Quản trị tri thức, khai phá dữ liệu và khai phá văn bản trong tin học y tế

Quản trị tri thức, khai phá dữ liệu và khai phá văn bản trong tin học y tế... Định nghĩa Knowledge management is the system and managerial approach to the gathering, management, use, an

Quản trị tri thức, khai phá dữ liệu và khai phá

văn bản trong tin học y tế

Định nghĩa

 Knowledge management is the system and managerial approach to the gathering, management, use, analysis, sharing, and discovery

of knowledge in an organization or a community in order to

maximize performance (Chen,2001)

 Hệ quản trị tri thức là một hệ thống và cách tiếp cận quản trị giúp thu thập, quản trị, sử dụng, phân tích, chia sẽ và khám phá tri thức trong một tổ chức hoặc một cộng đồng nhằm đặt hiệu quả tối đa

Định nghĩa

 Tri thức

 Học máy / máy học (Machine learning) "the study of computer

algorithms that improve automatically through experience.“

Mitchell (1997)

Học máy

 Học có giám sát (Supervised Learning)

› Có tập dữ liệu học (training corpus)

 Học không giám sát (Unsupervised Learning)

› Không có tập dữ liệu học

Các cách tiếp cận

 Mơ hình xác suất thống kê

› Nạve Bayes

› SVM (Support Vector Machine)

 Học ký hiệu và suy diễn dựa trên luật

› Cây quyết định (Decision Tree)

 Mạng Neuron (Neuron Network)

 Giải thuật di truyền (Genetic algorithm)

 Học phân tích và logic mờ

Khai thác dữ liệu

 Ứng dụng cho việc khai thác các cơ sở dữ liệu về Gen

 Dự đoán cấu trúc Protein

 Drug Interaction

Khai thác văn bản

 Ứng dụng cho việc khai thác bệnh án điện tử hay tài liệu y khoa

› Gán nhãn dữ liệu (Annotation)

› Xác định các thực thể có tên (Named Entity Recognization – NER)

› Phân lớp (Classification), lap chi muc (indexing)

 NLP xử lý EHR

› Lập chỉ mục hoặc phân nhóm báo cáo

› Rút trích, cấu trúc hóa, mã hóa thông tin

› Tóm tắt bệnh án

› Cải thiện giao diện các hệ thống EHR

Examples

Ứng dụng trong tin học y tế

 Ontologies: An ontology is a specification of conceptualization It

describes the concepts and relationships that can exist and

formalizes the terminology in a domain (Gruninger and Lee, 2002)

› SNOMED

› MeSH

› UMLS

› Gen Ontology (GO) …

Ứng dụng trong tin học y tế

 Quản trị tri thức

› Hổ trợ ra quyết định

 MYCIN ( 1976)

 HELP (1980)

› Tài liệu y khoa

 PubMed service của MEDLINE

 Telemakus

 MARVIN (Medical Search Engine)

› Truy xuất các cơ sở dữ liệu không đồng nhất

Tài liệu tham khảo

 MEDICAL INFORMATICS

Knowledge Management and Data Mining in Biomedicine

Spinger-2005

Chapter 2