Giải trình tự bộ gene gấu tiền sử từ kỷ Pleistocene pdf

Giải trình tự bộ gene gấu tiền sử từ kỷ Pleistocene Sơ đồ tách DNA cổ đại và tạo thư viện... Mặc dù DNA bộ gene chứa đựng nhiều thông tin hơn, các nghiên cứu DNA cổ đại chỉ dừng lại ở

Giải trình tự bộ

gene gấu tiền sử từ

kỷ Pleistocene

Sơ đồ tách DNA cổ đại

và tạo thư viện

Mặc dù DNA bộ gene chứa đựng nhiều thông tin hơn, các nghiên cứu DNA cổ đại chỉ

dừng lại ở mức độ khuếch đại

trình tự ty thể Tuy vậy, trong

công trình này, Noonan và cộng

sự đã thiết lập thư viện

metagenomic với DNA không

khuếch đại được, tách từ xương của hai con gấu tiền sử đã tuyệt chủng cách đây 40.000 năm

DNA cổ đại

và tạo thư

viện

Phân tích xấp xỉ 1Mb trình tự từ

mỗi thư viện cho thấy mặc dù bị

lẫn nhiều trình tự từ vi khuẩn, 5,8

và 1,1% các dòng chứa đoạn gắn

(insert), thu được 26.861 bp trình tự

của bộ gene gấu tiền sử

Tiếp đó các tác giả so sánh trình tự của gấu tiền sử và gấu hiện đại Kết quả cho thấy mối quan hệ tiến hóa của các loài này

Cách tiếp cận metagenomic sử

dụng trong nghiên cứu này củng cố thêm tính khả thi của các chương trình giải trình tự DNA bộ gene của sinh vật cổ đại

Genomic sequencing of

Pleistocene cave bears

Noonan JP, Hofreiter M, Smith D, Priest JR, Rohland N, Rabeder G,

Krause J, Detter JC, Paabo S,

Rubin EM

Science 2005 Jul

22;309(5734):597-9

Sau đây là đánh giá về nghiên cứu này tại F1000 ngày 16-9-2005

F1000 Factor 6.0

Barbara Trask

University of Washington, United States of America

CELL BIOLOGY

Bài báo này một lần nữa cho thấy vai trò to lớn của “metagenomics”, trong đó toàn bộ trình tự bộ gene

trong môi trường (từ mỏ khai thác axit cho đến biển Sargasso) được tách dòng mà không cần định danh trước vào một thư viện Sau đó

chọn dòng ngẫu nhiên từ thư viện này để giải trình tự Trong nghiên cứu này, các tác giả sử dụng kỹ

thuật kể trên để thu nhận trình tự DNA tách từ răng gấu tiền sử Mặc

dù vẫn bị lấn DNA vi khuẩn và

người hiện đại, họ vẫn phân tích

được các trình tự của các loài đã tuyệt chủng từ 40.000 năm trước Công trình này mở ra khả năng thu nhận thông tin trình tự DNA từ các loài đã tuyệt chủng khác