Tài liệu chia sẻ tại: wWw.SinhHoc.edu.vn TRƯỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC KHOA KHOA HỌC SỰ SỐNG ĐỀ TÀI SINH VIÊN NGHIÊN CỨU KHOA HỌC PHÂN LẬP GEN LTP Ở HAI GIỐNG ĐẬU XANH CÓ KHẢ NĂNG CHỊU HẠ
Trang 1Tài liệu chia sẻ tại: wWw.SinhHoc.edu.vn TRƯỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC
KHOA KHOA HỌC SỰ SỐNG
ĐỀ TÀI SINH VIÊN NGHIÊN CỨU KHOA HỌC
PHÂN LẬP GEN LTP Ở HAI GIỐNG ĐẬU XANH
CÓ KHẢ NĂNG CHỊU HẠN KHÁC NHAU
Sinh viên thực hiện: Nguyễn Thị Lệ
Người hướng dẫn khoa học: TS Nguyễn Vũ Thanh Thanh
Thái Nguyên, tháng 5 năm 2012
Trang 2Tài liệu chia sẻ tại: wWw.SinhHoc.edu.vn
NỘI DUNG BÁO CÁO
1 MỞ ĐẦU
2 VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU
3 KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN
4 KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ
Trang 3Tài liệu chia sẻ tại: wWw.SinhHoc.edu.vn
M Đ U Ở Ầ
1.1 ĐẶT VẤN ĐỀ
- Đậu xanh (Vigna radiata (L.) Wilczek): kinh tế và dinh
dưỡng
- Cải tạo đất
xanh
của cây đậu xanh là vấn đề cần thiết
- Các nghiên cứu đều thống nhất rằng đặc tính chịu hạn của cây trồng rất phức tạp do nhiều gen quy định, trong
đó có gen LTP (Lipid Transfer Protein)
Trang 4Tài liệu chia sẻ tại: wWw.SinhHoc.edu.vn M Đ U M Đ U Ở Ầ Ở Ầ
- LTP tham gia vào quá trình sinh tổng hợp biểu bì ở thực vật giúp hạn chế sự mất nước trong điều kiện khô hạn
- Gen LTP điều khiển và tổng hợp nên protein tương ứng tham gia xúc tác sự vận chuyển phospholipid giữa các lớp màng tế bào, hỗ trợ việc tạo ra các lớp sáp hoặc lớp biểu bì giúp cây hạn chế mất nước
- Nhằm xác định chỉ thị phân tử liên quan đến khả năng chịu hạn ở gen LTP nên chúng tôi tiến hành đề tài
“Phân lập gen LTP ở hai giống đậu xanh có khả năng chịu hạn khác nhau”.
Trang 5Tài liệu chia sẻ tại: wWw.SinhHoc.edu.vn MỞ ĐẦU
1.2 MỤC TIÊU NGHIÊN CỨU
- Phân lập gen LTP ở hai giống đậu xanh địa phương có
khả chịu hạn khác nhau từ genome
1.3 NỘI DUNG NGHIÊN CỨU
- Tách DNA tổng số từ lá non của hai giống đậu xanh TS (Tân Sơn) và BK (Bắc Kạn)
- Khuếch đại gen LTP bằng phản ứng PCR với cặp mồi đặc hiệu
- Tách plasmid tái tổ hợp mang gen LTP ở hai giống đậu xanh TS và BK
Trang 6Tài liệu chia sẻ tại: wWw.SinhHoc.edu.vn 2 VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU
2.1 VẬT LIỆU NGHIÊN CỨU
Kạn (BK)
Hình 2.1 Hình ảnh hai giống đậu xanh TS va BK
Trang 7Tài liệu chia sẻ tại: wWw.SinhHoc.edu.vn 2 VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN
CỨU
2.2 PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU
2.2.1 Phương pháp tách DNA trực tiếp từ lá non đậu
xanh (theo Gawel và Jarret, 1991)
2.2.2 Khuếch đại gen LTP đặc hiệu bằng phản ứng PCR (theo Mullis và cs, 1985)
Bảng 2.1 Trình tự cặp mồi khuếch đại gen LTP
Gen Cặp mồi Trình tự mồi Kích thước sản
phẩm PCR (bp)
LTP LTP – F
LTP – R
ATGGCTAGCCTGAATGTTGC TTACTTGATGTTAGCGCAGTT
350
Trang 8Tài liệu chia sẻ tại: wWw.SinhHoc.edu.vn 2 VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN
CỨU
STT Thành phần Thể tích (µl)
9 Tổng thể tích 25
Bảng 2.2 Thành phần phản ứng PCR
2.2 PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU
Trang 9
Tài liệu chia sẻ tại: wWw.SinhHoc.edu.vn 2 VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN
CỨU
Các bước Nhiệt độ Thời gian Số chu kỳ Tác dụng
52 0 C
72 0 C
30 giây
1 phút
1 phút
30
Biến tính
Gắn mồi
Tổng hợp chuỗi
Bảng 2.3 Chu trình nhiệt phản ứng PCR
2.2 PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU
Trang 10Tài liệu chia sẻ tại: wWw.SinhHoc.edu.vn 2 VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN
CỨU
2.2 PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU
2.2.3 Thôi gel bằng bộ kit của hãng Bioneer
2.2.4 Tách dòng gen LTP
Quy trình tách dòng gen được thực hiện như sau:
Gắn gen LTP vào vector tạo dòng pBT
Biến nạp vector tái tổ hợp vào tế bào khả biến chủng E.coli DH5α
Kiểm tra sản phẩm chọn dòng bằng phản ứng PCR
Hình 2.2 Sơ đồ tách dòng gen LTP ở đậu xanh
Trang 11Tài liệu chia sẻ tại: wWw.SinhHoc.edu.vn 2 VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN
CỨU
2.2 PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU
STT Thành phần Thể tích (µl)
Tổng thể tích 20,0 Bảng 2.4 Thành phần phản ứng gắn gen vào vector tách dòng pBT
Lai ở 220C trong 1,5 giờ tạo vector tái tổ hợp
Trang 12Tài liệu chia sẻ tại: wWw.SinhHoc.edu.vn 2 VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN
CỨU
- Biến nạp vector tái tổ hợp vào tế bào khả biến chủng
đúng 1 phút
- Nuôi khuẩn: Chọn khuẩn lạc có màu trắng nuôi trong
môi trường LB lỏng, có bổ sung ampicilin, qua đêm
Kiểm tra sản phẩm chọn dòng
2.2.5 Tách plasmid tái tổ hợp bằng bộ kít của hãng
Bioneer
Trang 13Tài liệu chia sẻ tại: wWw.SinhHoc.edu.vn 3 KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN
3.1 KẾT QUẢ TÁCH DNA TRỰC TIẾP TỪ LÁ NON ĐẬU XANH
1.TS, 2 BK
Hình 3.1 Hình ảnh điện di DNA tổng số của hai giống đậu xanh TS và BK
Trang 14Tài liệu chia sẻ tại: wWw.SinhHoc.edu.vn 3 KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN
3.2 KẾT QUẢ KHUẾCH ĐẠI GEN LTP BẰNG PHẢN ỨNG PCR
←350 bp
Hình 3.2 Hình ảnh điện di sản phẩm PCR nhân gen LTP của hai giống
đậu xanh TS và BK
M Marker 1kb; 1 TS; 2 BK
Trang 15Tài liệu chia sẻ tại: wWw.SinhHoc.edu.vn 3 KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN
3.3 KẾT QUẢ TINH SẠCH SẢN PHẨM PCR
← 350 bp
Hình 3.3 Hình ảnh điện di kết quả thôi gel của hai giống đậu xanh TS và BK
Marker 1kb; 1 TS; 2 BK
Trang 16Tài liệu chia sẻ tại: wWw.SinhHoc.edu.vn 3 KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN
3.4 KẾT QUẢ TÁCH DÒNG GEN LTP Ở ĐẬU XANH
← 350 bp
Hình 3.4 Hình ảnh điện di kết quả tách dòng gen LTP của hai giống
đậu xanh TS và BK
Marker 1kb; 1.TS; 2 BK
Trang 17Tài liệu chia sẻ tại: wWw.SinhHoc.edu.vn 3 KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN
3.5 KẾT QUẢ TÁCH PLASMID TÁI TỔ HỢP
Hình 3.5 Hình ảnh điện di plasmid tái tổ hợp mang gen LTP
ở hai giống đậu xanh TS và BK
1 TS, 2 BK
Trang 18Tài liệu chia sẻ tại: wWw.SinhHoc.edu.vn 4 KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ
4.1 KẾT LUẬN
- Đã tách chiết thành công DNA tổng số từ lá non của hai giống đậu xan TS và BK
- Khuếch đại thành công gen LTP ở hai giống đậu xanh
TS và BK bằng phản PCR với kích thước khoảng 350 bp
- Chọn được dòng vi khuẩn E.coli DH5α mang vector
tái tổ hợp (pBT –LTP) và tách được plasmid mang
đoạn gen LTP ở hai giống đậu xanh TS và BK
Trang 19
Tài liệu chia sẻ tại: wWw.SinhHoc.edu.vn
4 KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ
4.2 KIẾN NGHỊ
Xác định trình tự gen LTP của các giống đậu xanh đã
tách dòng để tìm kiếm chỉ thị phân tử liên quan đến tính
chịu hạn của cây đậu xanh nhằm phục vụ công tác chọn
tạo giống đậu xanh chống chịu tốt
Trang 20Tài liệu chia sẻ tại: wWw.SinhHoc.edu.vn