Chất lượng XNSHPT • Môi trường XN – XNSHPT là gì? • DNA/RNA/protein? – Môi trường, hóa chất, dụng cụ thí nghiệm, v.v…: sạch, vô trùng • Mục đích, kiến thức xét nghiệm: – Tham khảo tài liệu (ISO?) – Phải qua huấn luyện sử dụng máy móc • Máy móc: – Hiệu năng máy móc – Lập trình chương trình • Các sai lầm trong một XN SHPT – Sai lầm loại 1 là loại sai lầm khi kết quả nghiên cứu cho thấy có sự khác biệt (như giả thuyết đặt ra), nhưng thực tế là không có sự khác biệt. – Sai lầm loại 2 là kết quả nghiên cứu cho thấy không có mối quan hệ giữa các yếu tố, nhưng thực tế thì có.
Trang 1MỘT SỐ LƯU Ý ĐỂ ĐẢM BẢO VÀ KIỂM TRA CHẤT LƯỢNG XÉT NGHIỆM SINH
HỌC PHÂN TỬ
Nguyen Le Thanh (MRes) thanhnl@pnt.edu.vn
Trang 21 GIỚI THIỆU CHUNG
Trang 3– Tham khảo tài liệu (ISO?)
– Phải qua huấn luyện sử dụng máy móc
• Máy móc:
– Hiệu năng máy móc
– Lập trình chương trình
• Các sai lầm trong một XN SHPT
– Sai lầm loại 1 là loại sai lầm khi kết quả nghiên cứu cho thấy có sự
khác biệt.
– Sai lầm loại 2 là kết quả nghiên cứu cho thấy không có mối quan
hệ giữa các yếu tố, nhưng thực tế thì có
Trang 4Các bước quy trình XN
1 Sample collection
(Blood, urine, feaces, tissue, etc.)
2 Sample treatment, record, & storage
3 Analysis
(Diagnostic tests)
4 Report & Diagnosis
Trang 6(2) Xử lý bảo quản mẫu
• Tinh sạch loại bỏ tạp chất
• Di chuyển vận chuyển
• Chất chống đông?
Trang 7Tầm soát
Chẩn đoán Tiên lượng
Hướng điều trị Theo dõi
Ví dụ
XN
SHPT
Kiểm tra dấu hiệu
xơ nang
Định tính hoặc định type HPV
Nhiễm
vi khuẩn lao
Phân loại ung thư vú vào các phân nhóm
sử dụng
(OncoType
Dx hay Mamma Print)
Xác định tình trạng đột biến gen như KRAS, BRAF, và Her2
Định lượng (đo tải lượng) siêu vi viêm gan C
Trang 8• Định lượng tuyệt đối
• Real-time PCR Đường tiêu chuẩn
• Định lượng tương đối
• Real-time PCR gen tham chiếu
• Nghiên cứu di truyền học
• Giải trình tự DNA
Trang 9(3) PP phân tích
• Các đối chứng
– Chứng dương là gì?
– Chứng âm là gì?
Trang 10(3) PP Phân tích: Đối chứng
• Nhóm kiểm tra và nhóm chứng:
– Nhóm kiểm tra: Xem phản ứng khi có thay đổi
– Nhóm chứng: Không tạo thay đổi
Trang 11– Độ nhạy = số dương tính thật/(số dương tính thật + số âm tính giả)
– Độ nhạy 100% có ý nghĩa như thế nào?
– Độ nhạy cao ảnh hưởng gì đến sai lầm của XN?
• Độ đặc hiệu?
– Độ đặc hiệu của một xét nghiệm là tỷ lệ những trường hợp thực sự không có bệnh và có kết quả xét nghiệm âm tính trong toàn bộ các trường hợp không bị bệnh
– Độ đặc hiệu = Số trường hợp âm tính thật/ (số trường hợp âm tính thật + số trường hợp dương tính giả)
– Độ đặc hiệu 100% có ý nghĩa như thế nào?
– Độ đặc hiệu cao ảnh hưởng gì đến sai lầm của XN?
Trang 12Ví dụ:
Dùng PCR để phát hiện Mycobacterium tuberculosis trong máu bệnh nhân
• Đoạn trình tự IS1081 đặc thù cho Mtb
Trang 13Ví dụ:
Dùng PCR để phát hiện Mycobacterium tuberculosis trong máu bệnh nhân
• Đoạn trình tự IS1081 đặc thù cho Mtb
• Primer có sẵn
• Thiết kế phản ứng PCR
Mẫu kiểm tra DNA từ máu bệnh nhân
Chứng dương Mẫu DNA Mtb
Chứng âm Nước, không DNA
khuôn
Trang 14(+) (-)
Mẫu 1 Mẫu 2
Trang 17Điện di
(-) (+)
Trang 18Xét Nghiệm:
Chạy điện di PCR của 01 mẫu máu để phát hiện trình tự 419kb
IS6110 của M tuberculosis
Trang 19Xét Nghiệm:
Chạy điện di PCR của 01 mẫu máu để phát hiện trình tự 419kb
IS6110 của M tuberculosis
Thang
(+)
(-) PCR
Trang 20Trường hợp 1: Không có band
Trang 21Trường hợp 2:
Có thang, nước (chứng âm điện di) hoạt động/Không có band
H2O
Trang 22Trường hợp 3
H2O (+)
Trang 23Trường hợp 4
H2O
Trang 24Trường hợp 5
H2O
Trang 25Trường hợp 6
H2O
Trang 26Ý chính
• Hạn chế ngoại nhiễm, nội nhiễm
• Hạn chế, kiểm soát, kiểm tra đối chiếu hiện
tượng dương giả âm giả
Trang 27(4) Tổng hợp kết quả và đưa ra phân
tích chẩn đoán
• Kỹ thuật phân tích? Cần phải chú ý những gì?
• Tham khảo:
(a) Độ xác thực (b) Độ chính xác (c) Đường tuyến tính (d) Chất gây cản trở (e) Độ nhạy phân tích (f) Độ đặc hiệu phân tích (g) Giới hạn phát hiện (h) Giới hạn đo
Trang 28(4) Tổng hợp kết quả và đưa ra phân
tích chẩn đoán
• Xác nhận phân tích có mục tiêu là xác định
được sự hiện diện hay không và nguyên
nhân/nguồn gốc (nếu có) cho những sai sót
kỹ thuật có thể xảy ra khi phân tích mẫu bệnh phẩm
về mặt y học lâm sàng hay không.
Tải bản FULL (61 trang): https://bit.ly/3fYLVAX
Dự phòng: fb.com/TaiHo123doc.net
Trang 29(4) Tổng hợp kết quả và đưa ra phân
Trang 30(4) Tổng hợp kết quả và đưa ra phân