Bệnh phẩm: NTA tin cậy Tất cả [−] với nuôi cấy Tác nhân vi khuẩn gây CAP ở trẻ em Results from culture CAP, community-acquired pneumonia; NTA, naso-tracheal aspirate.. Các tác nhân vi k
Trang 1Tác nhân vi sinh gây NTHHD CĐ
và tình hình đề kháng kháng sinh
Pham Hung Van*
*Hội Vi Sinh Lâm Sàng TP HCM
Trường ĐH Phan Châu Trinh
Trang 210 nguyên nhân hàng đầu gây tử vong ở VN
LRTI, lower respiratory tract infections http://www.healthdata.org/vietnam Accessed 28/08/2019
Trang 3Tá nhân vi khuẩn gây CAP và CAP/COPD
Kết quả nuôi cấy mẫu đàm 271 bệnh nhân
0.74E cloacae; 0.74
5.17 12.18
2.21
1.11
0.37
2.58
CAP, community-acquired pneumonia; COPD, chronic obstructive pulmonary disease; GAS,
Streptococci Group A; GBS, Streptococci Group B; GNR, Gram-negative rod; MTB, M tuberculosis;
SAU, S aureus; MRS, methicillin resistant S aureus; SCN, S epidermidis.
Van PH, et al Vietnam Pulmonary Society
REAL STUDY 2016-2017 Medical News – Practical Respiratory 2018;3:51–63
Ye as
t
GN R
ot he r
Trang 4 Bui Le Huu Bích Van (2015)1
Luận văn thạc sĩ Đối tượng: 32 bệnh nhi CAP không đáp ứng điều trị KS bước đầu nhập viện NĐ1 Bệnh phẩm: NTA tin cậy
6 (18.75%) cấy [+] (K pneumoniae: 2, E coli: 1, P aeruginosa: 1, H
influenzae: 1, E faecium: 1)
Trần Quang Khải (2016)2
Luận văn thạc sĩ Đối tượng: 66 bệnh nhi viêm phổi thùy Bệnh phẩm:
NTA tin cậy
Tất cả [−] với nuôi cấy
Ngô Chí Thịnh (2017)3
Luận văn CKII Đối tượng: 48 bệnh nhi viêm phổi nặng không đáp ứng
KS điều trị Bệnh phẩm: NTA tin cậy
Tất cả [−] với nuôi cấy
Tác nhân vi khuẩn gây CAP ở trẻ em
Results from culture
CAP, community-acquired pneumonia; NTA, naso-tracheal aspirate
1 Unpublished data based on thesis report by Bui Lê Hữu Bích Vân, et al, 2015 2 Unpublished data based on thesis report
by Trần Quang Khải, et al, 2016 3 Unpublished data based on thesis report by Ngô Chí Thịnh, et al, 2017.
Trang 5Các tác nhân vi khuẩn cộng đồng như PNE, HIN không phải là các nhân vi sinh chủ yếu gây bệnh?
Nhiễm trùng hô hấp dưới
TÁC NHÂN VI SINH CHỦ YẾU?
Trang 6Lạm dụng KS trong điều trị
Trang 7Hướng dẫn điều trị KS của BYT 2015
1 Kiratisin P, et al Int J Antimicrob Agents 2012;39:311–316 2 Tran DM, et al J Infect
2019; 79:115–122 3 Khang B User's Manual 2015 – Ministry of Health of Vietnam
Hướng dẫn điều trị KS của BYT 2015
KS dành cho ESBL (+) Enterobacteriaceae
carbapenem ± aminoglycoside
55% Enterobacteriaceae là ESBL [+]
MOH, Ministry of Health; ESBL,
extended-spectrum beta-lactamase; ICU, intensive
care unit
All
N = 436
Trang 8Biedenbach DJ, et al Clin Ther 2016;38(9):2098–2105
AB, A baumannii; CAP, community-acquired pneumonia;
HAP, hospital-acquired pneumonia; PSA, P aeruginosa
PM-GBL-ACA-PPT-190014Date of preparation: August 2019
Trang 9Tại sao nuôi cấy
vi sinh thất bại?
Trang 10LÝ DO NUÔI CẤY THẤT BẠI
Lý do chủ quan khó khắc phục
pneumoniae, H influenzae), đòi hỏi các
môi trường phân lập ít có sẵn
(tạp khuẩn hầu họng)
gửi đến PTN, do không được cấy ngay
cấy để chọn đúng VK gây bệnh
Expert opinion of speaker
Trang 11LÝ DO NUÔI CẤY THẤT BẠI
Lý do khách quan không thể khắc phục
các vi khuẩn này không còn sống trong mẫu đàm (nhưng vẫn còn trong các dịch lót
phòng thí nghiệm lâm sàng (vi khuẩn
Blood culture (only 14% positive) [2]
1 Expert opinion of speaker 2 Luna HIR, et al The Ochsner Journal 2001;3:85-93.
Trang 12 Phát hiện kháng nguyên hòa tan VK gây bệnh
(như S pneumoniae, L pneumophila) trong
mũi sau bằng ELISA, MDHQ: Phát hiện tác nhân
hiện tác nhân virus, VKKĐH: Nếu là IgG thì phải huyết thanh kép cách 10 ngày; nếu là IgM thì phải có giá trị cắt và tùy chất lượng kit [2]
KỸ THUẬT MIỄN DỊCH
VẪN NHIỀU HẠN CHẾ
ELISA, enzyme-linked immunosorbent assay;
IgG, immunoglobulin G; IgM, immunoglobulin M 1 Horita N, et al Respirology 2013;18:1177–1183 2 Torres A, et al Eur Respir J 2016;48:1764–1777.
Expert opinion of speaker
Trang 13Thông tin về phổ vi khuẩn gây bệnh
là yếu tố rất cần thiết
để tránh lạm dụng kháng sinh bước đầu trong điều trị
Trang 14Nguyên tắc PCR
cơ sở của độ nhạy và độ đặc hiệu tuyệt vời
ADN đích
2 Bắt cặp (55-65o C)
1 Biến tính (94o C)
3 Kéo dài (72o C)
PCR
Định danh dựa vào kiểu hình sinh vật hóa học quyết định bởi bộ gen
Nuôi cấy
PCR đạt độ nhạy phát hiện một
mãnh NA của VSV có trong mẫu nhờ
nguyên tắc khuếch đại NA từ một
thành hàng tỷ rồi mới phát hiện
PCR chính là nuôi cấy nhưng là nuôi cấy đoạn gen của VSV nên PCR đặc hiệu không khác nuôi cấy
PCR, polymerase chain reaction; DNA, deoxyribonucleic acid; RNA, ribonucleic acid;
RTPCR, reverse transcription polymerase chain reaction Expert opinion of speaker.
Trang 15Chọn lựa tuỳ tác nhân
Chứng nội kiểm soát chất ượng
PCR, polymerase chain reaction; DNA, deoxyribonucleic acid; RNA, ribonucleic acid;
RTPCR, reverse transcription polymerase chain reaction Expert opinion of speaker.
Trang 16Real-time PCR
PHÁT HIỆN TÁC NHÂN GÂY VIÊM PHỔI
Mẫu thử ĐÀM
Tách chiết NA
Thực hiện Real-time PCR
VK Bệnh viện
P carinii, P jiroveci Ghi nhận số lượng
PCR, polymerase chain reaction; RSV, respiratory syncytial virus;
MR, methicillin resistant; MS, methicillin sensitive; CA, community-acquired; NA, nucleic acid
Trang 17nz ae
H in flu en
za e b
C p
ne um
on ia e
L pn
eu m
op hi la
A b
au m
an ni i
P a
er ug
in os a
K p
ne um
on ia e
0.74 0.74
5.17 12.18
2.21
1.11 0.37
2.58
Real-time PCR Nuôi cấy
Nghiên cứu REAL 2016-2017 (N-271) Website HHH TP.HCM
CAP và CAP/COPD người lớn nhập viện
KẾT QUẢ NUÔI CẤY VS REAL-TIME PCR ĐÀM
Culture [+] (loại bỏ thường trú) 42.1%
Trang 18Unpublished data based on thesis report by Bui Lê Hữu Bích Vân, et al, 2015.
Multi-pathogens are predominant (N=32)
Trẻ em CAP thất bại KS ban đầu
Real-time PCR results (culture [+] : 18.75%)
PCR, polymerase chain reaction; CAP, community-acquired pneumonia;
HA, hospital bacteria; RSV, respiratory syncytial virus
Trang 19Multi-pathogens are predominant (N=66)
Unpublished data based on thesis report by Trần Quang Khải, et al, 2016
Viêm phổi thùy ở trẻ em
Real-time PCR results (culture [+]: 0%)
HA, hospital bacteria; HI, H influenzae; MC, M catarrhalis; MP, M pneumoniae;
MTB, M tuberculosis; SP, S pneumoniae; PCR, polymerase chain reaction
Trang 21SP HI MC GAS GBS Hib SAU SE Efecl Eaero Eclo Eco KLP Eagg Pmira PSA PS? AB Fungi
CAP ở người lớn ngoại trú
Eaero E aerogenes Eclo E cloacae
Eco E coli KLP K. pneumoniae Eagg E agglomerans Pmira P mirabilis PSA P aeruginosa PS? Pseudomonas sp.
AB A baumannii Fungi
SP S pneumoniae
HI H influenzae
MC M catarrhalis GAS Streptococci Group A GBS Streptococci Group B Hib H influenzae type b SAU S aureus
SE S epidermidis Efecl E faecalis
N=232
CAP, community-acquired pneumonia;
PCR, polymerase chain reaction
Trang 22MY MP BP FluA FluB Para1 Para3 Rhino RSV hMPV Adeno
metapneumovirus Adeno Adenovirus
Case with virus [+] 27.2%
Case with atypical bacteria [+] 10.8%
CAP ở người lớn ngoại trú
Real-time PCR results (tác nhân không nuôi cấy được)
N=232
CAP, community-acquired pneumonia;
PCR, polymerase chain reaction
Vietnam Pulmonary Society 2018.Van PH EACRI Study 2017-2018, unpublished data
Trang 23Mono Bacteria 2.16 SP+CA 1.29 SP+HI+CA 5.17
CAP, community-acquired pneumonia; PCR, polymerase chain reaction;
HI, H influenzae; SP, S pneumoniae; CA, community bacteria
(M catarrhalis, M pneumoniae); HA, hospital bacteria (Gram [-],Gram[+]).
CAP ở người lớn ngoại trú
R eal-time PCR and culture
Multi-pathogens are predominant
Vietnam Pulmonary Society (2018) Van PH EACRI Study 2017-2018, unpublished data
% values
Trang 24Phát hiện tác nhân vi sinh gây CAP
Vai trò xét nghiệm vi sinh
hạn khó hay không thể khắc phục Các phương pháp
lượng và số lượng phát hiện tác nhân vi sinh gây bệnh
và phù hợp với điều kiện của nhiều phòng thí nghiệm vi
ATB, antibiotic; CAP, community-acquired pneumonia; PCR, polymerase chain
reaction; MALDI-TOF, matrix assisted laser desorption ionization-time of flight
1 Expert opinion of speaker 2 Templeton KE, et al
Clinical Infectious Diseases 2005;41:345–351.
Trang 25 Bệnh phẩm
nhiều khi giúp cho kháng sinh trúng đích ngay từ đầu
CAP, community-acquired pneumonia; NTA, naso-tracheal aspirate Expert opinion of speaker
Phát hiện tác nhân vi sinh gây CAP
Vai trò xét nghiệm vi sinh
Trang 26CAP: Tác nhân vi sinh thường gặp
Mandell LA, et al Clin Infect Dis 2007;44(Suppl 2):S27–S72.
Outpatient Streptococcus pneumoniae
Mycoplasma pneumoniae Haemophilus influenzae Chlamydophila pneumoniae
Respiratory viruses*
Inpatient (ICU) S pneumoniae
Staphylococcus aureus
Legionella species Gram-negative bacilli
H influenzae
*Influenza A and B, adenovirus, respiratory syncytial virus, and
parainfluenza.ICU, intensive care unit; CAP, community-acquired pneumonia
Mô hình đề kháng các kháng sinh?
Trang 27SOAR, Survey of Antibiotic Resistance; Amox/Clav, amoxicillin/clavulanic acid;
Sul/Trim, sulfamethoxazole/trimethoprim; CLSI, Clinical & Laboratory Standards Institute
Susceptibilities based on CLSI breakpoints
Trang 28Clari Levo Moxi Ax/As Pn
Trang 29Amox/Clav, amoxicillin/clavulanic acid; CLSI, Clinical & Laboratory Standards Institute
Sul/Trim, sulfamethoxazole/trimethoprim; SOAR, Survey of Antibiotic Resistance
Trang 30Clari Levo Moxi Ax/As Ax
Vietnam Pulmonary Society 2018 Van PH EACRI
Study 2017-2018, unpublished data
Intermediate Resistant
Trang 31Nhiễm Hô Hấp Dưới Cộng Đồng
Trang 32M pneumoniae
Resistance to macrolides
Spuesens EB, et al J Infect 2014;69(Suppl 1):S42–46.
The mechanism of macrolide resistance is
the mutation of ribosome 23s
In Vietnam, the mutation of 23S [+] is
detected in 70% of 40 samples
However, it is not clinically relevant
Trang 33Giải pháp phù nào hợp nhất?
Cơ chế đề kháng penicillin của PNE
PSSP MIC≤2µg/ml
PISP MIC=4µg/ml
PRSP MIC≥8µg/ml
Dùng Amox/Clav theo PK/PD
Amox/Clav, amoxicillin/clavulanic acid; PK/PD, pharmacokinetics/pharmacodynamics;
PNC, penicillin; PNE, pneumonia; PRSP, penicillin-susceptible S pneumoniae; PISP, penicillin-intermediate
S pneumoniae; PRSP, penicillin-resistant S pneumoniae; PBP, penicillin binding protein.
Trang 34Streptococcus pneumoniae
MIC 50 and MIC 90 of amoxicillin and penicillin
SOAR (2012)
EACRI (2018)
Amoxicillin MIC 50 1µg/ml 1µg/ml
Penicillin MIC 50 1µg/ml 1µg/ml
MIC, minimum inhibitory concentration; SOAR, Survey of Antibiotic Resistance;
EACRI, Etiology and Efficacy of AMX/SBT therapy in outpatients with
Trang 35Amoxicillin /clavulanic acid
Trang 36Beta-lactamase from H influenzae
Haemophilus influenzae
GIẢI PHÁP KHÁNG SINH CHO ĐỀ KHÁNG AMOXICILLIN
Beta-lactamase inhibitor (clavulanic acid…)
2 nd generation cephalosporin (cefuroxime…)
Expert opinion of speaker
Trang 37Amox/Clav, amoxicillin/clavulanic acid; ATR, antibiotic resistance; ATB, antibiotic; CAP, community-acquired
pneumonia; Cephalo, cephalosporin; HI, H influenzae; MP, M pneumoniae; SPN, S pneumoniae. Expert opinion of speaker
Trang 38128 64 32 16 8 4 2 1 0.5 0.25 0.12
ANTIBIOTIC A
4 2 1 0.5 0.25 0.12 0.06
KẾT HỢP KHÁNG SINH
Amoxicillin + clarithromycin
Van PH EACRI Study 2017-2018, unpublished data
MIC, minimum inhibitory concentration
PM-GBL-ACA-PPT-190014Date of preparation: August 2019
Trang 40 S pneumoniae, H influenzae và M pneumoniae là 3
tác nhân chủ yếu Đa tác nhân rất thường gặp.
đặc biệt ở trẻ em hay người lớn ngoại trú, thường kết hợp tác nhân khác
co-trimoxazol và đang có khuynh hướng gia tăng đề kháng
fluoroquinolone H influenzae kháng cao với macrolide
thế hệ cũ, tetracycline, cotrimoxazole và có tỷ lệ đáng để tiết được beta-lactamse kháng ampicillin/amoxicillin
nghiệm vi sinh bệnh viện
NHIỄM TRÙNG HÔ HẤP DƯỚI CỘNG ĐỒNG
TÁC NHÂN VI SINH VÀ MÔ HÌNH ĐỀ KHÁNG KS
ATB, antibiotic; CAP, community-acquired pneumonia Expert opinion of speaker
Trang 41Streptococcus pneumoniae susceptibility:
Recent data from Thailand, Sri Lanka, Malaysia, Vietnam
and the Philippines
Graphic has been independently created by GSK from information in the publications
– 20THAILAND
1
Amoxicillin/clavulanic acidPenicillin (oral)
CefuroximeCefiximeAzithromycinClarithromycinMoxifloxacinLevofloxacin
1 Torumkuney D, et al J Antimicrob Chemother 2016;71(Suppl 1):i3–i19 2 Amarasinghe N, et al J Health Social Sci 2018;3:27–
36 3 Subramaniam A, et al Indian J Med Res 2018;148:225–231 4 Van PH, et al J Antimicrob Chemother 2016;71(Suppl 1):i93–
i102 5 Available at https://sentry-mvp.jmilabs.com Accessed 6/07/2019
Susceptibilities based on CLSI breakpoints
Data presented only for select representative antibiotics from penicillins, cephalosporins, macrolides and quinolones
CLSI, Clinical and Laboratory Standards Institute
76.1%
4.8%
18.7
%4.2%
5 6.0 %
0.0%
100 0% 1 00 0 %
Trang 42THAILAND 1
Amoxicillin/clavulanic acidPenicillin (oral)
CefuroximeCefiximeAzithromycinClarithromycinMoxifloxacinLevofloxacin
Haemophilus influenzae susceptibility:
Recent data from Thailand, Sri Lanka, Malaysia, Vietnam
and the Philippines
1 Torumkuney D, et al J Antimicrob Chemother 2016;71(Suppl 1):i3–i19
2 Amarasinghe N, et al J Health Social Sci 2018;3:27–36 3 NSAR Report 2015 Malaysia MoH Available at
https://www.imr.gov.my/images/uploads/NSAR/NSAR_2015/edited_251616_NSAR_Antibiotic_Resistance_Surveillance_data_2015.pdf Accessed
10/07/2019 4 Van PH, et al J Antimicrob Chemother 2016;71(Suppl 1):i93–i102 5 Biedenbach DJ, et al Infect Dis Ther 2016;5:139–153
Graphic has been independently created by GSK from information in the publications
Susceptibilities based on CLSI breakpoints
Data presented only for select representative antibiotics from penicillins, cephalosporins, macrolides and quinolones
CLSI, Clinical and Laboratory Standards Institute
Trang 43Thank
you