Từ xa xưa, con người đã biết sử dụng cây cỏ để chữa bệnh. Ngày nay với sự phát triển của khoa học kĩ thuật, việc nghiên cứu các hoạt chất có nguồn gốc thiên nhiên nhằm mục đích dẫn đường cho việc tổng hợp thuốc đã và đang diễn ra mạnh mẽ. Các hợp chất thiên nhiên có cấu trúc hóa học lí thú và hoạt tính sinh học đa dạng đã thu hút sự quan tâm của các nhà khoa học nhằm tìm ra các loại thuốc có giá trị trong điều trị bệnh cho con người, đặc biệt là các bệnh nan y. Trong các loài thực vật có giá trị trong y học phải kể đến các loài cây lá kim (Conifer). Các loài này là nguồn nguyên liệu chứa các hợp chất tự nhiên có hoạt tính sinh học cao ví dụ các hợp chất taxol được phân lập từ loài thông đỏ Pacific (Taxus brevifolia), Hoa Kỳ đã tạo tiền đề cho việc nghiên cứu và sản xuất thuốc Paclitaxel chống ung thư vú (David et al., 2000) hay hợp chất homoharringtonine được phân lập từ nhiều loài trong chi Cephalotaxus được phát triển thành thuốc omacetaxine mepesuccinate sử dụng trong điều trị bệnh bạch cầu mãn tính. Khí hậu Việt Nam phân hóa đa dạng theo địa hình, có 4 miền là khí hậu miền Bắc, miền Nam, khí hậu Đông Trường Sơn và khí hậu biển Đông. Đặc điểm địa hình và thời tiết đó đã tạo ra một thảm thực vật vô cùng đa dạng phong phú. Các loài cây lá kim là những loài cây quan trọng cả về sinh thái, kinh tế và văn hóa tại nhiều địa phương như Lâm Đồng, KomTum, Gia Lai, … Các loài lá kim không chỉ giữ vai trò quan trọng trong các hệ sinh thái rừng trên các vùng núi cao mà còn là nguồn nguyên liệu chính trong nhiều ngành công nghiệp (công nghiệp sơn, xây dựng, công nghiệp chất béo, hóa mỹ phẩm, dược phẩm…), đặc biệt một số loài còn được dùng trong các bài thuốc dân tộc. Theo số liệu thống kê của Nguyễn Tiến Hiệp và cộng sự (2005), trong số 34 loài lá kim ở Việt Nam có tới 15 loài ở Tây Nguyên (chiếm 44,11%). Vì thế mà Tây Nguyên được coi là “cái nôi” của loài lá kim có tính đa dạng vào hàng thứ hai của Việt Nam, đặc biệt là tại Đắk Lắk, Kon Tum và Lâm Đồng. Đỉnh tùng (Cephalotaxus mannii), Hoàng đàn giả (Dacrydium elatum) và Kim giao núi đất (Nageia wallichiana) là những loài cây lá kim có giá trị kinh tế của khu vực Tây Nguyên, Việt Nam. Tuy nhiên, cho tới nay loài Kim giao núi đất vẫn chưa được nghiên cứu về thành phần hóa học và hoạt tính sinh học cả trong và ngoài nước, trong khi Đỉnh tùng mới chỉ được nghiên cứu hạn chế tại một số nước như Trung Quốc, Nhật Bản và chưa được nghiên cứu tại Việt Nam, Hoàng đàn giả mới chỉ có nghiên cứu thành phần hóa học qua tinh của dầu lá.Vì vậy việc nghiên cứu thành phần hóa học và hoạt tính sinh học của ba loài lá kim trên có nhiều triển vọng tìm ra chất có cấu trúc mới và có hoạt tính sinh học lý thú làm tiền đề cho việc nghiên cứu, phát triển thuốc chữa bệnh góp phần nâng cao giá trị nguồn tài nguyên sẵn có ở vùng Tây Nguyên. Kết hợp với kết quả nghiên cứu về đa dạng nguồn gen di truyền tạo cơ sở khoa học vững chắc cho việc khai thác, phát triển bền vững và bảo tồn các loài cây lá kim tại khu vực Tây Nguyên, Việt Nam. Xuất phát từ các cơ sở khoa học nêu trên chúng tôi lựa chọn đề tài “ Nghiên cứu thành phần hóa học, hoạt tính sinh học và đa dạng nguồn gen di truyền của một số loài lá kim ở Tây Nguyên, Việt Nam”
Trang 1VIỆN HÀN LÂM KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ VIỆT NAM
HỌC VIỆN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ
………
NGUYỄN THỊ LIỄU
NGHIÊN CỨU THÀNH PHẦN HÓA HỌC,
HOẠT TÍNH SINH HỌC VÀ ĐA DẠNG NGUỒN
GEN DI TRUYỀN CỦA MỘT SỐ LOÀI LÁ KIM
Ở TÂY NGUYÊN, VIỆT NAM
Chuyên ngành: Hóa hữu cơ
Mã số: 62440114
LUẬN ÁN TIẾN SĨ HÓA HỌC
Người hướng dẫn khoa học:
1 GS.TSKH Trần Văn Sung
2 PGS TS Đinh Thị Phòng
HÀ NỘI - 2017
Trang 2MỤC LỤC
MỞ ĐẦU 1
CHƯƠNG 1 TỔNG QUAN 3
1.1 Tổng quan về 3 loài lá kim nghiên cứu 3
1.1.1 Đặc điểm thực vật và tình trạng bảo tồn 3
1.1.2 Tình hình nghiên cứu thành phần hóa học và hoạt tính sinh học của các loài trong chi Cephalotaxus, Dacrydium và Nageia 9
1.2 Ứng dụng kĩ thuật phân tích ISSR và SSR trong nghiên cứu đa dạng di truyền ở thực vật 27
1.2.1 Kỹ thuật ISSR ( Inter Simple Sequence Repeat ) 27
1.2.2 Kỹ thuật SSR (Simple Sequence Repeat) 27
1.2.3 Một số thành tựu về nghiên cứu đa dạng nguồn gen di truyền của một số loài thuộc chi Cephalotaxus, Dacrydium và Nageia 28
CHƯƠNG 2 THỰC NGHIỆM 32
2.1 Nguyên liệu thực vật 32
2.1.1 Nghiên cứu thành phần hóa học 32
2.1.2 Nghiên cứu đa dạng nguồn gen di truyền 32
2.2 Hóa chất và thiết bị 33
2.2.1 Nghiên cứu thành phần hóa học 33
2.2.2 Nghiên cứu đa dạng nguồn gen di truyền 34
2 3 Chiết tách các chất từ 3 loài lá kim nghiên cứu 34
2.3.1 Phương pháp nghiên cứu 34
2.3.2 Phân lập, tinh chế các chất từ 3 loài lá kim 35
2.4 Hoạt tính sinh học 53
2.4.1 Phương pháp nghiên cứu hoạt tính chống oxi hóa 53
2.4.2 Phương pháp nghiên cứu hoạt tính gây độc tế bào [63-67] 54
2.5 Nghiên cứu đa dạng nguồn gen di truyền 56
2.5.1 Các cặp mồi ISSR và SSR 56
2.5.2 Phương pháp nghiên cứu 56
CHƯƠNG 3 KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 58
Trang 33.1 Thành phần hóa học và hoạt tính sinh học 58
3.1.1 Hoạt tính sinh học của các dịch chiết 58
3.1.2 Xác định cấu trúc hóa học của các chất sạch tách được từ 3 loài lá kim 59
3.1.3 Hoạt tính sinh học của các chất sạch phân lập từ 3 loài lá kim 117
3.2 Đa dạng di truyền nguồn gen của ba loài lá kim nghiên cứu 125
3.2.1 Đa dạng di truyền 126
3.2.2 Cây phát sinh chủng loại của 3 loài lá kim 126
KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ 132
NHỮNG ĐÓNG GÓP MỚI CỦA LUẬN ÁN 135
DANH MỤC CÁC CÔNG TRÌNH CÔNG BỐ LIÊN QUAN ĐẾN LUẬN ÁN 136
TÀI LIỆU THAM KHẢO 137
Trang 4DANH MỤC CÁC KÍ HIỆU, CÁC CHỮ VIẾT TẮT
1H-NMR Proton Nuclear
MagneticResonance Spectrocopy
Phổ cộng hưởng từ hạt nhân proton
13C-NMR Carbon-13 Nuclear Magnetic
Resonance Spectrocopy
Phổ cộng hưởng từ hạt nhân
carbon
DEPT Distortionless Enhancement by
Polarisation Transfer Phổ DEPT HMBC Heteronuclear MultipleBond
HSQC Heteronuclear SingleQuantum
COSY Correlation Spectrocopy Phổ tương tác proton
MS Mass Spectrocopy Phổ khối lượng
ESI-MS Electron Spray IonizationMass
Spectrocopy
Phổ khối ion hóa bằng phun mù điện tử
HR-ESI-MS High Resolution ElectronSpray
Ionization- Mass Spectrocopy
Phổ khối phân giải cao ion hóa bằng phun mù điện tử
NOESY Nuclear Overhauser Effect
ISSR Inter Simple Sequence Repeat Lặp lại trình tự đơn giản ở giữa
IR Infrared Spectrocopy Phổ hồng ngoại
IC50 Inhibitory concentration 50% Nồng độ ức chế có hiệu lực 50%
cá thể
ED50 Effective dose Nồng độ có hiệu quả 50% cá thể
KB Human epidermic carcinoma Ung thư biểu mô
HepG2 Human hepatocellular carcinoma Ung thư gan ở người
Lu-1 Human lung carcinoma Ung thư phổi
MCF-7 Human breast carcinoma Ung thư vú
SW626 Human ovarian adenocarcinoma Ung thư buồng trứng
SW480 Human colon adenocarcinoma Ung thư đại tràng ở người HL-60 Human promyeloccytic leukemia Ung bạch cầu cấp tính
SK-Mel2 Human malignant melanoma Ung thư hắc tố
Trang 5COLO-205 Ung thư ruột kết
PIC Polymorphic Information
Content Hàm lượng thông tin đa hình DNA Deoxyribonucleic acid Axit deoxyribonucleic
PCR Polymerase Chain Reaction Phản ứng chuỗi polymerase
Trang 6DANH MỤC BẢNG
Bảng 1.1 Các loài thực vật thuộc chi Cephalotaxus 4 Bảng 1.2 Các loài thực vật thuộc chi Dacrydium 5 Bảng 1.3 Các kiểu khung carbon của các hợp chất alkaloid được phân lập từ
chi Cephalotaxus 10 Bảng 1.4 Các alkaloid khung homoerythrine phân lập từ một số loài thuộc
chi Cephalotaxus 16 Bảng 1.5 Bảng giá trị IC50 thử hoạt tính gây độc tế bào đối với 2 dòng tế bào
L1210 và KB của các alkaloid phân lập từ lá của loài C harringtonia var nana [15] [20] 25 Bảng 2.1 Nguồn gốc và ký hiệu của các mẫu thuộc 3 loài lá kim dùng trong
nghiên cứu đa dạng di truyền nguồn gen 32
Bảng 2.2 Hàm lượng % các cao chiết so với mẫu khô cây Hoàng đàn giả 42 Bảng 2.3 Hàm lượng % các cao chiết so với mẫu khô cây Kim giao núi đất 46 Bảng 3.1 Kết quả thử hoạt tính chống oxi hóa của các dịch chiết từ loài Kim
giao núi đất 58
Bảng 3.2 Kết quả thử hoạt tính gây độc tế bào của dịch chiết HTE tổng và
dịch chiết HĐE với 4 dòng tế bào ung thư 58
Trang 7Bảng 3.10 Dữ liệu phổ 1H và 13C-NMR của HĐ1và Lambertic acid 83
Bảng 3.11 Dữ liệu phổ NMR của HĐ2, Salvinolone [106] và Montbretol 87
Bảng 3.12 Dữ liệu phổ 1H-NMR, 13CNMR, HMBC, NOESY của HĐ2 đo trong CDCl3 88
Bảng 3.13 Dữ liệu phổ 1H và 13C-NMR của HĐ4 và Ponasterone A 92
Bảng 3.14 Dữ liệu phổ 1H và 13C-NMR của hợp chất HĐ5 và 20-hyđroxyecdysone 95
Bảng 3.15 Dữ liệu phổ 1H-NMR và 13C-NMR của HĐ6 và ajugasterone C 98
Bảng 3.16 Dữ liệu phổ 1H-NMR và 13C-NMR của KG1 và Amentoflavone 100
Bảng 3.17 Số liệu phổ 1H NMR và 13C NMR của các chất KG1, KG2, KG3 103
Bảng 3.18 Dữ liệu phổ NMR của KG4 và 3β-hydroxytotarol 105
Bảng 3.19 Dữ liệu phổ NMR của KG5 và totarol-19-carboxylic acid 107
Bảng 3.20 Dữ liệu phổ 1H-NMR và 13C-NMR của KG6 và Ferruginol 109
Bảng 3.21 Dữ liệu phổ NMR của KG7 và Sugiol 112
Bảng 3.22 Kết quả thử nghiệm hoạt tính chống oxi hóa của chất DT4 117
Bảng 3.23 Kết quả thử hoạt tính chống oxi hóa của các chất sạch phân lập từ loài Kim giao núi đất 117
Bảng 3.24 Kết quả thử hoạt tính gây độc tế bào của DT4 với 4 dòng tế bào ung thư 118
Bảng 3.25 Kết quả thử hoạt tính gây độc tế bào của các chất phân lập từ loài Hoàng đàn giả 118
Bảng 3.26 Hoạt tính gây độc tế bào của các chất KG1, KG4, KG5, KG8 và KG9 119
Bảng 3.27 Tổng kết các hợp chất phân lập được từ 3 loài lá kim nghiên cứu 121
Bảng 3.28 Một số thông số di truyền của 3 loài lá kim phân tích tổ hợp với hai chỉ thị ISSR và SSR 126
Trang 8DANH MỤC HÌNH
Hình 1.1 Cây Đỉnh tùng (C mannii) Tà Nung, Lâm Đồng và mẫu tiêu
bản 4
Hình 1.2 Cây Hoàng đàn giả (D elatum) ở Lâm Đồng và mẫu tiêu bản 6
Hình 1.3 Cây Kim giao núi đất (N wallichiana) ở Lâm Đồng và mẫu tiêu bản 8
Hình 1.4 Các hợp chất cephalotaxine không có mạch nhánh tại C-3 12
Hình 1.5 Các hợp chất harringtonine phân lập từ chi Cephalotaxus 14
Hình 1.6 Các hợp chất alkaloid khung Drupacine phân lập từ chi Cephalotaxus 15
Hình 1.7 Cấu trúc các hợp chất homoerythrina alkaloid 16
Hình 1.8 Các hợp chất flavonoid phân lập từ một số loài thuộc chi Cephalotaxus 19
Hình 1.9 Các hợp chất diterpenoid và norditerpen phân lập từ một số loài thuộc chi Cephalotaxus 21
Hình 1.10 Cấu trúc của một số hợp chất phân lập từ loài C mannii 22
Hình 1.11 Các hợp chất từ một số loài thuộc chi Dacrydium 23
Hình 1.12 Kỹ thuật ISSR và SSR [53] 28
Hình 2.1 Sơ đồ chiết alkaloid tổng từ lá và cành của Đỉnh tùng 36
Hình 2.2 Sơ đồ phân lập các chất từ cặn alkaloid tổng của lá và cành Đỉnh tùng 37
Hình 2.3 Sơ đồ phân lập các chất từ vỏ Đỉnh tùng 38
Hình 2.4 Sơ đồ chiết từ mẫu thân và cành Hoàng đàn giả 42
Hình 2.5 Sơ đồ phân lập các chất từ dịch chiết EtOAc mẫu thân và cành Hoàng đàn giả 43
Hình 2.6 Sơ đồ chiết từ mẫu lá và cành Kim giao núi đất 47
Hình 2.7 Sơ đồ phân lập các chất từ cao chiết n-hexane lá và cành Kim giao núi đất 47
Hình 2.8 Sơ đồ phân lập các chất từ cao chiết MeOH lá và cành Kim giao núi đất 48
Hình 2.9 Sơ đồ phân lập các chất từ dịch chiết EtOAc lá và cành Kim giao núi đất 50
Hình 3.1 Phổ 1H-NMR của hợp chất DT1 61
Hình 3.2 Phổ 13C-NMR và DEPT của hợp chất DT1 61
Hình 3.3 Phổ 1H-NMR của hợp chất DT2 64
Trang 9Hình 3.4 Phổ13C-NMR và DEPT của hợp chất DT2 64
Hình 3.5 Phổ 1H-NMR giãn của hợp chất DT3 67
Hình 3.6 Phổ13C-NMR và DEPT của hợp chất DT3 67
Hình 3.7 Phổ 1H-NMR của hợp chất DT4 69
Hình 3.8 Phổ13C-NMR và DEPT của hợp chất DT4 70
Hình 3.9 Phổ khối phân giải cao HR- ESI- MS của DT5.1 và DT5.2 73
Hình 3.10 Phổ 1H-NMR của DT5.1 và DT5.2 73
Hình 3.11 Phổ 1H-NMR giãn của DT5.1 và DT5.2 74
Hình 3.12 Phổ 13C-NMR và DEPT của DT5.1 và DT5.2 74
Hình 3.13 Phổ 1H-NMR giãn của hợp chất DT6 76
Hình 3.14 Phổ13C-NMR và DEPT của hợp chất DT6 76
Hình 3.15 Phổ 1H-NMR giãn của hợp chất DT7 78
Hình 3.16 Phổ 1H-NMR giãn của hợp chất DT8 80
Hình 3.17 Phổ 13C-NMR và DEPT của hợp chất DT8 80
Hình 3.18 Phổ 1H-NMR của hợp chất HĐ1 84
Hình 3.19 Phổ 1H-NMR giãn của hợp chất HĐ1 84
Hình 3.20 Phổ 13C-NMR và DEPT của hợp chất HĐ1 85
Hình 3.21 Phổ 1H-NMR của hợp chất HĐ2 đo trong CDCl3 89
Hình 3.22 Phổ 13C-NMR và DEPT của hợp chất HĐ2 đo trong CDCl3 89
Hình 3.23 Phổ HMBC của hợp chất HĐ2 đo trong CDCl3 90
Hình 3.24 Phổ NOESY của HĐ2 trong CDCl3 90
Hình 3.25 Phổ 1H-NMR của hợp chất HĐ4 93
Hình 3.26 Phổ 1H-NMR giãn của hợp chất HĐ4 94
Hình 3.27 Phổ 13C-NMR và phổ DEPT của hợp chất HĐ4 94
Hình 3.28 Phổ 1H-NMR của hợp chất HĐ5 96
Hình 3.29 Phổ 1H-NMR giãn của hợp chất HĐ5 96
Hình 3.30 Phổ 13C-NMR và DEPT của hợp chất HĐ5 97
Hình 3.31 Phổ 1H-NMR của hợp chất HĐ6 98
Hình 3.32 Phổ 1H-NMR giãn của hợp chất HĐ6 99
Hình 3.33 Phổ 1H-NMR của KG1 101
Hình 3.34 Phổ 13C-NMR và DEPT của hợp chất KG1 102
Hình 3.35 Phổ 1H-NMR giãn của hợp chất KG4 106
Trang 10Hình 3.36 Phổ 13C-NMR và DEPT của KG4 106
Hình 3.37 Phổ 1H-NMR của hợp chất KG5 108
Hình 3.38 Phổ 13C-NMR và DEPT của hợp chất KG5 108
Hình 3.39 Phổ 1H-NMR giãn của hợp chất KG6 110
Hình 3.40 Phổ 13C-NMR và DEPT của hợp chất KG6 111
Hình 3.41 Phổ 1H-NMR của KG7 112
Hình 3.42 Phổ 13C-NMR và DEPT của hợp chất KG7 113
Hình 3.43 Phổ 1H-NMR giãn vùng trường cao của KG8 114
Hình 3.44 Phổ 1H-NMR giãn vùng trường thấp của KG8 114
Hình 3.45 Phổ 13C-NMR và DEPT của hợp chất KG8 115
Hình 3.46 Biểu đồ hình cây tính theo phương pháp của Jacccard và kiểu phân nhóm UPGMA thể hiện mối quan hệ di truyền của 34 mẫu Đỉnh tùng phân tích với chỉ thị ISSR và SSR (Ghi chú: a: mẫu ở Hiệp An, b: mẫu ở Tà Nung) 127
Hình 3.47 Biểu đồ hình cây tính theo phương pháp của Jacccard và kiểu phân nhóm UPGMA thể hiện mối quan hệ di truyền của 70 mẫu Hoàng đàn giả phân tích với chỉ thị ISSR và SSR (Ghi chú: a: mẫu ở Sơn Lang, A Yun và Kon Chư Răng (Gia Lai); b: mẫu ở Hòa Sơn (Đắk Lắk); c: mẫu ở Đa Chais (Lâm Đồng); d: mẫu ở Xã Hiếu (Kon Tum) 128
Hình 3.48 Biểu đồ hình cây tính theo phương pháp của Jacccard và kiểu phân nhóm UPGMA thể hiện mối quan hệ di truyền của 70 mẫu Kim giao núi đất với chỉ thị ISSR và SSR (Ghi chú: a: mẫu thu ở A Yun, b: mẫu thu ở Hòa Sơn, c: mẫu thu ở Đa Chais, d: mẫu thu ở Tà Nung, e: mẫu thu ở Xã Hiếu 129
Trang 11MỞ ĐẦU
Từ xa xưa, con người đã biết sử dụng cây cỏ để chữa bệnh Ngày nay với sự phát triển của khoa học kĩ thuật, việc nghiên cứu các hoạt chất có nguồn gốc thiên nhiên nhằm mục đích dẫn đường cho việc tổng hợp thuốc đã và đang diễn ra mạnh
mẽ Các hợp chất thiên nhiên có cấu trúc hóa học lí thú và hoạt tính sinh học đa dạng đã thu hút sự quan tâm của các nhà khoa học nhằm tìm ra các loại thuốc có giá trị trong điều trị bệnh cho con người, đặc biệt là các bệnh nan y Trong các loài thực vật có giá trị trong y học phải kể đến các loài cây lá kim (Conifer) Các loài này là nguồn nguyên liệu chứa các hợp chất tự nhiên có hoạt tính sinh học cao ví dụ các
hợp chất taxol được phân lập từ loài thông đỏ Pacific (Taxus brevifolia), Hoa Kỳ đã
tạo tiền đề cho việc nghiên cứu và sản xuất thuốc Paclitaxel chống ung thư vú
(David et al., 2000) hay hợp chất homoharringtonine được phân lập từ nhiều loài trong chi Cephalotaxus được phát triển thành thuốc omacetaxine mepesuccinate sử
dụng trong điều trị bệnh bạch cầu mãn tính
Khí hậu Việt Nam phân hóa đa dạng theo địa hình, có 4 miền là khí hậu miền Bắc, miền Nam, khí hậu Đông Trường Sơn và khí hậu biển Đông Đặc điểm địa hình
và thời tiết đó đã tạo ra một thảm thực vật vô cùng đa dạng phong phú Các loài cây
lá kim là những loài cây quan trọng cả về sinh thái, kinh tế và văn hóa tại nhiều địa phương như Lâm Đồng, KomTum, Gia Lai, … Các loài lá kim không chỉ giữ vai trò quan trọng trong các hệ sinh thái rừng trên các vùng núi cao mà còn là nguồn nguyên liệu chính trong nhiều ngành công nghiệp (công nghiệp sơn, xây dựng, công nghiệp chất béo, hóa mỹ phẩm, dược phẩm…), đặc biệt một số loài còn được dùng trong các bài thuốc dân tộc Theo số liệu thống kê của Nguyễn Tiến Hiệp và cộng sự (2005), trong số 34 loài lá kim ở Việt Nam có tới 15 loài ở Tây Nguyên (chiếm 44,11%) Vì
thế mà Tây Nguyên được coi là “cái nôi” của loài lá kim có tính đa dạng vào hàng
thứ hai của Việt Nam, đặc biệt là tại Đắk Lắk, Kon Tum và Lâm Đồng
Đỉnh tùng (Cephalotaxus mannii), Hoàng đàn giả (Dacrydium elatum) và Kim giao núi đất (Nageia wallichiana) là những loài cây lá kim có giá trị kinh tế của khu
vực Tây Nguyên, Việt Nam Tuy nhiên, cho tới nay loài Kim giao núi đất vẫn chưa
Trang 12được nghiên cứu về thành phần hóa học và hoạt tính sinh học cả trong và ngoài nước, trong khi Đỉnh tùng mới chỉ được nghiên cứu hạn chế tại một số nước như Trung Quốc, Nhật Bản và chưa được nghiên cứu tại Việt Nam, Hoàng đàn giả mới chỉ có nghiên cứu thành phần hóa học qua tinh của dầu lá.Vì vậy việc nghiên cứu thành phần hóa học và hoạt tính sinh học của ba loài lá kim trên có nhiều triển vọng tìm ra chất có cấu trúc mới và có hoạt tính sinh học lý thú làm tiền đề cho việc nghiên cứu, phát triển thuốc chữa bệnh góp phần nâng cao giá trị nguồn tài nguyên sẵn có ở vùng Tây Nguyên Kết hợp với kết quả nghiên cứu về đa dạng nguồn gen di truyền tạo cơ
sở khoa học vững chắc cho việc khai thác, phát triển bền vững và bảo tồn các loài cây
lá kim tại khu vực Tây Nguyên, Việt Nam Xuất phát từ các cơ sở khoa học nêu trên
chúng tôi lựa chọn đề tài “ Nghiên cứu thành phần hóa học, hoạt tính sinh học và
đa dạng nguồn gen di truyền của một số loài lá kim ở Tây Nguyên, Việt Nam”
Mục tiêu nghiên cứu của luận án
- Nghiên cứu thành phần hóa học và hoạt tính sinh học của 3 loài lá kim:
Đỉnh tùng (Cephalotaxus mannii), Hoàng đàn giả (Dacrydium elatum) và Kim giao núi đất (Nageia wallichiana) nhằm tìm kiếm các hợp chất có hoạt tính sinh học cao
và có cấu trúc hóa học lí thú
- Nghiên cứu đa dạng nguồn gen di truyền của 3 loài lá kim trên cơ sở phân tích hai chỉ thị ISSR và SSR nhằm cung cấp thông tin khoa học có giá trị giúp cho công tác bảo tồn các loài lá kim – một loài cây quan trọng của vùng Tây Nguyên,
Việt Nam
Nội dung luận án
1 Phân lập các hợp chất từ bộ phận lá, thân cành và vỏ của 3 loài Đỉnh tùng
(Cephalotaxus mannii), Hoàng đàn giả (Dacrydium elatum) và Kim giao núi đất (Nageia wallichiana) bằng phương pháp sắc ký cột
2 Xác định cấu trúc hoá học các hợp chất phân lập được bằng các phương pháp phổ IR, MS, 1D-NMR, 2D-NMR
3 Thử hoạt tính chống oxi hóa và hoạt tính gây độc tế bào của các dịch chiết và các chất sạch phân lập được
4 Đánh giá tính đa dạng nguồn gen di truyền của 3 loài lá kim nghiên cứu
Trang 13khổng lồ như Cụ Tùng (Sequoia gigantea) ở vùng núi Sierra Nevada (Hoa Kỳ) có chiều cao tới 142 m với tuổi thọ đạt 3000 - 4000 năm, hay loài Ngân Hạnh (Ginkgo biloba) ở Sơn Đông, Trung Quốc cao tới 25 m với chu vi thân đạt tới 16 m Nhưng trong đó cũng có loài lại được trồng làm cây cảnh như Thanh tùng (Juniprus chinensis), Tùng xà (Juniperus squamata), Thông la hán (Podocarpus chinensis),…
ở Trung Quốc, Nhật Bản và Việt Nam [2]
Tại Việt Nam, đã phát hiện và xác định được khoảng 34 loài thuộc 5 họ trong lớp Thông (Pinopsida) Trong số đó 15 loài được tìm thấy ở khu vực Tây Nguyên (gồm các tỉnh Kon Tum, Gia Lai, Đắc Lăk, Đắc Nông và Lâm Đồng) đó là:
Đỉnh tùng (Cephalotaxus mannii), Pơ mu, Bách xanh núi đất, Thông nước, Du sam
núi đất, Thông đà lạt, Thông ba lá, Thông hai lá, Thông lá dẹt, Thông lông gà,
Hoàng đàn giả (Dacrydium elatum), Kim giao núi đất (Nageia wallichiana), Thông
tre lá dài, Dẻ tùng nam và Thông đỏ nam Các loài này đều có giá trị kinh tế và ứng dụng trong y học [3] [4]
1.1.1.1 Đỉnh tùng (Cephalotaxus mannii)
Đỉnh tùng: Tên khoa học Cephalotaxus mannii Hook.f (Taxaceae)
Năm 1995 tác giả K E Tripp đã xác định chi Cephalotaxus có mười loài [5] Đến năm 1999 các tác giả L Fu, N Li và R R Mill đã xác định thêm một loài là C latifolia Cheng and Fu [6] Như vậy hiện nay trên thế giới chi Cephalotaxus được công nhận gồm 11 loài Ở Việt Nam có 2 loài là C mannii và C oliveri [7]
Trang 14Bảng 1.1 Các loài thực vật thuộc chi Cephalotaxus
1 C fortune Hooker 7 C latifolia Cheng and Fu
2 C griffithii Hooker 8 C mannii Hooker
3 C hainanensis Li 9 C oliveri Masters
4 C harringtonia (Fobers) Koch 10 C sinensis (Rehder and Wilson) Li
5 C koreana Nakai
11 C wilsoniana Hayata
6 C lanceolata Feng
Mô tả hình thái: Cây gỗ nhỏ, thường xanh, cây trưởng thành có thể cao từ
10 - 15 m Thân tròn, vỏ trơn nhẵn (vỏ non có màu đỏ, vỏ già bong thành mảng màu trắng) Cành mảnh, mọc đối và xòe ngang Lá mọc xoắn ốc, xếp thành 2 dãy, hình dải, dài 2 - 4cm, rộng 0,2 - 0,4cm, thẳng hay hơi cong ở gần đầu, ở mặt dưới có 2 dải lỗ khí màu trắng Mùa ra nón tháng 3 - 5, mùa quả chín tháng 8 - 10 năm sau Đỉnh tùng tái sinh bằng hạt tốt, mọc rải rác trên các sườn và đỉnh núi đất và núi đá vôi với đội cao từ 600 - 1400 m [7]
Phân bố: Trên thế giới Đỉnh tùng phân bố ở khu vực Nam và Đông Nam Á bao gồm: Ấn Độ, Trung Quốc, Nhật Bản, Hàn Quốc, Lào, Bắc Myanmar, Bắc Thái Lan Tại Việt Nam loài này được ghi nhận có ở Lào Cai, Hà Giang, Sơn La, Cao Bằng, Hòa Bình, Hà Nội (Ba Vì), Quảng Trị, Thừa Thiên Huế, Kon Tum, Gia Lai, Lâm Đồng và Thanh Hóa [7]
Hình 1.1 Cây Đỉnh tùng (C mannii) Tà Nung, Lâm Đồng và mẫu tiêu bản
(nguồn Bảo tàng Thiên nhiên Việt Nam)
Trang 15 Công dụng: Gỗ Đỉnh tùng có chất lượng cao, chịu mối mọt, được sử dụng làm đồ gỗ cao cấp, đồ mỹ nghệ và cán công cụ Vỏ cây được dùng chữa sốt tại đảo Hải Nam, Trung Quốc Nó còn được sử dụng làm cây cảnh do các cây có hình dáng
đẹp và độc đáo [7]
Đánh giá tình trạng bảo tồn: Trong sách Đỏ Việt Nam (2007) [8], loài Đỉnh
tùng được đánh giá là sẽ nguy cấp VU A1,c,d, B1+2b,c Trong danh lục đỏ của
IUCN năm 2012, loài này được xếp VU A1d ở phạm vi toàn cầu Căn cứ vào các dẫn liệu thu thập được qua khảo sát, nghiên cứu ở các điểm còn rừng nguyên sinh ở hầu khắp nước ta trong nhiều năm qua và đối chiếu với tiêu chuẩn của các thứ hạng trong Danh lục đỏ của IUCN nhận thấy loài Đỉnh tùng đáp ứng được các tiêu chuẩn
VU A4a,c,d, B1,2a,b, C (sự suy giảm quần thể trong quá khứ, hiện tại và dự đoán
tương lai nhiều nhất > 30%, EOO < 20.000 km2, AOO < 2.000 km2,, số lượng tiểu quần thể ≤ 20); tuy nhiên số lượng cá thể trưởng thành ước tính ≤ 2.500, thuộc
khung EN chứ không phải VU) [3] [4]
1.1.1.2 Hoàng đàn giả (Dacrydium elatum)
Hoàng đàn giả còn có các tên gọi khác Hồng tùng, Bạch đàn, tên khoa học là
Dacrydium elatum Wall.ex Hook (Podocarpaceae) [7] Chi Dacrydium là một chi
tương đối lớn, hiện nay chi này gồm 21 loài đã được xác định [9] Ở Việt Nam theo tác
giả Phạm Hoàng Hộ chỉ tìm thấy 1 loài là D elatum [7]
Bảng 1.2 Các loài thực vật thuộc chi Dacrydium
Trang 16 Mô tả hình thái: Cây gỗ mọc đứng với thân ít cành nhánh, các cành mọc hướng lên tạo thành tán hình vòm nhỏ, chiều cao tới 30 m với đường kính ngang ngực tới 0,8 m Cây mọc trong rừng nguyên sinh rậm thường xanh hỗn giao nhiệt đới gió mùa núi thấp, đôi khi ở vùng đất thấp hoặc núi trung bình trên các sườn núi (nhiệt độ trung bình năm khoảng 16-22oC, lượng mưa trên 1700 mm) trên cả đất phong hóa từ granit hoặc các đá silicat khác cũng như trên các động núi đá vôi kết tinh trắng bị bào mòn mạnh Gặp chủ yếu ở độ cao 700-2000 m trên mặt biển, hoặc
có khi xuống gần mực nước biển như Kiên Giang (đảo Phú Quốc, nơi có nhiệt độ trung bình năm 26oC, lượng mưa năm trên 3000 mm) Trên thế giới, loài này chỉ hạn chế ở các vùng núi có độ cao trên 1000 m trên mặt biển Ở các vùng núi thấp và
trung bình loài này mọc cùng với Thông lá dẹt (Pinus krempfii), Thông đà lạt (Pinus dalatensis), Thông tre lá dài (Podocarpus neriifolius), Pơ mu (Fokienia hodginsii)
và Thông nàng (Dacrycarpus imbricatus) [7]
Phân bố: Trên thế giới loài Hoàng đàn giả được tìm thấy ở Myanmar, Thái Lan, Lào, Campuchia, Malaysia, Indonesia Ở Việt Nam loài này phân bố rộng khắp
từ Hà Giang, Lai Châu, Tuyên Quang, xuống dọc dải Trường Sơn, từ Bắc (Hà Tĩnh) qua Trung (từ Quảng Bình, Kon Tum đến Gia Lai) đến Nam (Đắk Lắk, Lâm Đồng, Khánh Hòa và Ninh Thuận) và kết thúc ở Nam Đông Dương (Kiên Giang) [7]
Hình 1.2 Cây Hoàng đàn giả (D elatum) ở Lâm Đồng và mẫu tiêu bản
(Nguồn Bảo tàng Thiên nhiên Việt Nam)
Trang 17 Công dụng: Gỗ Hoàng đàn giả chịu ngâm và được sử dụng làm thuyền và cầu, đóng đồ gỗ Nhựa dùng làm hương Loài này còn có thể là nguồn cung cấp hoạt chất làm thuốc trừ sâu Một số nơi ở Việt Nam loài này được dùng kết hợp với những cây khác để chữa kiết lị [9]
Đánh giá tình trạng bảo tồn: Căn cứ vào các dẫn liệu thu thập được qua khảo sát, nghiên cứu ở các điểm còn rừng nguyên sinh ở hầu khắp nước ta trong nhiều năm qua và đối chiếu với tiêu chuẩn của các thứ hạng theo danh lục đỏ của
IUCN thấy loài đáp ứng được các tiêu chuẩn sẽ nguy cấp: VU A4a,c,d, B2b(ii, iii,
v), C (sự suy giảm quần thể trong quá khứ, hiện tại và dự đoán tương lai nhiều nhất <
30%, EOO < 20.000 km2, AOO < 1.000 km2,, số lượng tiểu quần thể ≤ 20, số lượng
cá thể trưởng thành ≤ 2500) [3] [4]
1.1.1.3 Kim giao núi đất (Nageia wallichiana)
Kim giao núi đất hay Thông mụ có tên khoa học là Nageia wallichiana (Presl)
O Ktze (Podocarpaceae), các tên đồng nghĩa khác là Podocarpus wallichianus (Presl), Decussocarpus wallichianus (Presl) de Laubenf [7]
Chi Kim giao (Nageia) là một chi nhỏ gồm 5 loài là N nagi, N wallichiana,
N fomosensis, N motleyi và N fleuryi [10] Ở Việt Nam theo tác giả Phạm Hoàng
Hộ chi này có 2 loài là N nagi và N wallichiana [7]
Mô tả hình thái: Cây gỗ mọc đứng, đơn tính khác gốc với tán hình nón, đạt chiều cao tới 30 m với đường kính ngang ngực tới 1 m Vỏ màu nâu thẫm hay nâu xám, nhẹ, nhẵn, bóc tách thành các mảnh lớn không đều Lá mọc đối hay gần đối nhau, chéo chữ thập, màu xanh đậm ở mặt trên, mặt dưới nhạt hơn, dài tới 16 cm và rộng 5 cm ở cây trưởng thành, hình bầu dục hay hình trứng (dài tới 23 cm và rộng 7
cm ở cây non) với đỉnh nhọn, các dải lỗ khí ở cả hai mặt Nón phân tính khác gốc Cấu trúc mang hạt đơn độc ở nách lá, cuống dài tới 1,7 cm, đế phình ra dưới hạt, màu đen khi chín, phần quanh hạt màu đỏ hồng Nón đực ở nách lá, cụm 3 - 5, dài tới 5 mm Hạt hình cầu, đường kính 1,5 - 1,8 cm, có một mỏ nhỏ ở gần đầu Cây gặp trong rừng nguyên sinh rậm thường xanh hỗ giao và cây lá rộng nhiệt đới gió mùa núi thấp và núi trung bình (nhiệt độ trung bình năm 14-230C, lượng mưa trên 1700 mm) trên đất phong hóa từ granit hoặc các loại đá silicat khác ở
Trang 18độ cao 500-2100 m trên mặt biển Đôi khi gặp ở mức mặt nước biển Mọc cùng với
Thông nàng (Dacrycarpus imbricatus), Đỉnh tùng (C mannii), Thông tre lá dài (Podocarpus neriifolius), Thông đỏ nam (Taxus wallichiana) (phía Nam Việt Nam)
Thỉnh thoảng có tái sinh tự nhiên, cây con hiếm (mặc dù gặp tương đối ít ở khu bảo tồn thiên nhiên Pù Huống) [7][10]
Phân bố: Trên thế giới loài này được bắt gặp ở Brunei, Ấn Độ, Trung Quốc, Thái Lan, Lào, Campuchia, Myanmar, Malaysia, Indonesia, Philippine, và Papua New Guinea Trong nước ở Sơn La, Lào Cai, Hà Giang, Quảng Ninh, Phú Thọ, Bắc Giang, Thanh Hóa, Nghệ An, Hà Tĩnh, Quảng Bình, Quảng Trị, Thừa Thiên–Huế, Đà Nẵng, Quảng Nam, Quảng Ngãi, Kon Tum, Gia Lai, Đắk Lắk, Lâm Đồng, Ninh Thuận, Bình Phước và Kiên Giang [7][10]
Hình 1.3 Cây Kim giao núi đất (N wallichiana) ở Lâm Đồng và mẫu tiêu bản
(nguồn Bảo tàng Thiên nhiên Việt Nam)
Công dụng: Gỗ Kim giao núi đất có giá trị cao, dùng làm nhạc cụ, đũa, đồ
mỹ nghệ và các công cụ gia đình Lá có thể dùng trong phương pháp chữa bệnh truyền thống chữa ho và cây đẹp trồng làm cảnh [7][10]
Đánh giá tình trạng bảo tồn: Độ suy giảm quần thể Kim giao núi đất ở Việt Nam trong quá khứ, hiện tại và tương lai ước tính không vượt quá 30% nên không thể
Trang 19xếp vào mức bị đe dọa theo tiêu chuẩn A (độ suy giảm quần thể) trong danh lục IUCN
Phân tích gần 50 số hiệu tiêu bản N wallichiana được thu ở 36 điểm khác nhau trên 22
tỉnh trải dài từ Bắc vào Nam thì dễ dàng tính được phạm vi phân bố địa lý (EOO >20.000
Km2) Mặc dù quần thể Kim giao núi đất này có nơi cư trú đạt tiêu chuẩn B2 = AOO <
2000 Km2 và đang bị suy giảm, nhưng do các tiểu quần thể này không bị chia cắt mạnh, xuất hiện ở trên 12 điểm và không có sự dao động quá mạnh về khu phân bố, nơi cư trú, tiểu quần thể và số lượng cá thể trưởng thành nên quần thể Kim giao núi đất này được
xếp ở thứ hạng sắp bị đe dọa (NT) [3] [4], thứ hạng gần đạt được là sẽ nguy cấp: VU
Cephalotaxus, Dacrydium và Nageia, chỉ có các loài thuộc chi Cephalotaxus đã được nghiên cứu nhiều về thành phần hóa học, trong khi chi Dacrydium mới chỉ có
các phân tích sơ bộ về thành phần hóa học tinh dầu của lá bằng phương pháp sắc ký khí (GC/MS) Số lượng các nghiên cứu về thành phần hóa học của các loài trong chi
còn rất hạn chế Đặc biệt chi Nageia cho đến nay chưa có nghiên cứu cả trong và
ngoài nước về thành phần hóa học của tất cả các loài
Thành phần hóa học của các loài trong chi Cephlotaxus đã được quan tâm nghiên cứu sớm, từ những năm 60 của thế kỉ 20 gồm các loài như C harringtonia, C fortunei, C hainanensis, C wilsoniana, C sinensis, C oliveri [11] Trong đó loài Đỉnh tùng (C mannii) cũng đã được nghiên cứu song chưa nhiều Các kết quả nghiên cứu cho thấy lớp chất chính trong các loài thuộc chi Cephalotaxus là các alkaloid
Đến nay có hơn 100 hợp chất alkaloid đã được phân lập và xác định cấu trúc Ngoài
ra còn có các lớp chất khác như: flavonoid, diterpenoid, ligan, tropone… song không nhiều [11]
Trang 20Các alkaloid được tìm thấy trong trong chi Cephalotaxus chủ yếu là các hợp
chất có cấu trúc khung carbon kiểu Cephalotaxine, ngoài ra một số ít hợp chất alkaloid có cấu trúc kiểu Drupacine và Homoerythrina [15-18]
Bảng 1.3 Các kiểu khung carbon của các hợp chất alkaloid được phân lập từ chi Cephalotaxus
Khung carbon Cấu trúc cơ bản
Cephalotaxine
Drupacine
Homoerythrina
Cephalotaxine (1) là thành phần hóa học chính của loài C harringtonia var
drupacea và C fortune, đã được Paulder và cộng sự công bố vào năm 1963 [12]
Cấu trúc của 1 sau đó được xác định bởi Powell có bộ khung cơ sở là tetracyclic
alkaloid gồm 1 đơn vị azaspiro [4.4] nonane và một hệ vòng benzazepine [13] Đến nay đã có rất nhiều các hợp chất alkaloid có cấu trúc khung carbon cephalotaxine được phân lập, xác định cấu trúc hóa học và thử hoạt tính sinh học Có thể phân chia các hợp chất này thành 2 nhóm chính một là các hợp chất không có mạch nhánh tại C-3, hai là các hợp chất ester của cephalotaxine tại C-3 đó là các alkaloid harringtonia
Các hợp chất Cephalotaxine không có mạch nhánh tại C-3 đại diện là các
chất từ (1-18, hình 1.4) Cấu trúc trúc phân tử của chúng khác nhau bởi các nhóm
Trang 21thế tại vị trí C2, C3, C11 thường là các nhóm thế hydroxy (-OH), methoxy (-OCH3), hoặc các hợp chất cephalotaxine N-oxide Năm 2016 khi nghiên cứu khả năng trừ
sâu của thực vật loài C sinensis, một loại cây dược liệu quan trọng ở Trung Quốc
nhằm phát hiện ra thuốc trừ sâu mới, các nhà nghiên cứu đã cô lập được 5 hợp chất
alkaloid đó là cephalotaxine (1); 11-hydroxycephalotaxine (2); hydroxycephalotaxine (3); isocephalotaxine (4) và cephalancetin (5) [14] Ba alkaloid mới là cephalezomin G (8), H (9), J (7) và demethylcephalotaxinone (6), đã
4-được phân lập từ lá của loài C harringtonia var nana [15] Các hợp chất
epicephalotaxine (10), demethylcephalotaxine (11) và cephalotaxinone (12) được
phân lập từ loài C fotunei [16] Năm 2016 trong một báo cáo các nhà nghiên cứu Trung Quốc đã phân lập được từ cành và lá của 2 loài C lanceolata và C fortune
var alpine các hợp chất cephalotine C (16), isocephalotaxinone (14) và
demethylcephalotaxine (15) [11] Các hợp chất cephalotaxine N- oxide (16-18) đã
được Jossang và cộng sự xác định năm 2003 từ hạt của loài C fortune là cephalotaxine-α-N-oxide (16), Cephalotaxine-β-N-oxide (17), 11-β-
hydroxycephalotaxine- β-N-oxide (18) [17] Năm 2013 trong một báo cáo về thành
phần hóa học của loài C lanceolata các nhà nghiên cứu Trung Quốc đã cô lập và
xác định cấu trúc của 13 alkaloid trong đó có hợp chất mới là cephalancetines A
(19) và 2 hợp chất đã biết thuộc loại không có mạch nhánh tại C-3 là cephalotaxineamide (20), 4-hydroxycephalotaxine (21), 2 hợp chất dimer không đối xứng thuộc loại này là cephalancetine D (22) và cephalancetine C (23) [18]
Trang 22O O
21
O O
N
HO
O O
N HO
H O
O O
Trang 23(24-51, hình 1.5) Năm 1996 trong một công bố kết quả nghiên cứu về thành phần
hóa học của loài C harringtonia var drupecea các nhà khoa học Nhật Bản đã phân
lập được 8 alkaloid trong đó có 4 hợp chất là harringtonine (24), isoharringtonine (25), deoxyharringtonine (26), homoharringtonine (30) tại vị trí C-4’ nhóm
carboxylic đã bị ester hóa và bốn hợp chất có chứa nhóm carboxylic (COOH) dạng
tự do tại vị trí C-4’ là 5’-des-O-methylharringtonine (27),
3’S-hiđroxy-methylharringtonine (28), methylisoharringtonine (29), methylhomoharringtonine (31) [19] Kobayashi và cộng sự (2000 và 2002) đã phân
5’-des-O-lập từ lá của loài C harringtonia var nana 6 hợp chất mới là cephalezomine C, D,
E, F (32-35) [20] và cephalezomine K, L (36a/b) [15], cấu trúc của chúng được xác
định bằng phương pháp đo phổ Trong một nghiên cứu khác từ lá và thân loài C
drupacea đã phân lập được các hợp chất: nordeoxyharringtonine (37),
homodeoxyharringtonine (38) và bishomodeoxyharringtonine (39) là các chất có
mạch nhánh khác nhau về chiều dài và mức độ oxi [21] Trong hai năm 1996 và
1997 các nhà nghiên cứu Nhật bản đã phân lập và xác định cấu trúc của các hợp
chất là ester cephalotaxine từ loài C harringtonia var drupacea gồm:
neoharringtonine (40), homoneoharringtonine (41), 3’S-hyđroxyneo harringtonine (42) [22] và 11α-hydroxyhomodeoxyharringtonine (43), 11-β-
hydroxyhomodeoxyharringtonine (44), và 11β-hydroxy-deoxyharringtonine (45)
[23] Các hợp chất dimer alkaloid cũng được cô lập đặc biệt là các hợp chất
heterodimer có tên là bis-cephalezomine A–E (46-51) được cô lập từ C
harringtonia var nana [24]
Trang 24Hình 1.5 Các hợp chất harringtonine phân lập từ chi Cephalotaxus
43 n=2, α-OH
44 n=2, β-OH
45 n=1, β-OH
Trang 25Các hợp chất alkaloid drupacine cũng có cấu trúc khung carbon của cephalotaxine thêm một cầu nối oxi giữa C-11 với C-2 hoặc C-3 đại diện cho các hợp
chất này là các alkaloid (52-58, hình 1.6) Các hợp chất drupacine không có mạch nhánh (52- 55) gồm drupacine (52) được phân lập từ loài C.sinensis [14] và C harringtonia var nana [20]; 2 hợp chất là cephalotine A (53), cephalotine B (54) được
phân lập từ các loài C lanceolata và C fortune var alpina [11] ; cephalancetine B
(55) phân lập từ loài C. lanceolata [18] Các hợp chất ester có mạch nhánh tại C-3 lần
lượt là drupangtonine và cephalezomines A, B (56-58) phân lập từ C drupacea [23]
và C harringtonia var nana [20] Các hợp chất này chiếm một lượng nhỏ trong các hợp chất alkaloid được phân lập từ các loài thuộc chi Cephalotaxus
Hình 1.6 Các hợp chất alkaloid khung Drupacine phân lập từ chi Cephalotaxus
Các hợp chất Homoerythrina alkaloid lần đầu tiên được báo cáo từ chi
Cephalotaxus vào năm 1972 bởi Powell [12] Tuy nhiên kể từ đó đến nay số lượng
các hợp chất này tăng lên không nhiều Chúng chiếm thành phần nhỏ trong các dịch
chiết của các loài thuộc chi Cephalotaxus Về cấu trúc cơ bản các hợp chất này gồm
một hệ thống 4 vòng ngưng tụ 6/7/5/6 trong đó vòng 5 cạnh chứa dị tố nitơ Đại
diện các hợp chất này bao gồm các chất (59-77)
53 α-OH
54 β-OH
Trang 26Hình 1.7 Cấu trúc các hợp chất homoerythrina alkaloid
Bảng 1.4 Các alkaloid khung homoerythrine phân lập từ một số loài thuộc chi Cephalotaxus
Trang 27R3=R4= OCH3 C fortune var
Ngoài các alkaloid, thành phần hóa học của chi Cephalotaxus còn có các lớp
chất khác như flavonoid, diterpenoid, tropone…
Đặc biệt là các hợp chất flavonoid thể hiện nhiều hoạt tính sinh học đa dạng
Mười ba flavonoid (78-90) được phân lập từ lá và cành loài C lanceolata, trong đó
có hai hợp chất mới là 6-C-methyl-7,4’,4”’-tri-O-methylamentoflavone (78) và apigenin-6-C-methyl-7-O-β-D-glucopyranoside (79) và 12 hợp chất đã biết là
C koreana trong đó có 1 flavone glycoside mới là hợp chất 86 và 4 hợp chất đã biết
là quercetin 3,7-di-O-glucoside (91), quercetin 3-O-α-L-rhamnopyranoside (92) , quercetin-3-O-β-D-glucopyranoside (93), và quercetin 3-O-(6”-O-acetyl)-β-D-
glucoside (94) [30] Từ dịch chiết ethanol của loài C wilsoniana đã phân lập được
các hợp chất flavone bị methyl hóa tại một số vị trí khác nhau đó là
taiwanhomoflavone-B (95), 7,4’,7”-tri-O-methylamentoflavone (96), và O-β-D-glucoside (97), cấu trúc của chúng được xác định bằng phương pháp phổ [31]
Trang 28apigenin-7-Sáu hợp chất biflavone khung amentoflavone được cô lập từ dịch chiết EtOAc của
loài C koreana Nakai gồm bilobetine (98), ginkgetine (83),
4’,7”-di-O-methylamentoflavone (99), 7-O-methyl-isoginkgetine (100), sciadopitysine (101), và
OH
O
O
OH OH OH
OH
O
87
O OH
O
O OH
OH OH HO
H
Trang 30Abietane là một diterpenoid thơm được tìm thấy trong một số loài thuộc chi
Cephalotaxus Năm 2003, Politi và cộng sự đã phân lập được 6 hợp chất abietane
diterpenoid (103-108) từ hạt của loài C harringtonia trong đó có 2 hợp chất mới là
8β-hydroxy-9(11),13-abietadien-12-one (105) và 5,6-didehydroferruginol (108), bốn hợp chất đã biết được xác định là ferruginol (103), sugiol (104), montbretol
(106), và abieta-8,11,13-trien-7β-ol (107) [33] Năm 2011 từ lá và thân của loài C
fortune, Zhang và cộng sự đã tách được một hợp chất mới là
20(105)-abeo-4,5-seco-5(10),6,8,11,13-abietapentaene-3-one (109) và 6 hợp chất abietane diterpenoid đã biết gồm: 12-hydroxyabieta-6,8,11,13-tetraen-3-on (110), hinokiol (111), abietatrien-3β-ol (112), 11,12-dihydroxy-8,11,13-abietatrien-3,7-dione (113), 11-hydroxy-12-
methoxyabieta-8,11,13-trien-3,7-dione (114) và 3β, 8,11,13-trien-7-one (115) [34]
11-dihydroxy-12-methoxyabieta-Các hợp chất tropone thuộc nhóm chất norditerpene (C19), đại diện cho một lớp
chất nhỏ thuộc chi Cephalotaxus Cấu trúc đã được xác định gồm một bộ khung
tropone chức năng oxi hóa như một lacton và một vòng tetrahydrofuran hoặc ancol
Năm 1978, Buta báo cáo đã cô lập được một terpenoid mới từ hạt loài C haringtonine
có tên harringtonolide (116) [35] Vài năm sau trong một báo cáo cấu trúc của hợp chất tropon mới là hainanolidol (117) cũng đã được xác định [36] Trong cấu trúc của hợp chất 10-Hydroxyhainanolidol (118) có thêm một nhóm hydroxyl (-OH) trên C-10 so
với hợp chất (117) đã được mô tả bởi Yoon từ loài C koreana [37]
Trang 31Hình 1.9 Các hợp chất diterpenoid và norditerpen phân lập từ một số loài thuộc chi
Cephalotaxus
Loài nghiên cứu: Năm 1979 từ dịch chiết chloroform của thân và rễ
Richard G Powell và cộng sự đã phân lập được 3 hợp chất là cephalomannine (119) , baccatine III (120) và taxol (121) [38] Đồng thời với việc xác định cấu trúc các
chất này cũng được nghiên cứu về hoạt tính gây độc tế bào Kết quả cho thấy hợp
chất cephalomannine (119) khả năng ức chế sự phát triển của tế bào ung thư biểu
mô KB [38] Tuy nhiên đến nay ở Việt Nam loài này chưa được nghiên cứu về
thành phần hóa học và hoạt tính sinh học Vì vậy việc nghiên cứu loài Đỉnh tùng (C
Trang 32mannii) nói chung là rất cần thiết với triển vọng tìm được các hợp chất có cấu trúc
mới và hoạt tính sinh học cao góp phần nâng cao giá trị của loài cây này ở Tây Nguyên, Việt Nam
Hình 1.10 Cấu trúc của một số hợp chất phân lập từ loài C mannii
Chi Dacrydium là một chi tương đối lớn gồm 21 loài, thành phần hóa học
của một số loài trong chi này chủ yếu được xác định bằng phương pháp GC/MS tinh dầu của lá cho thấy sự xuất hiện của lớp chất sesquiterpen, diterpenoid Các nghiên cứu về thành phần hóa học và hoạt tính sinh học của các loài trong chi
Dacrydium còn hạn chế Do đó cần sự quan tâm của các nhà nghiên cứu đối với
thành phần hóa học của các loài trong chi này
Trong một nghiên cứu nhằm tìm ra các tiền chất để thiết kế thuốc chống virút gây bệnh sốt xuất huyết (DV-NS5 RdRp) có nguồn gốc từ thiên nhiên, các nhà nghiên cứu đã
xác định được 9 hợp chất trong dịch chiết lá của loài D balansae bao gồm 4 hợp chất
biflavonoid đó là amentoflavone (122), podocarpusflavone A (123), isoginkgetine (124), hinokiflavone (125); 3 hợp chất sterol là 6-hydroxystigmast-4-en-3-one (126), 3-
hydroxystigmast-5-en-7-one (127), β-sitosterol (128) và 2 dẫn xuất của stilbene là 3,5,4′-trimethoxystilbene (129) và cis-3,5,4′-trimethoxystilbene (130) [39]
trans-Năm 1994, các nhà khoa học ở trường Đại học Otago, New Zealand đã công
bố phân lập từ lá của loài D.cupressium được một hợp chất sesquiterpene hiếm gặp
9-epi-β-caryophyllene (131) Cấu trúc của hợp chất đã được xác định bằng kĩ thuật
phổ 2D NMR [40]
Trang 33H H
O
H H
HO H
Hình 1.11 Các hợp chất từ một số loài thuộc chi Dacrydium
Loài nghiên cứu: Năm 1996 tác giả Trần Thu Hương đã phân tích tinh dầu
từ lá loài Hoàng đàn giả (D elatum) vùng Hữu Lũng, Lạng Sơn bằng phương pháp
GC/MS, kết quả cho thấy sự xuất hiện của các lớp chất sesquiterpen ở loài này [41] Khi nghiên cứu thành phần hóa học của các bộ phận thân và cành từ loài Hoàng đàn
giả (D elatum) ở Tây nguyên chúng tôi hi vọng sẽ tìm được các hợp chất có cấu
trúc lí thú và hoạt tính sinh học cao
Chi Nageia là một chi nhỏ chỉ gồm 5 loài [10] Cho đến nay trên thế giới và ở
Việt nam chưa có báo cáo nào về nghiên cứu về thành phần hóa học của các loài trong chi này
Loài nghiên cứu: Loài Kim giao núi đất (N wallichiana) đến nay vẫn chưa
Trang 34được nghiên cứu ở Việt nam và thế giới Việc nghiên cứu về thành phần hóa học
của loài này sẽ giúp các nhà nghiên cứu có dữ liệu ban đầu về chi Nageia
1.1.2.2 Hoạt tính sinh học
Hoạt tính sinh học nổi bật của các hợp chất trong thành phần chi Cephalotaxus
là hoạt tính gây độc tế bào Năm 1970, 1972 trong báo cáo của R.G.Powell và cộng
sự các hợp chất ester của cephalotaxine như là harringtonine (24), homoharringtonine (29), isoharringtonine (30) [42] và deoxyharringtonine (26) [43] thể hiện hoạt tính ức
chế tế bào bạch cầu P388 ở chuột Từ đó đến nay đã có nhiều công trình công bố về hoạt tính gây độc tế bào của các hợp chất trên có thể kể đến như: Hợp chất
isoharringtonine (30) phân lập từ loài C harringtonia có nguồn gốc ở các tỉnh phía
nam của Trung Quốc đã được quan tâm nghiên cứu về hoạt tính gây độc tế bào Năm
2008 bằng phương pháp thử nghiệm trên in vitro các nhà nghiên cứu Trung Quốc đã
kết luận hợp chất 30 thể hiện khả năng ức chế phosphatidylinositol 3-kinase / Akt-1
một chất cần thiết cho sự sống và phát triển của tế bào u tủy ở người [44] Trong một
nghiên cứu khác đã chỉ ra rằng hợp chất homoharringtonine (29) có hiệu quả trong
điều trị bệnh bạch cầu tủy xương cấp tính (AML), bệnh bạch cầu tủy bào mãn tính (CML) và hội chứng rối loạn nhịp myeline (MDS) Cơ chế tác động chính của hợp
chất 29 là ức chế tổng hợp protein theo liều và thời gian bằng cách tác động lên
ribosome của tế bào ung thư Nó ngăn chặn sự tiến triển của tế bào từ pha G1 vào
pha S và từ pha G2 vào pha M [45] Hai hợp chất 24 và 30 là hai alkaloid được
phân lập từ vỏ cây thường xanh C hainanensis Li vào những năm 70, sau đó hai
hợp chất này đã thu hút sự quan tâm của các nhà nghiên cứu bởi hoạt tính sinh học cao của chúng Năm 1994 các nhà nghiên cứu Trung Quốc đã công bố kết quả nghiên cứu về khả năng ức chế hoạt động của tế bào ung thư bạch cầu ở người (HL-60) Các thí nghiệm chứng minh rằng tại nồng độ 2.10-7 mol.L-1 đối với chất 24 và
10-7mol.L-1 đối với chất 30 có thể gây chết tế bào HL-60 khi các tế bào được tiếp
xúc với 2 chất trong 4 giờ [46] Mười ba hợp chất alkaloid cephalotaxus được phân
lập từ lá và cành của loài C lanceolata, một loài cây thuộc tỉnh Vân Nam, Trung
Quốc Tất cả các hợp chất được thử hoạt tính gây độc tế bào đối với 4 dòng tế bào
Trang 35ung thư là ung thư phổi A549 và SK-BR-3, ung thư biểu mô ruột HCT116, và ung
thư gan Hep G2, trong đó 2 hợp chất harringtonine (24), homoharringtonine (29)
thể hiện các hoạt tính đáng chú ý đối với cả 3 dòng tế bào là A549, HCT116 và Hep G2 với giá trị IC50 lần lượt là 0,15±0,07; 0,054±0,016; 0,38±0,09 μg / mL đối với
chất 24 và 0,085±0,018; 0,001±0.002; 0,087±0,024 μg / mL đối với chất 29 Đặc biệt đối với tế bào HCT116 hợp chất 29 thể hiện hoạt chất kháng tế bào ung thư
mạnh hơn 85 lần so với chất đối chứng doxorubicin (DOX) 0,085±0,008[18]
Kết quả nghiên cứu hoạt tính gây độc tế bào của 16 hợp chất alkaloid được
phân lập từ lá của loài C harringtonia var nana đối với 2 dòng tế bào bạch cầu (L1210) ở chuột và tế bào ung thư biểu mô miệng (KB) ở người (Bảng 1.5) So
sánh kết quả thử hoạt tính với cấu trúc hóa học của các chất cho kết luận: các hợp
chất alkaloid có cấu trúc kèm theo chuỗi bên gồm (57, 58, 32, 33, 34, 35, 24, 38, 26,
30) cho hoạt tính gây độc tế bào mạnh hơn các chất không có chuỗi bên trong phân
tử (52, 15, 1, 2, 59, 60) [20]
Bảng 1.5 Bảng giá trị IC50 thử hoạt tính gây độc tế bào đối với 2 dòng tế bào L1210 và
KB của các alkaloid phân lập từ lá của loài C harringtonia var nana [15] [20]
Trang 36Bằng phương pháp thử nghiệm trên in vitro: các alkaloid cephaltaxine 43, 44,
45 thể hiện khả năng chống lại tế bào bạch cầu ở chuột P388 với giá trị IC50 lần lượt
là 0,38; 0,33; 0,17 µg / mL [23] Các hợp chất dimer alkaloid (46-51) thể hiện hoạt
tính yếu chống lại dòng tế bào bạch cầu ở chuột L1210 với giá trị IC50 1,9-3,7 µg /
mL [24] Trong một nghiên cứu khác về hoạt tính sinh học của các hợp chất phân lập
từ dịch chiết chloroform lá và gỗ của loài C wilsoniana bằng phương pháp MTT, kết
quả cho thấy hợp chất C-3-epi-wilsonione (69) có hoạt tính trung bình đối với 3 dòng
tế bào thư nghiệm là tế bào ung thư gan ở người Hep G2 và Hep 3B, ung thư vú MCF-7 và ung thư tuyến giáp ở nam giới HT-29 với giá trị IC50 lần lượt là 52,0; 42,0; 52,0 và 24,4 µg / mL [26] Năm 1979 trong một nghiên cứu nhằm tìm ra chất chống ung thư có nguồn gốc thiên nhiên các nhà khoa học đã cô lập được alkaloid
mới là cephalomannine (119), chất này thể hiện hoạt tính chống tế bào ung thư biểu
mô miệng ở người KB với giá trị LD50 = 3,8.10-3,8 μg / mL và khả năng ức chế tế bào bạch cầu PS ở chuột [38] Năm 2003 Jossang và cộng sự đã cô lập được các hợp chất
cephalotaxine N-oxit (16-18), các chất này thể hiện hoạt tính yếu chống lại tế bào ung
thư biểu mô ở người với giá trị IC50 lần lượt là 30; 14; 31µg / mL [17] Trong một
nghiên cứu khác các hợp chất 26, 37, 38, 39 thể hiện hoạt tính mạnh trong ức chế sự
phát triển của tế bào ung thư bạch cầu ở chuột P-388 với giá trị IC50 lần lượt là 0,0075; 0,027; 0,056 và 0,024μg / mL [23]
Bên cạnh các alkaloid thì hoạt tính sinh học của các hợp chất khác như flavone,
diterpenoid…của chi Cephalotaxus cũng được nghiên cứu Năm 2000 từ dịch chiết
ethanol loài C wilsoniana đã cô lập được hợp chất Taiwanhomoflavone-A (82), chất
này thể hiện hoạt tính chống tế bào ung thư biểu mô vòm họng, tế bào ung thư ruột kết COLO-205, tế bào ung thư gan Hepa-3B và tế bào ung thư cổ tử cung Hela với giá trị
ED50 lần lượt là 3,4; 1,0; 2,0; 2,5 µg / mL [32] Taiwanhomoflavone-B (95) cũng được
cô lập từ loài trên có hoạt tính chống tế bào ung thư biểu mô ở miệng KB và tế bào ung thư gan Hep 3B với giá trị ED50 lần lượt là 3,8; 3,5 µg / mL [47]
Harringtonolide (116) thể hiện hoạt tính sinh học đa dạng cả tính chất chống
ung thư và hoạt động kháng vi-rút, hoạt động ức chế sự phát triển của tế bào ung thư biểu mô phổi: Lewis, Walker, Sarcoma-180, L-1210, L-615, ức chế tế bào bạch cầu ở
Trang 37chuột P-388 [48] Nghiên cứu in vitro cho thấy 116 có thể kháng lại loại cúm A, viêm
não Nhật Bản B và virut vaccinia [49]
1.2 Ứng dụng kĩ thuật phân tích ISSR và SSR trong nghiên cứu đa dạng di truyền ở thực vật
Nguồn gốc tính đa dạng sinh học ở sinh vật nằm ở thứ tự nucleotide trên các phân tử DNA làm nên bộ máy di truyền của chúng Việc phân tích đa đạng di truyền của
vi sinh vật nói chung và thực vật nói riêng bằng các kĩ thuật sinh học phân tử có ý nghĩa thiết thực cho việc bảo vệ nguồn gen và chọn giống Bảo tồn nguồn gen trong thực vật là bảo tồn các đa dạng di truyền cần thiết cho các loài phục vụ cho công tác cải tạo giống
Ngày nay với sự phát triển mạnh mẽ của công nghệ sinh học hiện đại, nhiều loại chỉ thị phân tử đã được sử dụng để đánh giá đa dạng di truyền làm cơ sở cho nghiên cứu bảo tồn và tái tạo nguồn gen ở đối tượng sinh vật nói chung và ở các loài cây lá kim nói riêng Trong các loại chỉ thị thì chỉ thị ISSR (Inter Sequence Simple Repeat) và SSR (Sequence Simple Repeat) đang được ứng dụng rộng rãi và
có hiệu quả trong việc đánh giá đa dạng di truyền ở cả mức độ quần thể và loài
1.2.1 Kỹ thuật ISSR ( Inter Simple Sequence Repeat )
Kỹ thuật do Zietkiewicz và cộng sự phát hiện năm 1994 [50] Trong cấu trúc hệ gen của sinh vật nhân thật tồn tại một loại các trình tự nucleotide lặp lại, chúng thường đặc trưng cho loài Trình tự này gồm từ 2 đến 5 nucleotide lặp lại nhiều lần, ví dụ: (AT)n, (AG)n, (AGTC)n và nằm rải rác trong hệ genome của thực vật bậc cao Kỹ thuật ISSR thường tạo ra một dấu vân tay di truyền tương tự kỹ thuật AFLP-PCR, nhưng lại chỉ sử dụng các mồi đơn (có độ dài từ 19 nucleotide đến 25 nucleotide) Khoảng cách giữa các trình tự lặp khác nhau làm cho các phân đoạn DNA được nhân có độ dài ngắn khác nhau
và đặc trưng cho mỗi cá thể Vì thế, các mồi ISSR có một tiềm năng lớn để xác định mối quan hệ loài và mức độ đa dạng đi truyền nguồn gen [51]
1.2.2 Kỹ thuật SSR (Simple Sequence Repeat)
Kỹ thuật SSR hay microsaterlite (vi vệ tinh) là kỹ thuật nghiên cứu dựa trên trình tự lặp các đoạn đơn giản trên gen của sinh vật, đây là những trình tự ngắn (từ 2 đến 6 cặp bazơ, ví dụ (AT)n; (AG)n; (AGTC)n) có thứ tự lặp lại liên tiếp dao động từ
Trang 382 đến 40 đơn vị Các trình tự lặp đơn giản rất phổ biến ở hệ gen động vật và thực vật, mật độ các trình tự dao động rất lớn, phân bố trong hệ gen và có tính đặc trưng cho từng loài [52] Kỹ thuật này dựa trên nguyên lý phản ứng chuỗi PCR với mục tiêu đầu tiên là nhận dạng các trình tự lặp lại đơn giản Sau khi các trình tự lặp lại đơn giản này được nhận dạng, bước tiếp theo là xác định trình tự của DNA ở hai đầu của các đoạn lặp lại và thiết kế mồi Các trình tự gần kề và các trình tự lặp lại sẽ tạo nên SSR Vì vậy SSR là công cụ hữu hiệu trong nghiên cứu đa dạng di truyền nguồn gen
cũng như lập bản đồ hệ gen ở sinh vật
Mồi
Phân tử
Trang 39nhiều đối tượng khác nhau Tuy nhiên các nghiên cứu trên một số loài thuộc 3 chi
Cephalotaxus, Dacrydium, Neagia còn rất ít, mới chỉ tập trung ở một số quốc gia
như Trung Quốc, Hàn Quốc và trên đối tượng chủ yếu là các loài trong chi
Cephalotaxus Chẳng hạn, năm 2008 Yingang và cộng sự đã đánh giá tính đa dạng nguồn gen di truyền của loài C fortune ở Trung Quốc bằng chỉ thị ISSR Kết quả cho thấy quần thể C fortune nghiên cứu có tính đa dạng di truyền cao, tổng mức độ
thay đổi phân tử giữa các quần thể là 25,9% và giữa các cá thể trong quần thể là 74,1% Thông qua kết quả nghiên cứu nhóm tác giả cũng chỉ ra chính các yếu tố như kích thước và sự phân mảnh quần thể, quá trình di nhập gen bị hạn chế đã dẫn đến sự khác biệt di truyền đáng kể giữa các quần thể (25,9%) [54]
Pan và cộng sự (2011) đã phát triển được 13 chỉ thị SSR đặc hiệu cho loài C oliveri ở Trung Quốc Trên cơ sở đó nhóm tác giả đã nghiên cứu sâu hơn về hệ
thống giao phối, di truyền quần thể và các ảnh hưởng di truyền của sự phân mảnh môi trường sống của loài Các kết quả thu được rất hữu ích cho các nhà nghiên cứu trong hoạch định chiến lược bảo tồn hiệu quả cho loài nguy cấp này Các chỉ thị
SSR đã được thiết kế cho loài C oliveri cũng được ứng dụng trong đánh giá đa dạng di truyền quần thể loài C fortunei và nhiều loài khác trong chi Cephalotaxus
cũng đã chỉ ra tính hiệu quả của các chỉ thị [55] Tương tự, năm 2012 nhóm tác giả Miao và cộng sự cũng đã phát triển thêm được 15 chỉ thị SSR đa hình đặc hiệu cho
loài C oliveri Các chỉ thị SSR này cũng có thể ứng dụng trong đánh giá đa dạng di truyền quần thể các loài khác trong chi Cephalotaxus [56]
Năm 2016 Wang và cộng sự đã ứng dụng chỉ thị ISSR để đánh giá mức độ
biến đổi di truyền của 22 quần thể C oliveri, có nguy cơ tuyệt chủng ở Trung Quốc
C oliveri là loài có môi trường sống bị ảnh hưởng sâu sắc bởi các yếu tố khí hậu như nhiệt độ và lượng mưa Kết quả đã xác định được 14 locus trong 22 quần thể C oliveri, trong đó có 5 locus có liên quan đến yếu tố nhiệt độ và lượng mưa Bằng
cách tìm ra những locus thích ứng với môi trường, các tác giả đã xác định được mối liên hệ giữa biến đổi khí hậu với các locus thích nghi Kết quả nghiên cứu cũng phần nào giúp chúng ta hiểu được sự ứng phó của loài là kim với biến đổi khí hậu
từ đó có những chiến lược cụ thể để quản lý và bảo tồn loài [57]
Trang 40Đối với chi Dacrydium, các nghiên cứu chủ yếu trên loài D pectinatum năm
2010, Su và cộng sự đã sử dụng chỉ thị ISSR để đánh giá mức đa dạng di truyền của
17 quần thể D pectinatum trên đảo Hải Nam, Trung Quốc Kết quả nghiên cứu cho
thấy mức độ thay đổi phân tử tương đối cao bêntrong quần thể và thấp giữa các quần thể Các đặc điểm sinh thái và lịch sử môi trường sống đóng vai trò quan trọng trong việc hình thành cấu trúc di truyền và sự khác biệt di truyền giữa các quần thể Các kết quả của nhóm nghiên cứu đã góp phần cải thiện công tác quản lý để phục
hồi loài D Pectinatum [58]
Hay như nhóm tác giả Huang và cộng sự (2014) đã phát triển được 15 chỉ thị
SSR cho loài D pectinatum, là loài duy nhất trong chi Dacrydium ở Trung Quốc,
trong đó có 12 chỉ thị chỉ ra tính đa hình Thông qua các kết quả phân tích các tác giả cũng đã tìm thấy sự mất cân bằng liên kết và mức sai lệch đáng kể so với cân bằng
Hardy-Weinberg trong quần thể D pectinatum Các kết quả thu được giúp chúng ta
hiểu biết toàn diện về các yếu tố thúc đẩy quá trình tiến hoá của quần thể và sự thích ứng của loài tại địa phương, điều này cũng góp phần quản lý và bảo tồn loài một cách hiệu quả [59]
Tuy nhiên đối với các loài thuộc chi Nageia, trên thế giới và Việt Nam hầu
như chưa có một nghiên cứu phân tử nào để đánh giá mức đa dạng nguồn gen di truyền của các loài trong chi
Quá trình tổng quan tài liệu chúng tôi nhận thấy các loài cây lá kim có vai trò quan trọng trong đời sống và nghiên cứu Các lớp chất có hoạt tính sinh học cao
được tìm thấy trong các loài thuộc chi Cephalotaxus như alkaloid, flavonoid,
diterpenoid…trong khi ở Việt Nam thành phần hoá học và hoạt tính sinh học của
loài Đỉnh tùng (C mannii) chưa được nghiên cứu Loài Kim giao núi đất (N wallichiana) chưa được nghiên cứu trên thế giới và Việt Nam Hoàng đàn giả (D elatum) mới chỉ nghiên cứu thành phần hóa học qua phân tích GS / MS tinh dầu của
lá Mặt khác những nghiên cứu về đa dạng nguồn gen di truyền có vai trò rất quan trọng trong công tác bảo tồn đối với các loài cây lá kim đang bị đe dọa tuyệt chủng
Vì vậy, nghiên cứu thành phần hóa học, hoạt tính sinh học và đa dạng nguồn gen di truyền của 3 loài lá kim là Đỉnh tùng, Hoàng đàn giả và Kim giao núi đất ở Tây