Cẩm nang sâu bệnh hại cây trồng, quyển 1: cây lương thực, cây thực phẩm, cây hoa cảnh.. Khóa luận tốt nghiệp Kỹ Sư Nông Học, Đại học Nông Lâm, Tp.HCM.. Biological and molecular characte
Trang 1PHẦN VI TÀI LIỆU THAM KH ẢO
Tài liệu trong nước
1 Nguyễn Ngọc Bích, 2003 Bước đầu nghiên cứu một số virus chính trên vùng thuốc lá tỉnh Tây Ninh Luận văn thạc sỹ khoa Nông Học, Đại học Nông Lâm, Tp.HCM Việt
Nam
2 Phạm Văn Biên, Bùi Cách Tuyến, Nguyễn Mạnh Chinh, 2003 Cẩm nang sâu bệnh hại cây trồng, quyển 1: cây lương thực, cây thực phẩm, cây hoa cảnh Nhà xuất bản nông nghiệp
3 Bùi Chí Bửu , Nguyễn Thị Lang, 1999 Di truyền phân tử Nhà xuất bản nông nghiệp
4 Trần Thị Thu Hà, 2005 Điều tra bệnh ne ngọn trên cây thuốc lá (Nicotiana tabacum L.) trong vườn nhân cây con tại tỉnh Tây Ninh Khóa luận tốt nghiệp Kỹ Sư Nông Học,
Đại học Nông Lâm, Tp.HCM Việt Nam
5 Vũ Triệu Mân, 2003 Chẩn đoán nhanh bệnh hại thực vật Nhà xuất bản nông nghiệp
6 http:// ww.quanđoinhandan.Org.vn, 26/9/2004
Tài liệu nước ngoài
7 Antigus Y., Lapidot M., N Ganaim, Cohen J., Lachman O., Pearlsman M., Raccah B and Gera.A., 1997 Biological and molecular characterization of tomato spotted wilt virus
in Israel Phytoparasitaca 25:4, pp 319- 330
8 Armando de Menezes Neto, 2005 TMV – Tobacco Mosaic Virus
9 Chase T, J., Schmidt E., Perry T., K The structure of cucumber mosaic virus and comparison to Cowpea chlorotic mottle virus J Virol 74pp 7578
10 Cho J.J., Custer D.M., Brommonschenkel S.H., Tanksley S.D Conventional breeding: host-plant resistance and the use of molecular markers to develop resistance to tomato spot wilt virus in vegetables
Trang 212 Deutsche Samnlung von Milkoorganlsmen und Zellkultur en GmbH, 2002
Catalogue of ELISA Reagents
13 Parrella G., Gognalons P., et al An update of the host range of tomato spotted wilt
virus Journal of plant pathology (2003), 85, issue 4, pp 227 – 264
14 John Hu, University of Hawaii,1995 Control of Tomato Spotted Wilt Virus Using Transgenic Plants that ProduceVirus-Specific Monoclonal Antibodies
15 Jones J.B., John Paul Jones, Compendiume of tomato disease, APS press
16 Pottorff L.P and Newman S.E., 2003 Greenhouse plant virus (TSWV/INSV) Gardening series disease No.2.947
17 Momol et al, 2002 Management of Tomato Spotted Wilt Tospovirus (TSWV) on tomatoes with UV-reflective mulch and Acibenzolar-S-methyl
18 Soellick T.R, Uhrig J F., Bucher G L., Kellmann J.W , and Schreier P H.PNAS
The movement protein NSm of Tomato Spotted Wilt Tospovirus (TSWV): RNA binding, interaction with the TSWV N protein, and identification of interacting plant proteins
19 Tom Kucharek, Larry Brown, Fred Johnson and Joe Funderburk, 11/1990 Tomato
Spotted Wilt Virus Of Agronomic, Vegatable And Ornamental Crop Plant phthology fact sheet, circ-914
20 AVRDC – the World vegatable center, 2004 Cucumber Mosaic Virus Tomato Disorders Fact sheet AVRDC – the World vegatable center Publication 4-608
21 Disease Notes Plant Disease, Vol.85.No.10
22 Statewide IPM Program, Agriculture and Natural Resources, University of California,
Diseases Agriculture and Natural Resources ,R M Davis, UC ANR Publication 3470
23 The American Phytopathological Society, 8/2004 Plant disease Vol.88, No.8
24 Vegetable press newsletter, Department of plant and soil science, 1997
25 http://www.ext.colostate.edu/pubs/garden/02947.html
Trang 326 http://www.aspnet.org/pd/subscriberContent/2004/0608-01R.pdf
27 http://plantpath.ifas.ufl.edu/takextpub/fact
28 http://web.uk.ask.com/redir?u=http%3a%2f%2ftm.uk.ask.com
29 http://www.usda.gov/nass.National Agricultural Statistical Service, USDA
30 http://ipmofalaska.com Technical bulletin: greenhouse crop management series POBox875006 Wasilla, Alaska 99687-5006
Trang 4THÀNH PHẦN CÁC DUNG DỊCH TRONG PHẢN ỨNG ELISA
Buffer chiết X1(TSWV, TMV) PBS x 20 (Phosphate buffered Saline), 20% PVP
(Polyvinylpyrrolidone), pH 7.4, Tween 1%, NaN3_<1g/l
Buffer chiết cho CMV 10% PBS Tween-PVP, pH 7.4, citrate 0.5M,
Thioglycolic acid 0.1%, Triton100 0.1%
Buffer load mẫu X1 (pH9.6) NaHCO3, Na2CO3, NaN3_<1g/l
Buffer conjugateX1 (pH 7.3) PBS Tween, BSA, NaN3_<1g/l
Buffer Substract X1 (pH 9.8) Diethanolamine, NaN3_<1g/l
Buffer rửa (pH 7.4) PBS x 20, Tween 1%, NaN3_<1g/l
Trang 5PHỤ LỤC 2 THÀNH PHẦN TRONG KIT TỔNG HỢP cDNA ISCRIPT TM
iScript reverse transcriptase là enzyme RNAse H+, có độ nhạy cao hơn enzyme RNAse H- iScript reverse transcriptase là reverse transcriptase có nguồn gốc từ M-MLV (dòng Moloney từ Murine Leukemia virus) Enzyme đƣợc trộn chung với chất ức chế RNAse
5x iScript Reation Mix đƣợc trộn với primer hexamer ngẫu nhiên và oligo T (dT)
Sự pha trộn này đƣợc tối ƣu hóa cho những trình tự đích nhỏ hơn 1kb
Trang 6THÀNH PHẦN CÁC HÓA CHẤT TRONG PHẢN ỨNG PCR
Thành phần trong phản ứng PCR Thành phần và nồng độ ban đầu
iTaq DNA polymerase iTaq DNA polymerase, 5 U/µl
10x iTaq buffer 10X PCR buffer, 200mM Tris-HCl, pH
8.4, 500mM KCl
Trang 7PHỤ LỤC 4 HÌNH CHỤP CÁC ĐĨA CHỨA MẪU PHÂN TÍCH BẰNG ELISA
Hình mẫu đƣợc test CMV.
Trang 8PHIẾU ĐIỀU TRA
Mã số:
Nơi lấy mẫu :
Chủ hộ :
Giống cây :
Tuổi cây :
Tình trạng vườn :
Cách trồng : theo hàng/liếp
Phương pháp trồng :gieo hạt trực tiếp/ươm cây con
Trồng : một hàng/hai hàng
Diện tích :
Năng suất :
Độ thuần : thuần/trồng xen
Có vectơ truyền bệnh không :
Vụ trước trồng gì :
Mùa vụ :
Bệnh có thường xảy ra không : mấy lần/trên
Loại đất :
Triệu chứng :
Trang 9PHỤ LỤC 6 DANH SÁCH CÁC TRÌNH TỰ TƯƠNG ĐỒNG VỚI TMV DÕNG TRUNG QUỐC DÙNG ĐỂ THIẾT KẾ PRIMER
Alignments
>gi|62124|emb|V01408.1|TOTMV4 Tobacco mosaic virus genome (variant 1) Length=6395
Score = 7394 bits (3730), Expect = 0.0
Identities = 3730/3730 (100%), Gaps = 0/3730 (0%)
Strand=Plus/Plus
>gi|5713134|gb|AF165190.1|AF165190 Tobacco mosaic virus complete genome
Length=6395
Score = 7220 bits (3642), Expect = 0.0
Identities = 3708/3730 (99%), Gaps = 0/3730 (0%)
Strand=Plus/Plus
>gi|4218527|emb|AJ011933.1|TMV11933 Tobacco mosaic virus genes encoding 126,
183, 30 kDa proteins
and coat protein
Length=6395
Score = 7214 bits (3639), Expect = 0.0
Identities = 3710/3731 (99%), Gaps = 2/3731 (0%)
Strand=Plus/Plus
>gi|62043|emb|X68110.1|TMVCG Tobacco mosaic virus, complete genome
Length=6395
Score = 7188 bits (3626), Expect = 0.0
Identities = 3704/3730 (99%), Gaps = 0/3730 (0%)
Strand=Plus/Plus
>gi|62125|emb|V01409.1|TOTMV5 Tobacco mosaic virus genome (variant 2)
Length=6398
Score = 7133 bits (3598), Expect = 0.0
Identities = 3691/3722 (99%), Gaps = 0/3722 (0%)
Trang 10>gi|8886896|gb|AF273221.1|AF273221 Tobacco mosaic virus 126 kDa protein, 183 kDa protein, 54 kDa
protein, movement protein, and coat protein genes, complete
cds
Length=6395
Score = 7111 bits (3587), Expect = 0.0
Identities = 3697/3731 (99%), Gaps = 2/3731 (0%)
Strand=Plus/Plus
>gi|1321645|dbj|D78608.1|MTV180KP Tobacco mosaic virus gene for 180K protein Length=4851
Score = 7099 bits (3581), Expect = 0.0
Identities = 3682/3713 (99%), Gaps = 2/3713 (0%)
Strand=Plus/Plus
>gi|15149321|gb|AF395129.1|AF395129 Tobacco mosaic virus isolate TMV-152, complete genome
Length=6395
Score = 6770 bits (3415), Expect = 0.0
Identities = 3654/3731 (97%), Gaps = 2/3731 (0%)
Strand=Plus/Plus
>gi|15149313|gb|AF395127.1|AF395127 Tobacco mosaic virus isolate Fujian, complete genome
Length=6395
Score = 6746 bits (3403), Expect = 0.0
Identities = 3651/3731 (97%), Gaps = 2/3731 (0%)
Strand=Plus/Plus
>gi|15149317|gb|AF395128.1|AF395128 Tobacco mosaic virus isolate TMV-017, complete genome
Length=6395
Score = 6738 bits (3399), Expect = 0.0
Identities = 3650/3731 (97%), Gaps = 2/3731 (0%)
Strand=Plus/Plus
Trang 11>gi|1619995|dbj|D63809.1| Tabacco mosaic virus genomic RNA for 130K protein, 180K protein,
30K protein and coat protein, complete sequence
Length=6395
Score = 5564 bits (2807), Expect = 0.0
Identities = 3502/3731 (93%), Gaps = 2/3731 (0%)
Strand=Plus/Plus
>gi|50234597|gb|AY596920.1| Tobacco mosaic virus strain Egyptian helicase-like gene, partial
sequence
Length=838
Score = 904 bits (456), Expect = 0.0
Identities = 730/780 (93%), Gaps = 35/780 (4%)
Strand=Plus/Plus
>gi|62041|emb|X66047.1|TMV54KDA Tobacco Mosaic Virus RNA for 54 kDa protein
Length=1566
Score = 811 bits (409), Expect = 0.0
Identities = 409/409 (100%), Gaps = 0/409 (0%)
Strand=Plus/Plus
>gi|45685348|gb|AY566703.1| Tobacco mosaic virus replicase mRNA, partial cds
Length=958
Score = 692 bits (349), Expect = 0.0
Identities = 352/353 (99%), Gaps = 0/353 (0%)
Strand=Plus/Plus
>gi|1806556|emb|Z84397.1|TOBZ84397 Tobacco mosaic virus (strain h1a) RNA fragment
Length=339
Score = 648 bits (327), Expect = 0.0
Identities = 336/339 (99%), Gaps = 0/339 (0%)
Strand=Plus/Plus
>gi|1806557|emb|Z84398.1|TOBZ84398 Tobacco mosaic virus (strain H20a) RNA fragment
Length=339
Trang 12Identities = 331/335 (98%), Gaps = 0/335 (0%)
Strand=Plus/Plus
>gi|1806555|emb|Z84396.1|TOBZ84396 Tobacco mosaic virus (strain H17) RNA fragment
Length=339
Score = 632 bits (319), Expect = 2e-177
Identities = 334/339 (98%), Gaps = 0/339 (0%)
Strand=Plus/Plus
>gi|1806558|emb|Z84399.1|TOBZ84399 Tobacco mosaic virus (strain H23) RNA fragment
Length=339
Score = 640 bits (323), Expect = 7e-180
Identities = 335/339 (98%), Gaps = 0/339 (0%)
Strand=Plus/Plus
>gi|1894801|emb|Z92965.1|TMVZ92965 Tobacco mosaic virus (strain H20a) RNA fragment
Length=339
Score = 632 bits (319), Expect = 2e-177
Identities = 331/335 (98%), Gaps = 0/335 (0%)
Strand=Plus/Plus
>gi|1806559|emb|Z84400.1|TOBZ84400 Tobacco mosaic virus (strain H4a) RNA fragment
Length=336
Score = 620 bits (313), Expect = 7e-174
Identities = 333/339 (98%), Gaps = 3/339 (0%)
Strand=Plus/Plus
>>gi|62128|emb|X02144.1|TOTMV8 Tobacco mosaic virus tomato strain (L) genome Length=6384
Score = 599 bits (302), Expect = 2e-167
Identities = 680/806 (84%), Gaps = 0/806 (0%)
Strand=Plus/Plus
