Nghiên cứu đặc điểm gen H5 và N1 của virus cúm A H5N1 phân lập tại Việt Nam để tạo nguồn nguyên liệu sản xuất vaccine thế hệ mới

ii LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan: Đây là công trình nghiên cứu do tôi thực hiện và một số kết quả cùng cộng tác với các cộng sự khác.. Các số liệu và kết quả trình bày trong luận án là

Trang 1

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO

ĐẠI HỌC THÁI NGUYÊN CÔNG NGHỆ

VIỆN CÔNG NGHỆ SINH HỌC

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO

ĐẠI HỌC THÁI NGUYÊN

CÔNG NGHỆ SINH HỌC

Trang 4

ii

LỜI CAM ĐOAN

Tôi xin cam đoan:

Đây là công trình nghiên cứu do tôi thực hiện và một số kết quả cùng cộng tác với các cộng sự khác

Các số liệu và kết quả trình bày trong luận án là trung thực, một phần đã được công bố trên các tạp chí khoa học chuyên ngành với sự đồng ý và cho phép của các đồng tác giả

Phần còn lại chưa được ai công bố trong bất kỳ công trình nào khác

Ngày tháng năm 2012

Tác giả

Nguyễn Thị Bích Nga

Trang 5

vi vii viii

1.1.2 Đặc điểm tiến hóa tạo nên các phân dòng có độc lực cao của virus

1.1.4 Biến đổi thành phần gen hemagglutinin (HA) tạo nên các nhóm

kháng nguyên (clade) của virus cúm A/H5N1

9

1.2 ĐẶC ĐIỂM CẤU TRÚC VIRUS CÚM A 11

1.3 CẤU TRÖC, CHỨC NĂNG CỦA HEMAGGLUTININ VÀ

NEURAMINIDASE

15

Trang 6

v

1.6.4.2 Triệu chứng bệnh cúm gia cầm ở người 29

Trang 7

v

TRONG VECTOR TÁCH DÒNG

3.1.3 Giải trình tự và phân tích thành phần amino acid của HA (H5) so

sánh về thành phần nucleotide và amino acid với các chuỗi đăng ký

trong Ngân hàng gen

54

3.1.4 Phân tích vị trí điểm cắt protease, bám dính thụ thể, epitope và

glycosyl hoá của polypeptide H5 trên cơ sở trình tự amino acid suy

diễn

65

3.1.6 Phân tích mối quan hệ phả hệ và nguồn gốc giữa các chủng của Việt

Nam và thế giới

69

XUẤT HIỆN MỚI TẠI VIỆT NAM

73

3.2.2 Kết quả sự hình thành phân nhóm kháng nguyên mới của clade 2.3.2

và 2.3.4

76

VIRUS CÚM A/H5N1 TRONG VECTOR TÁCH DÒNG

79

3.3.3.1 Phân tích thành phần nucleotide gen N1 83

3.3.3.2 Phân tích thành phần amino aicd gen N1 85

3.3.5 Phân tích mối quan hệ phả hệ gen N1 của các chủng virus cúm

A/H5N1 giai đoạn 1996 - 2011

92

DANH SÁCH CÁC BÀI BÁO LIÊN QUAN ĐẾN LUẬN ÁN ĐÃ CÔNG BỐ 114

PHỤ LỤC

Trang 8

vi

DANH MỤC CÁC KÝ HIỆU, CÁC CHỮ VIẾT TẮT

Ký hiệu Tiếng Anh Tiếng Việt

Reaction

Phản ứng trùng hợp chuỗi PCR ngược

Trang 9

vi

Trang 10

ix

DANH MỤC CÁC BẢNG

Trang

Bảng 1.1 Thống kê số lượng người bị nhiễm và chết do cúm gia cầm qua

Bảng 2.5 Thành phần phản ứng và chu trình nhiệt giải trình tự 47

Bảng 3.1 Danh sách các chủng virus cúm A/H5N1 của Việt Nam và thế

giới sử dụng chuỗi H5 trong phân tích so sánh thành phần gen và mối quan hệ nguồn gốc phả hệ

54

Bảng 3.2 Các vị trí nucleotide sai khác trong chuỗi H5 giữa các chủng so

sánh

56

Bảng 3.3 Kết quả tổng hợp phát hiện 41 vị trí sai khác amino acid của

chuỗi H5 so sánh ở 32 chủng phân lập tại Việt Nam từ năm 2004

- 2011

64

Bảng 3.4 Các vị trí amino acid quan trọng trong chuỗi polypeptide H5 65

Bảng 3.5 Tỷ lệ (%) tương đồng về nuleotide (trên đường chéo) và amino

acid (dưới đường chéo) của gen H5

68

Bảng 3.6 Kết quả thống kê 14 chủng virus cúm AH5N1 được xác định gen

H5 và các nhóm kháng nguyên giai đoạn 2004 – 2011 trong nghiên cứu

78

Bảng 3.7 Danh sách các chủng cúm A/H5N1 thu thập qua các năm

2004-2011 đã giải trình tự và cung cấp chuỗi gen N1 sử dụng để so sánh nucleotide và amino acid

83

Bảng 3.8 Kết quả thống kê 14 chủng virus cúm A/H5N1 giai đoạn

2004-2011 đã được giải trình tự và đăng ký gen N1

97

Trang 11

data error !!! can't not

read

Trang 12

read

Trang 13

read

Trang 14

read

Trang 15

read

Trang 17

read

Trang 18

read

Trang 19

read

Trang 20

read

Trang 21

read

Trang 22

read

Trang 23

read

Trang 24

read

Trang 26

read

Trang 27

read

Định dạng
Số trang	27
Dung lượng	542,23 KB