày tải lên: 06/03/2014, 05:22

... ADN đợc xử lý vào máy giải trình tự gen để đọc tự động trình tự nucleotide FliC Có thể đọc sợi đọc đồng thời hai sợi để tăng độ xác trình tự đợc đọc Kết trình giải trình tự gen FliC đợc lu máy ... paratyphi B GenBank (http: //www ncbi nlm nih gov) 27 TCNCYH phụ 32 (6) - 2004 Các gen FliC Salmonella khác đợc giải trình tự so sánh với để tìm vùng đặc trng cho loài, FliC - a gen FliC Salmonella ... Introduction of sequencing and Real - Time PCR techniques DNA sequencing was first introduced in 1975 by Sanger The sequencing technique was started with the related information on the interested gene in...

Ngày tải lên: 10/03/2014, 22:20

... thuật giải trình tự theo phương pháp Sanger [13] Giải trình tự DNA chia làm bước lớn: PCR giải trình tự đọc trình tự máy tự động Bước 1: PCR giải trình tự Thành phần hỗn hợp phản ứng gồm: - DNA ... thứ tự xác định Giải trình tự gen tức phát thứ tự xếp nucleotid phân tử DNA Vào thập kỷ 70, có hai quy trình giải trình tự sau đưa gần lúc: - Phương pháp Maxam Gilbert (1977) cắt đứt sợi đôi DNA ... Chạy điện di kiểm tra sản phẩm Bước 4: Giải trình tự sản phẩm PCR gồm bước: - Thực phản ứng PCR giải trình tự - Tinh sản phẩm PCR giải trình tự - Giải trình tự trực tiếp máy ABI-3100 2.3 Dụng cụ,...

Ngày tải lên: 07/10/2014, 01:31

... Giải trình tự DNA  Mục đích: Xác định thứ tự nucleotide (A,C,G T) mạch DNA gen  Ứng dụng công nghệ sinh học: nghiên cứu, khám phá, chuẩn đoán điều tra  Vấn đề  Phương pháp giải trình tự DNA ... tự DNA hữu hiệu mạch DNA (1-2 Kbp)  Giải pháp o Giải trình tự lắp ráp đoạn nhỏ máy tính  1977 Sanger Sequencing 2005 2006 2007 454 Sequencing Illumina sequencing ABI solid Sequencing Chiến lược ... SOLID sequencing Ilumina sequencing Tiến trình: Chuẩn bị thư viện DNA (reversible termination) Khuếch đại bắt cầu Giải trình tự đầu ngược Khuếch đại bắt cầu giải trình tự sinh tổng hợp Khuếch...

Ngày tải lên: 29/02/2016, 09:36

... 18) Hình 18 So sánh trình tự DNA với trình tự protein nhóm Nhóm gồm trình tự chủng LPH209 với trình tự protein dài gồm 413 axit amin Trình tự protein chủng sai khác với trình tự protein Thite_72629 ... So sánh trình tự DNA với trình tự protein nhóm Nhóm có trình tự khác biệt lớn với trình tự ThCEL 72629 (khoảng 5%) đặc biệt 21 axit amin cuối từ axit amin 370 đến 391 Nguyên nhân trình tự Thite_72629 ... gồm 16 axit amin trình tự protein (Hình 15) Mặc dù sai khác trình tự DNA, trình tự protein hay vị trí intron, exon chủng lớn trình tự peptide tín hiệu giống giống với trình tự Thielavia terrestris...

Ngày tải lên: 01/07/2016, 13:02

... băng để giải trình tự Sản phẩm PCR sau tinh giải trình tự trực tiếp, sử dụng mồi ITS1 Xử lý trình tự chuỗi nucleotid phần mềm chuyên biệt, bao gồm SeqEd1.03, AsemblyLIGNv1.9c hệ chương trình MacVector8.2 ... băng thu phân tích giám định loài ADN tinh vào ống để đưa Một số sản phẩm PCR giải trình tự giải trình tự Sau giải trình tự, chuỗi cho chuỗi nucleotid lồng nhau, không nucleotid xử lý phân tích phần ... phân biệt để thu clon riêng giải sách mẫu, kết PCR, chuỗi gen giải trình tự trình tự, kết truy cập Ngân hàng Gen Kết truy cập Ngân hàng Gen chủ yếu liệt kê xác định loài số 51 mẫu truy cập, kết...

Ngày tải lên: 11/10/2016, 23:49

Ngày tải lên: 13/08/2014, 14:43

... ddCTP) có màu khác giải trình tự mẫu nghiên cún phản ứng (1 giếng điện di) thay phản ứng (trong giếng riêng biệt) phưong pháp dideoxy Sanger Phần mềm máy tính tự động giải trình tự liệu từ gel điện ... pháp dideoxy cải tiến dựa vào thiết bị tự động hóa nhanh xác Sự tự động hóa cải tiến tốc độ giải trình tụ’ mẫu, đặc biệt có ý nghĩa cho việc giải trình tự khuôn mẫu lớn Người ta không đánh dấu ... trình tự liệu từ gel điện di cho hình ảnh kết giải trình tự DNA Các bước tiến hành: ♦ Thành phần gồm: - DNA mẫu chứa khoảng 1010 phân tử, 1010 đoạn DNA dài khoảng 103-104bp - Các deoxynucleotide...

Ngày tải lên: 12/01/2016, 17:14

... pGEM -3Z mang gen novS 2.2.7 Giải trình tự gen Để giải trình tự gen ta tiến hành tách plasmid tái tổ hợp pGEMnovS tế bào vi khuẩn E.coli XL1 Blue biến nạp trên, sau gửi giải trình tự 2.2.8 Tạo ... 12: 10a So sánh trình tự axit amin gen novS với gen mã số AAF67512.1 10b So sánh trình tự axit amin gen novS với gen mã số AAN65241.1 10c So sánh trình tự axit amin gen novS với gen mã số AAG29801.1 ... Nghiệp K13 Viện Đại Học Mở Hà Nội 3.1.3 Kết xác định trình tự đoạn gen NovS Đoạn gen novS plasmid pGEM -3Z đuợc giải trình tự Kết giải trình tự gen novS sau: ATTGGAGCTCACCGCGGTGGCGGCCGCTCTAGAACTAGTGGATCCCCCGGGCTGCAG...

Ngày tải lên: 25/12/2013, 12:42

... xác định cho trình tự base toàn phần gene Việc xác định trình tự ADN cho phép tìm hiểu chất đột biến gene, chức gene, mức độ tương tự gene với gene khác biết Kỹ thuật xác định trình tự nucleotide ... nhiều quan tâm việc sử dụng để đọc trình tự ADN Bằng cách sử dụng vi tính kỹ thuật tự động làm tăng khả đọc trình tự ADN cho phép đọc trình tự toàn tỷ bp genome người ... tả đỉnh màu khác nhau, trình tự đỉnh màu đồ thị cho phép đọc trình tự đoạn ADN Một đoạn khoảng 500 bp 64 người khác phân tích gel vòng từ đến Phương pháp đọc trình tự tự động thực cho việc đánh...

Ngày tải lên: 21/03/2014, 01:20

... PHƯƠNG PHÁP GIẢI TRÌNH TỰ DNA Phương pháp hoá học giải trình tự DNA Maxam & Guilbert (1977) Nobel hóa học 1980 (phương pháp giải trình tự) Walter Gilbert Phương pháp enzyme giải trình tự Frederick ... phẩm PCR tinh cho p/ứng chu kỳ giải trình tự Hệ thống giải trình tự Trugene Siemens Medical Solutions Diagnostics CEQ 8000 (Beckman Coulter) CÁC HỆ THỐNG GIẢI TRÌNH TỰ TỰ ĐỘNG ABI 3130 Cappilaries ... VSV: VK kỵ khí: giải trình tự đoạn đặc hiệu cho giống loài gen 16S 6.3 Định danh nấm: giải trình tự đoạn đặc hiệu cho giống loài gen 28S rDNA 6.3 Xác định genotype VR, VSV… HCV: genotype (1a, 1b),...

Ngày tải lên: 25/03/2014, 07:20

... bị giải trình tự hệ Roche 01 máy khối phổ để phân tích cấu trúc chức protein Thiết bị giải trình tự Roche giải trình tự đoạn DNA có kích thước đến 800 nucleotide Ngoài mục tiêu giải trình tự ... 10/1998 Trình tự DNA 95% vùng chứa gen 99% vùng chứa gen Tháng 4/2003 trình tự gen người trình tự gen người hoàn thành với độ hoàn thành với độ xác tới 99,99% xác 99,99% Công suất giá 500 Mb trình tự/ ... cá thể Để giải trình tự hệ gen người, nhiều DNA phân thành nhiều đoạn ngắn sau giải trình tự đoạn Nhiều DNA nghĩa đoạn DNA phân bố cách ngẫu nhiên hệ gen Các đoạn sau so sánh với trình tự tham...

Ngày tải lên: 20/04/2014, 13:32

... thứ tự Nu gắn kết với dọc theo chiều dài gen (DNA) gọi việc giải trình tự chuỗi (Sequencing) , trình tự gắn kết Nu gọi trình tự chuỗi (Sequence) 2, CẤU TẠO BỘ GEN HBV: HBV có gen phân tử DNA, ... loại HBV genotypes cần dựa trình tự chuỗi (sequence) đoạn gen HBV phần trình tự chuỗi gen pre-S; S Có nhiều phương pháp nghiên cứu dùng việc xác định HBV genotypes giải trình tự chuỗi (sequencing) , ... pháp giải trình tự chuỗi xem có nhiều ưu điểm bật bên cạnh việc xác định trình tự chuỗi Nucleotids gen HBV để từ so sánh với thư viện gen xác định HBV genotypes mà dựa vào kết giải trình tự xác...

Ngày tải lên: 27/07/2014, 10:21